劉國慶[內蒙古科技大學教授、碩士生導師]

劉國慶，男，1983年10月生，內蒙古通遼市人，博士，教授，碩士研究生導師。數理與生物工程學院生物技術系教師，從事生物信息學，表觀遺傳學領域教學和研究。

工作簡歷

劉國慶[內蒙古科技大學教授、碩士生導師]

2015.3-2016.3 The University of Georgia, Computational System Biology Lab, visiting scholar

2009.7-至今內蒙古科技大學數理與生物工程學院

2004.9-2009.7 內蒙古大學物理科學與技術學院，生物物理專業，碩士/博士

2000.9-2004.7 內蒙古師範大學，物理系，本科

研究方向

從事生物信息學、表觀遺傳學領域的研究。主要研究內容包括減數分裂同源染色體的重組機制（meiotic recombination)，假基因演化規律（pseudogene evolution)、以及染色體結構相關的研究，例如原核染色體包裝機制（chromosome packing）、真核染色質組裝機制（如nucleosome positioning）。

承擔的科研項目

1.國家自然科學基金，減數分裂重組的位置偏好性及其相關問題的理論研究（61102162），2012.1-2014.12 (主持人)

2.內蒙古自治區高等學校科學研究項目，減數分裂重組與DNA迴文結構的內在聯繫（NJ10098），2010.6-2012.6(主持人)

3.內蒙古科技大學創新基金，染色體重組與基因組進化的相關性（2009NC005），2010.3-2013.3 (主持人)

4.內蒙古大學創新基金，染色體重組對基因組進化的影響，2008.7-2009.7 (主持人)

5.國家自然科學基金，基於基因組序列和結構的核小體定位的理論和實驗研究（61072129），2011.1-2013.1（參加人）

6.內蒙古科技大學創新基金，酵母組蛋白組合修飾的貝葉斯網路分析(2009NC064)，2010.3-2012.3 (參加人)

7.校級教改項目，套用物理專業《理論力學》教學改革（JY2011065）,2012-2013

代表性論著

期刊論文

1.Guoqing Liu*, Fen Feng, Xiujuan Zhao, Lu Cai*. Nucleosomeorganization around pseudogenes in the human genome. BioMed ResearchInternational, 2015:821596

2.Guoqing Liu*, Yongqiang Xing, Lu Cai*. Using weighted featuresto predict recombination hotspots in Saccharomyce scerevisiae. Journal of TheoreticalBiology, 2015: 382:15–22

3.BingjieZhang,Guoqing Liu*.Predicting recombination hotspots in yeast based on DNA sequence andchromatin structure. Curr Bioinformatics, 2014, 9(1):28-33 (SCI,IF:2.04)

4.GuoqingLiu,Jia Liu, Bingjie Zhang. Compositional bias is a major determinant of thedistribution pattern and abundance of palindromes in Drosophila melanogaster. JMol Evol, 2012, 72:130-140(SCI, IF: 3.23)

5.WangJian-Ying, Wang Jingyan,Liu Guoqing*. Calculation of nucleosomalDNA deformation energy: its implication for nucleosome positioning. ChromosomeResearch, 2012, 20(7): 889-902 (SCI)

6.Guoqing Liu,Jia Liu, Xiangjun Cui, Lu Cai. Sequence-dependentprediction of recombination hotspots in Saccharomyces cerevisiae. J Theor Biol,2012, 293: 49-54 (SCI, IF:2.32)

7.Guoqing Liu,Hong Li, Lu Cai. Processed pseudogenes are locatedpreferentially in regions of low recombination rates in the human genome.J Evol Biol, 2010, 23(5):1107-1115 (SCI, IF:3.47)

8.Guoqing Liu, Hong Li. The correlation betweenrecombination rate and dinucleotide bias inDrosophila melanogaster.Journal of Molecular Evolution, 2008, 67(4):358-367 (SCI, IF: 3.23)

9.劉國慶，白音寶力高，邢永強.假基因研究進展.生物化學與生物物理進展，2010，37(11):1165-1174 (SCI)

10.劉國慶，羅遼復.人類基因組信息量的擴增速率受重組的影響.生物化學與生物物理進展，2012, 39：368-377 (SCI)

11.Yong-qiangXing,Guo-qing Liu, Xiu-juan Zhao, et al.Genome-wide characterization andprediction of Arabidopsis thaliana replication origins. BioSystems 124 (2014)1–6.

