元素有機化學國家重點實驗室是在聶榮臻元帥和我國著名化學家楊石先教授的親切關懷下，由著名有機化學家陳茹玉院士和農藥化學家李正名院士等老一輩科學家創建。實驗室現有固定研究人員32人，其中中國科學院院士2人，中國工程院院士1人，國家傑出青年基金獲得者3人，教育部長江學者特聘教授4人，教育部跨世紀優秀人才1人，教育部新世紀優秀人才4人，博士生導師25人。實驗室學術委員由來自全國各科研單位的18位著名專家組成。
實驗室堅持國家重點實驗室“開放，流動，聯合，競爭”的運行機制。在國家有關部委的領導下，在依託單位南開大學的大力支持下，在科研隊伍建設和研究條件改善方面都有了很大的發展。科學研究方面也取得了豐碩的成果，目前已成為我國農藥學和有機化學研究的重要基地。重點實驗室承擔了大批國家重大基礎研究和國家重大科技攻關項目，培養了一批優秀科學家。基本實現了國家對重點實驗室成為“科研基地，人才基地，學術交流基地”的要求。在2001年國務院對全國高等學校重點學科進行的評估中，本重點實驗室的兩個支撐學科——有機化學和農藥學均排名全國第一。
元素有機化學國家重點實驗室以有機化學和農藥學兩個國家重點學科為支撐，研究有機化學新反應，新物質的合成及套用，套用化學方法研究生命體系中重要過程的本質；以新農藥創製研究為核心，研究農藥化學，農藥生物學的基礎理論問題並指導新型農藥分子的設計合成，運用多學科綜合開展新農藥創製的各個環節研究。
實驗室自建立以來認真貫徹執行“國家重點實驗室建設管理辦法”，確定了“以人才為本，以科學研究為核心”的工作思路。在科研工作、隊伍建設、對外開放、人才培養以及學術交流等各個方面都取得了顯著成績。先後在1990, 1992, 1995, 1999和2004年順利通過了國家計委和國家科技部組織的五次大評估。
