內容介紹
當黑暗已經離我們遠去，當大古不再變成光，當那句“所有的人類都可以憑藉自己的力量變成光。”已經成為告別黑暗的謝幕詞時，當有情人終成眷屬，當最後的一刻的留念成為永恆。人類似乎真的相信，和平時代已經來臨了……然而，就在迪迦奧特曼打敗黑暗的支配者，為人類奪得光明的兩年後，TPC國際和平組織的一項新的計畫，又在將世界推向一個新的黑暗中去……
不敗的勇者圖片這項計畫名為F計畫，目的在於利用迪迦之地殘留下的奧特曼的石像碎片，研究奧特曼的力量，使得這種力量為人類所使用。打擊一切外來侵略者。而就在正木敬吾事件之後，這項計畫又悄悄的開始進行了。露露耶的超古代遺蹟，是迪迦奧特曼與黑暗的支配者加坦傑厄最後決戰的戰場。同時又作為超古代遺蹟，被TPC作為F計畫的考察研究對象，而勝利隊的居間隊長也作為隨行研究人員之一，被派往遺蹟進行勘察，結果發現了黑暗界的三大巨人的石像（卡蜜拉、達拉姆和希特勒）。 但不幸的是，在探索過程中，調查小組由於過分追求奧特曼力量，這3個在3000萬年前被迪迦擊敗的三名邪惡巨人復甦了，而調查小組付出的代價是，除居間隊長外，無一生還。 達拉姆和希特勒放出了大量的邪惡魔鳥——佐加（幼體版）企圖使世界的天空再度蒙上黑暗的陰影。 此時，居間隊長的意志，使得在居間隊長體內的3000萬年前的地球警備團團長—幽憐的基因，甦醒了，她放出了類似於迪迦之地金字塔一樣的結界，擋住了佐加的去路。隨後又繼續沉睡過去了。 另一方面，與麗娜一起旅行結婚的大古，在遺蹟事件後，經常出現很離奇的夢和幻覺。先是夢見與麗娜的婚禮上所有的來賓都變成了卡蜜拉，再是邪惡巨人和無數佐加前來摧毀城市，而自己卻得到了一個黑色的神光棒，也只能變成黑暗迪迦。但回過神來，卻又什麼也沒發生，甚至因為在幻覺中說出卡蜜拉的名字而引起麗娜的不滿。（其實卡蜜拉是3000萬年前黑暗迪迦的戀人）
TPC本部內，勝利隊副組長宗方正在為居間會隊長替自己去遺蹟的事而感到內疚，而TPC高層則認為。此次調查任務的失敗，錯誤在於自身過分追求奧特曼的力量，為了確保世界能夠繼續和平。他們決定炸毀遺蹟。 但是，仍然堅信隊長不會死的宗方以及勝利隊隊員們，堅決反對炸毀遺蹟。此時，處於遺蹟最黑暗的地方的居間會隊長甦醒了，處於迷茫狀態的她，看見了超古代城市遺蹟……
大古和麗娜回到了TPC本部，隊員們為了不讓大古不再繼續戰鬥，而沒有告訴他居間隊長的事情。 為了保證隊長能夠平安歸來。勝利隊隊員們出發前往露露耶遺蹟拯救居間惠隊長，卻因為大量佐加幼鳥的攻擊鎩羽而歸。
當晚，大古為了了解黑暗迪迦的真相，就去了TPC的倉庫尋找幽憐的時光機器，但時光機器在播放完這一段黑暗迪迦與卡米拉、達拉姆和希特勒一起破壞世界的影象後就自毀了。就在這時，卡蜜拉、達拉姆和希特勒出現了，在攻擊大古之後卡蜜拉道出了真相。3000萬年前，4人在那時曾一同稱霸了世界，而迪迦則在幽憐的勸說之下放棄了黑暗並獲得了光的力量，將達拉姆的力量，希特勒的敏捷以及卡蜜拉的黑暗力量奪走並封印在了黑暗中邊（其實這些都是卡蜜拉使用的幻術）。現在，卡蜜拉、達拉姆和希特勒被困在結界中，他們以居間惠隊長來要挾大古重回黑暗，以便打破結界、重新稱霸世界。因為對黑暗迪迦余情未了，卡蜜拉將黑暗的神光棒交給大古，希望迪迦能夠回到從前的樣子並回到她的身邊。
昏迷中的大古看到了露露耶的超古代城市遺蹟，3000萬年前，奧特曼在擊倒了所有敵人之後，為了利益而開始了內戰，使超古代文明毀於一旦。幽憐告訴大古，在三大巨人復甦的同時，她放出了結界阻止他們，而結界的壽命為100年，如果大古重新拿起黑暗的力量，那么結界就會消失。
