優點
一．冷凍乾燥在低溫下進行，因此對於許多熱敏性的物質特別適用。如蛋白質、微生物之類不會發生變性或失去生物活力。因此在醫藥上得到廣泛地套用。
二．在低溫下乾燥時，物質中的一些揮發性成分損失很小，適合一些化學產品，藥品和食品乾燥。
三．在冷凍乾燥過程中，微生物的生長和酶的作用無法進行，因此能保持原來的性裝。
四．由於在凍結的狀態下進行乾燥，因此體積幾乎不變，保持了原來的結構，不會發生濃縮現象。
五．乾燥後的物質疏鬆多孔，呈海綿狀，加水後溶解迅速而完全，幾乎立即恢復原來的性狀。
六．由於乾燥在真空下進行，氧氣極少，因此一些易氧化的物質得到了保護。
七．乾燥能排除95-99%以上的水份，使乾燥後產品能長期保存而不致變質。
注意事項
1. 由於每一瓶子上邊放有一個塞子，雖然還留有通氣的缺口和小孔，但畢竟增加了水蒸汽的阻力，因此凍乾曲線需要作適當的變更，加熱需適當減慢，時間需適當增加。
2. 由於加塞的總力量較大，為了不使凍乾箱內的板層彎曲變形，每一層的產品必須放置均勻，不能偏在一方；如果因為產品少而放不滿時，空著的板層必須放置厚薄與瓶塞等高的木塊。
3. 加塞的力量不宜調的太大，當然也不能太小。對於活動板層的加壓方式由於每層是串聯的，即一層壓一層。因此總力與每一層的力是一樣的，只要計算一層所需的力就是加塞總力。每一層的力也就是每一瓶所需的力乘上該層上放置的瓶數。
