2005年底，在中華醫學會會長鍾南山的倡導和積極推動下，中華醫學會啟動和設立“中華醫學會臨床醫學科研專項資金”。 為了調動廣大醫生臨床科研的積極性，解決慢性呼吸道疾病防治工作中的問題，呼吸病學分會率先建立了臨床科研資金，首批科研基金由阿斯利康、葛蘭素史克、勃林格殷格翰藥業公司大力贊助共1400 萬元，用於慢性氣道疾病臨床防治科研(圖5)。呼吸病學分會在開展“慢性呼吸道疾病臨床科研專項資金”工作的過程中，嚴格遵照《中華醫學會臨床醫學科研專項資金管理辦法》的規定，立項、評審程式公開、公正、科學，管理措施規範、嚴格。 經過三審及終審會議，最後46項評為2007年度首批科研立項項目。由於資金投放重點放在基層慢性呼吸道疾病防治工作，深受廣大醫務人員讚譽，呼吸病學分會2008 年度的資金評審工作將繼續進行。
為了呼吸科醫生整體水平的提高，多年來呼吸病學分會根據學科的發展，制定和不斷修改相關學科的診斷和治療指南: 《支氣管哮喘防治指南》;《咳嗽的診斷與治療指南》(草案);《2006年版全球哮喘防治創議對中國哮喘防治工作的啟示》;《社區獲得性肺炎診斷和治療指南》;《肺真菌病診斷和治療專家共識》;《慢性阻塞性肺疾病診治指南》 修訂版;《肺血栓栓塞症-深靜脈血栓形成影像學檢查操作規程(推薦方案)》;《診斷性可彎曲支氣管鏡檢查指南》等。
受衛生部委託，由中華醫學會呼吸病學分會組織編寫了《臨床技術操作規範》(呼吸病學分冊)由《人民軍醫出版社》出版發行;《臨床診療指南》(呼吸病學分冊)由《人民衛生出版社》出版。
中華醫學會呼吸病學分會注重科普工作，每年組織“世界哮喘日”、“世界COPD日”、“世界睡眠日”等宣教活動，深受廣大民眾的歡迎。
中華醫學會呼吸病學分會成立近30年的歷史表明，呼吸病學分會秉承總會的辦會宗旨，認真落實、完成總會交辦的各項學術任務，對推動呼吸病學科學術發展作出了重大貢獻;呼吸病學分會多年致力於培養中青年學者，促進呼吸病學界的隊伍不斷充實、壯大，對學科發展產生了深遠影響。
