建制沿革
中左所城明洪武二十年（1387年）江夏侯周德興，以三丁抽一為兵，防備倭寇，將永寧衛底下左、右、中、前、後千戶所里的中、左千戶所士兵調駐嘉禾嶼，設中左守御千戶所，於洪武二十一年（1388年）建置完成。至於城池則約為洪武二十七年（1394年）時建成。廈門城原周長1360米、高6米，基廣約2.9米，設4個城門、22個窩鋪。城門4座依次為東“啟明”門、西“懷音”門、南“洽德”門、北“潢樞”門。移永寧衛中、左千戶所官兵駐軍1240名戍防，廈門至此有“中左所”之稱，屬福建都指揮使司。與金門所城、高浦所城、以及永寧衛城、鎮海衛城互為犄角，鞏固了海防。
明永樂十五年（公元1417年），城牆增高為2.2丈(7米),四城還增設月城。明正統八年（公元1443年），加築敵樓四座。
景泰三年（1452年），原設於金門所的浯嶼水寨因為巡撫焦宏認為“孤懸海中”而遷到中左所，但仍用舊名，直到萬曆三十年（1602年）又因為距離崇武所太遠而遷到晉江石獅。萬曆二十年（1592年）福建南路參將移駐於此。
隆慶四年（1570年）設浯銅游兵，駐於中左所，有兵536人，由浯銅把總一員管轄，衛所又貼駕軍三百名，哨船二十艘。
南明永曆九年（1655年），鄭成功將中左所改為思明州，設定六官。
清康熙20年（1681年），清軍在與南朝鄭氏政權的對抗中將城摧毀，至康熙22年（1683年）收復台灣後開始由福建水師提督、靖海侯施琅重修重建，並將城牆周長擴至1920米，城牆增高至9.6米。康熙24年，舊的城牆被拆除重新擴建，城牆周圍長約2000米。清乾隆十七年（公元1752年），第二次重修，進行擴建。
鴉片戰爭時，英軍攻占廈門城，城垣遂逐漸廢。到20世紀初，其城牆仍依舊完好，內外城仍輪廓分明。直到1919年，由林爾嘉任會長的廈門市政會倡議開闢馬路，方便交通，廈門古城牆及附屬設施大部分被陸續拆除。廈門城僅存北面城牆一段，總長約80米，西北至東南走向，牆殘高2-7米，呈斜坡狀，頂寬3.5-6米。牆體兩側以花崗岩條石乾砌而成，中部以三合土填築。條石長1.4米，寬0.28米，高0.3米，以橫、縱相間的形式排列。
1961年廈門城遺址由廈門市政府公布為第一批市級文物保護單位；
1983年廈門市人民委員會重新公布為第一批市級文物保護單位；
1994年，在廈門建城600年之際，市政府撥款15萬元對古城牆進行維修，修復城牆64米，復建城垛28個，清理環境，立碑建亭，鋪造通路，並召開了“紀念廈門建城600周年大會”；
2003年8月，市文化局召開發布會，表示將在這段明古城牆基礎上建一個城址博物館；
2004年08月04日，廈門市文物管理委員會召開第二次擴大會議，會上決定廈門城遺址將申報全國重點文物保護單位、第六批省級文物保護單位。
2005年05月廈門城遺址被列入第六批福建省級文物保護單位。
歷史遺蹟
中左所城廈門城岩壁上，有清代福建水師提督楊歧珍題寫了“ 山環水活”四個大字，山環，指的是古城東面有玉屏山，北面有萬石岩，西面有狐尾山；而水活，則是向南面對著大海，時而碧波萬頃，時而驚濤拍岸。
在廈門城遺址，有兩處甘國寶的題字刻石，相距約10米。為乾隆二十六年（1761年）六月，甘國寶任福建全省水師提督時駐節廈門提字：
一為“ 瞻雲”二字，隸書橫刻，字徑0.5米；右側直題“乾隆辛巳荔月”；左下方直書“甘國寶題”，均楷書。康熙二十三年（1684年），首任福建水師提督施琅在“廈門城”內建提督署，署中有澄心堂、足觀堂、八風亭、方池、怪石諸勝。 瞻雲兩字意即此地居高可以瞻望風雲變幻。一說乃借《史記》稱讚帝舜“其仁如天，就之如日，望之如雲”之典，寓歌頌“康乾盛世”之義。
一為“ 曼倩偷”三字，刻在一塊狀似仙桃的岩石上，字徑0.4米；左側署“和庵”，行書。曼倩偷這個碑刻引用了東方朔偷桃的典故。東方朔（前154—前93年），字曼倩，西漢文學家，平原厭次（今山東惠民）人，武帝時為太中大夫。性詼諧滑稽，善辭賦，《答客難》為代表作。後代關於他的傳說很多，並將他編寫成仙人。神話中是太白金星的化身，王母娘娘的蟠桃三千年一結果，東方朔就曾偷了三次。
城牆最高點有寬闊平台1處，面積約100平方米，此為廈門城最高處，檯面上的高炮掩體設施為廈門解放初期駐軍所築造，用於架設高射炮，防備國民黨軍的飛機來轟炸。
建築
中左所城平面呈環形，初建時周長425丈（約1360米），高連女牆1丈9尺（約6米），開四門，依次為東啟明、西懷音、南洽德和北潢樞，設有窩鋪22個、城垛496個，營房987間，屯駐1240名士兵。牆體內部夯土，外皮以花崗岩條石“丁順”壘砌。永樂、正統和萬曆年間曾加修葺。清康熙二年（1663年）總督李率泰墮城，康熙二十四年（1685年）靖海侯施琅重建，周長擴為600丈（約1920米），乾隆十七年（1752年）再次重修。
1919年因市政建設城牆大部分被拆除，僅存北城門遺蹟和殘牆兩處，位於今廈門市公安局北側的出米岩山上，其中城北殘牆長120米，殘高1.5-4.5米，頂寬3.5米；東北殘牆長1.5米，高1.7米。牆上存有摩崖石刻“瞻雲”、“曼倩偸”（均為乾隆時甘國寶所題）和“山環水活”（光緒時楊岐珍所題）。1994年為紀念廈門建城600周年修復城牆64米並復建城垛。
城內的明代廟宇原有城隍廟、東嶽廟、真武廟等