12.Hong Li,Guoqing Liu, XuhuaXia. Correlations between recombination rate and intron distributions alongchromosomes ofC. elegans.Progressin Natural Science, 2009, 19(4): 517-522.(SCI)

13.Jia Liu,Guo-QingLiu, Xiao-Hong Du.The effect of impurities in a three-qubit Ising spin Model.International Journal of Theoretical Physics,2012,51(4):1509-1517 (SCI)

14.XingYong-qiang,Liu Guo-qing, Zhao Xiu-juan, Cai Lu*.An analysis and prediction ofnucleosome positioning based on information content. Chromosome Res, 2013,21(1):63-74(SCI)

15.Xiang-JunCui, Hong Li,Guo-Qing Liu.Combinatorial patterns of histonemodifications in Saccharomyces.cerevisiae, Yeast, 2011, 28: 683-691 (SCI)

16.TonglagaBao, Hong Li, Xiaoqing Zhao,Guoqing Liu. Predicting nucleosomebinding motif set and analyzing their distributions flanking functional sitesof human genes. Chromosome Research, 2012, 20: 685-698 (SCI, IF:3.08)

17.劉國慶.果蠅基因組中迴文結構的非均勻分布.內蒙古大學學報（自然科學版），2013，44(2):165-170

18.劉紅梅，劉國慶*.基於k-mer組分信息的系統發生樹構建方法，生物信息學，2013，11(2):100-104

19.劉國慶，李宏.人類基因組中減數分裂重組對二核苷偏好性的影響.科學通報，2009，54(4)：448-456.

20.張冰潔，劉國慶*.基於多信息融合的酵母重組冷熱點預測.科學通報，2014，59:953-959

21.劉國慶，李宏.人類基因組中加工假基因分布與重組率和基因密度的關係.生物物理學報，2008，24(5)：371-378.

22.劉國慶，李宏，王芳平，應智強.人類核糖體蛋白加工假基因在進化中的熵變.內蒙古大學學報（自然科學版），2007，38(6)：647-653.

23.劉國慶，李宏，趙朝霞.人類加工假基因演化過程中的兩種信息流.生物信息學，2009，7(3)：207-211.

24.王芳平，李宏，劉國慶，李瑞芳.密碼對的偏愛與基因組進化的相關性分析.生物信息學，2009，7：150-154.

25.李瑞芳，李宏，劉國慶，王芳平.愛滋病病毒全序列迴文結構的研究.內蒙古大學學報（自然科學版），2008，39(1)：40-44.

26.王芳平，李宏，王志堅，劉國慶.厭氧性粘菌基因組中密碼對的使用.生物信息學，2010, 8: 258-262.

27.劉國慶，包通拉嘎，邢永強，李宏，蔡祿.果蠅基因組中迴文序列的分布.生物物理學報,2011, 27(7):563-572

28.楊林源，李 宏，趙小慶，劉國慶.基於編碼序列、基因間序列和胺基酸序列構建的系統發生關係比較,生物物理學報,2012,28:157-168

29.齊磊，劉國慶.人類轉錄假基因序列鹼基片段的分析研究.集寧師範學院學報, 2012, 4:105-110

30.劉國慶，劉佳，牛金燕.工科院校套用物理專業《理論力學》教學改革的思考.科技創新導報,2011,36:170-171.

31.牛金艷，李永峰，劉國慶，董玉和.工科院校大學物理中近代物理部分教學嘗試.科技視界，2013, 14:24

32.邢永強，趙宏宇，劉國慶，趙秀娟，蔡祿.裂殖酵母複製起始位點的序列特徵分析和預測.生物物理學報，2014. 30 (6): 463-472

會議論文

33.Shou-HuiGuo, Li-Qin Xu, Wei Chen,Guo-Qing Liu, Hao Lin. Recombination spotsprediction using DNA physical properties in the Saccharomyces cerevisiae genome.AIP Conf Proc 2012, 1479:1556-1559, doi: 10.1063/1.4756460.