為救出居間隊長，也為了結這一段恩怨，大古孤身前往露露耶。在露露耶，大古又一次變成了黑暗迪迦，而且在變身時結界也被打破了，而且露露耶也爆發出了比加坦傑厄出現時更強的黑暗能量，佐加又一次使世界籠罩在黑暗的天空下。GUTS的亞格迪斯號在佐加的攻擊下逐漸不支，幸而未來的SUPER GUTS（凱秋、幸田、壽矢和公川良）前來支援才轉危為安。而且，居間隊長也依靠宗方指揮送給她的護身符拿到了掉在洞中的引爆器，消滅了所有的佐加。而迪迦為了人類未來的美好生活，分別與達拉姆，希特勒展開對決，重新得到了力量和敏捷並擊敗了達拉姆和希特勒。
不敗的勇者與卡蜜拉一戰時，卡蜜拉召喚出超古代的黑暗界並變成了最恐怖的超古代邪神迪莫傑厄。迪迦為了保護麗娜，終於倒下了。就在麗娜為大古的倒下而開始絕望時，奇蹟出現了。 長眠在超古代文明遺蹟的超古代戰士們，將自己的光芒給予了迪迦，迪迦奧特曼變成了閃耀的形態，最終打敗了
迪莫傑厄，而露露耶再一次沉入了海中。
一年後，大古和麗娜去了火星。不過在踏上旅途之前，有一個人向大古脫帽行禮，那人竟是——飛鳥信！
雖然是之後拍攝的作品但是卻將GUTS與SUPER GUTS的關係連貫起來。
在支援亞特迪斯號是響隊長說了一句；“我們還是訓練中的新兵”這也算是SUPER GUTS的“提前亮相”。
邪惡巨人
愛憎戰士-卡密拉卡蜜拉普通形態
3000萬年前迪迦的戀人，迪迦離開後成為黑暗三大巨人的首領。3000萬年前被迪迦奪走了黑暗力量並封印在露露耶。技能是黑暗神鞭，打在對手身上會使其發光，也可以變成黑暗魔劍。因為3000萬年前黑暗迪迦的背棄愛而生恨。是迪迦身上金色的來源。ps：情傷太重，智商下降。
卡蜜拉最終形態（迪莫傑厄）
卡蜜拉最強大的形態，是卡蜜拉融入了露露耶遺蹟中的超古代黑暗力量和加坦傑厄殘留的怨念誕生的終極邪神。迪莫傑厄是頭部浮現的上半身，足見屹立於天上所有黑暗全部都屬於迪莫傑厄的身體，此形態的力量毀滅地球是非常容易的。武器是從嘴裡噴射出的藍色光劍和光線，還有體外衍生出的觸角。周圍的黑暗可以無限擴大，逐漸變得強大。
達拉姆
遠古四大黑暗戰士之一，有超強的力量，無比的殺傷力和攻擊力，絕招是終級熾炎，爆炸力極強。是迪迦身上紅色的來源。3000萬年前被迪迦奪走了力量並封印在露露耶。
希特勒
遠古四大黑暗戰士之一，天生迅猛的速度和超快的敏捷力給了他無敵的力量。擁有一雙剛硬的神爪，讓他更加強大。絕招是精神烈風，破壞力極強。是迪迦身上紫色的來源。3000萬年前被迪迦奪走了敏捷並封印在露露耶。
黑暗迪迦（暗黑迪迦）
三千萬年前迪迦最初的姿態，也就是沒有變成光之前的形態，體色黑·銀，是迪迦的世界觀中最神秘的黑暗奧特曼，擁有比任何人都強大的黑暗力量，擁有吸收對手攻擊並轉化為光的強大能力。三千萬年前，與卡蜜拉、希特勒、達拉姆一起摧毀了超古代文明。在露露耶遺蹟覺醒時，大古不願意使用黑暗力量，導致其不能發揮其真正實力，因而一直處於劣勢。
數據
體重：44000噸
飛行速度：7馬赫
水中速度：3馬赫
行走速度：1馬赫
潛地速度：1馬赫
跳躍力：800米
握力：3萬噸
閃耀迪迦
迪迦的最強形態。迪迦被迪莫傑厄擊敗後，超古代戰士將殘存的光給予迪迦誕生的超強形態！
閃耀迪迦身高：120米
體重：10萬噸
飛行速度：10馬赫
行走速度：5馬赫
水中速度：5馬赫
潛地速度：5馬赫
跳躍力：1500米
握力：10萬噸
不敗的勇者