1930年,霑化縣剛家村王吉遷此立村,人稱王吉屋子。後因村南有一土台子,故取名北台子村至今。
1958年,全國普遍建立人民公社。同年10月,霑化縣在今河口境內建立郭局等4個人民公社,北台子村屬於東華公社。1968年5月,北台子村劃歸新戶公社。
北台子村黨支部帶領民眾認真貫徹落實黨在農村的一系列方針政策。1980年至1982年,推行“家庭聯產承包責任制”。1983年,全村土地承包到戶,結束了“生產靠隊長指揮、社員憑工分吃飯”的歷史,實現了土地所有權和經營權的分離,確立了農民自主經營的主體地位,調動了農民的生產積極性,促進了農村經濟的快速發展,人民生活逐步改善,村容村貌不斷改觀。
1984年,河口區成立後,該村劃歸河口區新戶鄉管轄。1999年開始,實行延長土地承包期三十年不變的政策。該村充分發揮棉花種植優勢,大力發展棉花種植,民眾收入有了較大提高,人均純收入由1984年的137元增加到2006年的4800元。