34.GuoqingLiu*, Yongqiang Xing, Lu Cai, Jianying Wang An energetic model for nucleosomepositioning.第一屆國際暨第十三次中國生物物理學術大會2013.10.28-11.1，南昌

35.GuoqingLiu,Jia Liu.Prediction ofrecombination rate in thehumangenome.IEEE, The International Conference on Consumer Electronics,Communications and Networks, CECNet 2012 - Proceedings, 1179-1182 (EI)

36.GuoqingLiu,Jia Liu.Recombination affects thedistribution of palindromes in yeast.The 6th InternationalConference on Bioinformatics and Biomedical Engineering, iCBBE 2012,Proceedings, 169-171

37.GuoqingLiu, HongLi. The effect of recombination rate on dinucleotide bias inDrosophilamelanogaster.第三屆全國生物信息學與系統生物學學術大會論文集, 2008，65-66.武漢

38.GuoqingLiu,Liaofu Luo. Growing of the information quantity of genome and recombination.The 4thChinese Conference on Bioinformatics & Systems Biology.2010.102.

39.劉國慶，劉佳. Compositionalbias is a major determinant of the distribution pattern of palindromes inDrosophila.第五屆全國生物信息學與系統生物學學術大會論文集, 2012:127

40.GuoqingLiu，Jia Liu，Lu Cai.Predicting Recombination HotspotsUsing Principle Composition Analysis Combined with Quadratic DiscriminantFunction,The 17th IUPAB International Biophysics Congress,2011,40

41.張冰潔，劉國慶. Predicting recombinationhotspots in yeast based on DNA sequence and chromatin strucutre.第五屆全國生物信息學與系統生物學學術大會論文集, 2012:190

42.劉國慶，李宏.人類基因組假基因分布與重組率的關係.首屆滬港粵生物物理學術會議論文集，2007，39-40.上海

43.劉國慶，包通拉嘎，邢永強，蔡祿，李宏.果蠅基因組的迴文序列分布.內蒙古自治區生物信息學研究生學術論壇論文集，2010,8.

44.劉國慶，李宏.果蠅基因組中迴文結構對重組率的影響.內蒙古大學首屆博士論壇論文集，2008, 129-130.呼和浩特

45.李敏,劉國慶,蔡祿.Disease-causing alternative splicing influences protein structure stability.第6屆全國生物信息學與系統生物學學術大會論文集,2014,10:P269

46.劉國慶,馮芬,趙秀娟,崔向軍,蔡祿.Nuclesome organization around pseudogenes in the humangenome.第6屆全國生物信息學與系統生物學學術大會論文集,2014,10:P273

47.馮芬，劉國慶. The heterogeneousdistribution of palindromes in the C.elegans genome.第6屆全國生物信息學與系統生物學學術大會論文集, 2014,10:P339

48.LiuGuoqing, Zhao Xiujuan, Cai Lu. Nucleosome organization around ENCODEpseudogenes. The 8th IUPAP International Conference on Biological Physics,2014, 6,18-22,中國北京

教材及著作

1.蔡祿，趙秀娟，劉國慶，崔向軍等.表觀遺傳學前沿，清華大學出版社，49.3萬字，2012

專題報告

1.報告題目：An energetic model fornucleosome positioning.第一屆國際暨第十三次中國生物物理學術大會，2013年10月28-31，南昌

2.報告題目：Meiotic recombination andprocessed pseudogene distribution.The 7th International Bioinformatics Workshop, 2009年6月19-21，蘇州

3.報告題目：人類基因組假基因分布與重組率的關係.首屆滬港粵生物物理學術會議，2007年11月22-25日，上海

獲獎及榮譽

2014年獲內蒙古自治區高等學校“青年科技英才支持計畫”科技骨幹榮譽稱號（NJYT-14-B10）

2013年獲第二屆“包頭市少數民族十大優秀青年”榮譽稱號

2013年被評為內蒙古科技大學科技工作先進個人

2012年獲包頭市“5512工程”學術技術帶頭人榮譽稱號

2009年12月獲“烏蘭夫獎學金”

2008年9月獲“光華獎學金”