化學生物學與分子工程教育部重點實驗室，是集山西大學生物技術研究所和分子科學研究所的科研力量，於2003年7月18日通過國家教育部科技司組織專家論證，經“教育部教技函 [2004]4 號檔案”正式批准建設的教育部重點實驗室。
化學生物學是一門新興的前沿交叉學科，它是運用化學的理論、方法、手段和研究策略，去認識、研究和解決生物學複雜系統中的問題，並由此推進生命科學研究的發展；同時也利用生物科學的原理、方法、技術以及物理學、信息學等相關學科的新進展、新成果來解決化學中的一些難點、熱點問題，促進化學和生命科學向更深層次發展，帶動自然科學更多的交叉、滲透與融合。
實驗室擁有一個博士後流動站（無機化學），二個博士點（無機化學、生物化學與分子生物學），二個省級重點學科（無機化學、生物化學與分子生物學）以及三個碩士點（無機化學、生物化學與分子生物學、微生物學）。
“化學生物學與分子工程教育部重點實驗室” 現有教職工46名，其中教授16人、副教授8人、講師助教18人。其中具有博士學位者23人，40歲以下的占56%。60%以上的學術帶頭人和學術骨幹有在國外學習、進修的經歷。本實驗室研究隊伍結構合理、年富力強、富有活力。
現實驗室主要在生物活性小分子與大分子的互作、生物活性分子與細胞的相互作用及所引起的功能變化、生命狀態的化學反應模擬和機理研究等 三個方向上開展研究。
主要研究方向：
A. 細胞分子生物學
B. 基因工程
C. 功能化合物作用的分子機理
D. 代謝工程與微生物製藥
E. 結構與理論化學
F. 中草藥
