2003年12月18日上海技術產權交易所和上海產權交易所合併，成立上海聯合產權交易所，原非上市股份有限公司股權託管中心併入聯交所，成為股權託管部。2004年8月經政府批准，將原歸屬於上海聯合產權交易所內設的股權託管部，改制設立為上海股權託管登記中心有限責任公司，為本市專業從事非上市股份有限公司股權集中託管、過戶、查詢、分紅等業務的股權託管登記機構。
根據上海市委、市政府關於要“探索和建立統一監管下的股權流轉制度”的決定，本著“政府指導、市場引導、風險提示、打擊違法”的原則，將本市非上市股份有限公司股權流動引導到託管中心和聯交所的平台進行操作，這對切實保護投資者利益，規範本市非上市公司股權有序流動，將起到積極的作用。
上海股權託管登記中心
是經政府批准本市唯一專業從事非上市股份公司股權集中託管、過戶、查詢、分紅等業務的股權託管登記服務機構。
上海股權託管登記中心與上海聯合產權交易所的股權交易平台相連線，為上海非上市股份公司股權規範有序流動提供服務平台。
託管中心主要職能
登記職能 為託管企業提供便捷的股東確權登記、變更登記。了解掌握股權變動情況，定期或不定期向託管企業提供及時、準確的股東名冊，向政府有關管理部門進行備案。
管理職能 受託為託管企業管理股東名冊，對託管企業的股權從登記、變更、直至註銷全過程的必備材料進行形式審查，對託管的股權進行日常登記管理。
服務職能 為託管企業及股東提供信息查詢、代理分紅派息、上市輔導、股權回購、投融資及企業要求的其他增值服務。
本中心接受託管公司委託，管理股東名冊，並提供下列業務：
（一）股權託管登記業務：包括協助託管公司進行初始託管確權登記、開立股東帳戶登記、股權過戶登記等；
（二）股權託管服務業務：包括為託管公司提供及時、準確的股東名冊、代理分紅派息、受理股權憑證掛失、提供股權查詢、協助辦理股權凍結、為託管公司提供信息披露平台、其他諮詢服務等。
（三）增值服務業務：主要指為各類企事業單位提供重組改制、財務顧問以及投融資等服務。
為服務企業的過程中，全程為客戶提供包括經紀、法律、審計、評估等在內的專業化服務，並可協助辦理工商、稅務及國有資產交易後續的變更手續等。
