研究發現
尋找FOXP2的工作始於對“KE”（或稱“K”）家族的研究。該家族的一些成員患有遺傳性的言語障礙，且有三代在世的家族成員受其害。進一步的研究顯示，該基因為常染色體顯性。通過對患病與無病的家族成員的染色體的掃描，研究人員將該基因定位在第7號染色體上。這個基因最初被稱為SPCH1。接下來又通過細菌人工染色體手段對該染色體上的相關區域進行了測序。在基因測序開展期間，他們又找到了另一位患有這種先天性言語障礙，但不屬於KE家族的病人。對這個新樣本的染色體掃描顯示，第7對染色體有一處斷裂。
研究進展
Foxp2對FOXP2基因的發現、在不同物種之間的進化、結構和功能做以綜述。結果FOXP2的突變使其編碼產物喪失了作為一種調控因子誘導大腦神經元遷移後分化的重要功能，影響了個體言語能力的發展。結論FOXP2基因是發現的第一個與語言有關的基因，該基因是人類進化過程中的選擇性標記之一，與語言功能密切有關。
進化
雖然FOXP2在許多動物中存在，但是人類的FOXP2基因在二十萬年間經歷了一系列進化。該事實可能支持該基因與人類獨有的語言功能和創造力有關的猜測。
這組控制語言和創造力的基因總數約在1萬個左右，正是它們的隨機突變，才誘發了人類文化嶄新模式的出現。
表現
語言學家一般認為FOXP2不僅與言語運動控制有關，也與語法、語義等更高級的語言功能有關,其主要理由在於
·FOXP2異常同時導致語言理解困難；
·通過腦功能成像發現，患有FOXP2異常的病人在語言相關的皮層區域也有異常表現，而不局限於腦的運動系統。
多態性
·FoxP2的突變是造成他們語法使用缺陷的原因。
神經發育假說受到人們的普遍關注，與神經發育有關的基因成為孤獨症的候選基因。既往研究表明，FOX轉錄因子家族中許多基因的錯義突變、無義突變和移碼突變導致Forkhead DNA結合域的結構改變或缺失，影響蛋白質的功能或表達，從而可能導致疾病的發生。 FOX轉錄因子家族在胚胎髮育過程中起著關鍵性的調控作用，該基因的突變與許多人類發育性疾病相關。Forkhead box p2(FOXP2)基因是FOX家族成員之一，在胎兒和成人腦中高表達，參與人類語言功能的發育。該基因定位於染色體7q31，這是國際上基因組掃描研究結果中重複性最好的孤獨症連鎖區域之一。這些證據提示FOXP2基因可能是孤獨症的易感基因。為了驗證這一假說，本研究採用以家庭為基礎的研究方法，在167個男性孤獨症患者核心家系中，對FOXP2基因的兩個單核苷酸多態性rs1456031和rs1852469進行了關聯研究。
本研究收集符合國際疾病分類第10版診斷標準的男性孤獨症患者核心家系167例，根據語言能力和智商分組，採用聚合酶鏈式反應—限制性片斷長度多態性方法進行基因型的檢測。套用傳遞不平衡檢驗進行統計分析。結果 在男性孤獨症患者核心家系中，單核苷酸多態性rsl456031等位基因C的傳遞差異有顯著性(X2=5．256，P=0．022)，以臨床表型分組分析，該位點在語言受損和低智商組的傳遞亦具有顯著性差異(X2=5．009，P=0．025；X2=6．509，P=0．011)；而rsl852469傳遞差異無顯著性。
