序列標誌位點Asequence-tagged site(orSTSs)可以很容易地檢測聚合酶鏈反應（聚合酶鏈反應）用特定引物，因此能被廣泛套用於從不同文庫得到的大量測序數據的基礎上進行遺傳構建和物理圖譜構建。它們對於基因組的物理圖譜構建具有里程碑的意義。當STSs具有遺傳多態性時（如，簡單長度多態性simple sequence length polymorphisms，SSLPs，單核苷酸多態性），就可作為遺傳標記即個體區分。在鳥搶測序法中，STSs常用於輔助序列組裝。 [1]
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