中熟偏早，生育期130天左右。出苗快而整齊，長勢強，株型適中，葉片中等，葉色深，莖葉多茸毛。結鈴性強，吐絮暢，鈴卵圓型，鈴重5.3克，衣分39.0%，早熟性好，霜前花率達98.3%。
中產量水平
在1997-1998年黃河流域麥套棉區試9個試點、6個參試品系中，中棉所39兩年平均皮棉產量和霜前皮棉產量分別為91.8公斤/畝和87.3公斤/畝，較對照中棉所17分別增產15.9%和27.3%，均具首位，增產達極顯著水平。
以各試點的霜前皮棉產量作為自變數環境指數的估測值，各品種在試點的產量水平為依變數，建立回歸方程，對品種的穩定性和適應性進行測定，結果表明，中棉所39在參試品種中適應性和穩產性均表現最好；以纖維品質、豐產性、早熟性、抗病性及出苗等15個性狀對參試品種進行綜合模糊評價，中棉所39綜合評價第一。
抗病蟲性
抗枯萎、耐黃萎病，枯萎病指9.9，黃萎病指30.3。高抗棉鈴蟲，田間抗蟲性鑑定，蟲口減退率60%，室內抗蟲性生物測定，校正死亡率為85%。
纖維品質
經農業部棉花品質監督檢驗測試中心測試，平均2.5%跨長28.9mm，比強度21.3cN/tex，麥克隆值3.8。
栽培技術要點
⑴適宜黃淮海棉區麥棉套作或黃河流域春播棉種植。
⑵合理密植，每公頃宜植3.75-4.5萬株。
⑶基肥要足，重施早施花鈴肥，打頂前施適量的蓋頂肥，後期根據長勢情況，追施葉面肥，以防早衰。
⑷適當套用生長調節劑進行系統化調，用量以少為宜。
⑸根據棉鈴蟲發生輕重，適當結合農藥防治，同時注意對紅蜘蛛、棉蚜等其它棉花害蟲的防治；防治四、五代棉鈴蟲要重於二、三代棉鈴蟲。
