歷史沿革
建造與使用
13號避難所始建於2063年8月，於2069年3月完工，是西海岸最後一處投入使用的避難所。13號避難所上方覆蓋有61米（200英尺）厚、重達3200000噸的泥土，其內部擁有100間居室，可容納1000人生活。與其他避難所不同的是，13號避難所的個人信息處理器選用的是嗶嗶小子2000而非3000，而且13號避難所安裝了太陽能加熱器，可以利用陽光為居民的生活提供能源。
和大部分避難所一樣，13號避難所也是避難所科技的社會實驗項目之一。13號避難所原計畫要關閉200年以上以研究居民在長時間與世隔絕環境下的生活狀況，但是由於淨水晶片的故障，13號被迫提前開放，隔離計畫也宣告失敗（或者應該說是陰謀被粉碎？）。
13號避難所的建設預算達到了驚人的400億美元，後來由於施工遇到了阻力，實際花費的錢更是高達645億美元。整個避難所每日須要3.98千兆瓦的電力才能正常運作，故除了前面提到的太陽能外，避難所的能源主要產生自地熱，為防萬一，避難所還設有核反應發電機。
13號避難所內部擁有完備的工程器械、水培室、依靠地下暗河提供水源的水處理設施，可以長時間自持，同時避難所內還設有通訊、社交、娛樂設施，以及可以供10人裝備的武器和額外的伊甸創造工具箱（《輻射2》中的地下掩體城的麥卡路參議員提及此事，本來13號避難所應該和其他避難所一樣，配備兩套伊甸創造工具箱，但是因為運輸環節出了錯誤，本來應該送到8號避難所的備用工具箱被送到了13號避難所，而13號避難所的100枚備用淨水晶片則送到了8號避難所，諷刺的是後來13號避難所的居民因為淨水晶片故障，險些引發重大事故，而8號避難所雖然守著一大堆備件，可是原裝的那塊淨水晶片都用了快200年，從來就沒壞過）。
《輻射》
13號避難所2161年，13號避難所的淨水晶片出現故障，在修復無望的情況下，管理員一面對避難所內部實施配給供水，另一方面開始著手尋找淨水晶片（Water purification chip）的替代品。管理員先是派出了塔里尤斯（Talius）和愛德前往廢土世界尋找，但兩人皆杳無音訊（《輻射》遊戲過程中可以得知，塔里尤斯沒有找到淨水晶片，在調查大墓地的水泵過程中，他不幸中招，淪為軍事基地強制進化病毒（F.E.V.）的試驗品，成了變種人（Mutant），在短暫的歷險後他放棄了任務，留在埋骨場（Boneyard），而愛德的下落則不詳，主要是因為重名的人太多——在13號避難所門口就有一具名叫愛德的遺體，馬里波薩軍事基地里關了一個叫愛德的人，《輻射2》的里丁城下埋了一個叫愛德（Ed）的人，丹恩城（The Den）的墓地里有一塊墓碑寫著愛德的名字）2161年12月5日早上7:21，在得知15號避難所（Vault 15）可能存有備用晶片後，避難所居民（The Vault Dweller，也就是玩家）帶著一把10毫米口徑手槍和少許子彈，懷揣著對外界的好奇心踏出了大門，進入廢土世界尋找15號避難所的位置。2162年2月，避難所居民帶著從12號避難所找來的淨水晶片返回了家園。但是，管理員推斷在大墓園出現的超級變種人將會成為13號避難所的巨大威脅，因此他再次派遣避難所居民前往外界，消滅變種人。
避難所居民最終成功消滅了變種人軍隊的頭目——主教（The Master），摧毀了他的基地——大教堂（The Cathedral），並銷毀強制進化病毒。但是當避難所居民最終回到13號避難所的時候，管理員卻認為他在外界的所作所為可能會破壞避難所內的安定，因此決定將避難所居民流放，從此避難所居民有了一個新的稱謂——放逐者。不過根據《輻射2》中13號避難所領袖的稱述，當時避難所內部並不認可管理員的這一舉動，他們一致認為避難所居民是拯救他們的英雄，卻得到了管理員不公正的對待，於是將管理員定為重罪，判處死刑，在這之後，有許多人決定追隨放逐者的步伐，移民至北方，在那裡他們建立了一個小小的原始聚落阿羅由（Arroyo）並繁衍生息，那裡的居民依然視13號避難所為他們的家園，並尊稱其為“神聖十三”（The holy thirteen）。而那些留下來的居民則開始動手建立一台新的超級電腦，用來推選新的管理員。
《輻射2》
2241年5月15日，英克雷向13號避難所的中央電腦釋放了虛假的開放信號，不明真相的居民們打開了避難所大門，結果全副武裝的英克雷軍隊席捲而入，洗劫了13號避難所，避難所中的所有居民均被擄走。2241年5月17日，英克雷向13號避難所釋放了經過強制進化病毒改造、擁有智慧型的死亡爪，企圖以此來掩蓋自己的罪行，只是英克雷沒料到這批死亡爪的首腦甘德（Gruthar）為自己犯下殺人罪行感到懊悔，他在13號避難所中安頓下來後與人類秋毫無犯，甚至會主動地保護人類，而部分人類也因為對甘德心存感激，自願留下。
與此同時，放逐者的曾孫獲選者（The Chosen One）為拯救因乾旱而飽受困苦的阿羅由，來到13號避難所尋找伊甸創造工具箱後，英克雷發覺了13號避難所的現狀，他們派人掃蕩了整個避難所，殺死了死亡爪——不過特殊情況下，死亡爪們也有可能倖存下來。2242年秋天，在摧毀英克雷鑽井平台後，獲選者解放了13號避難所和阿羅由的居民，兩支分異多年族群終於合二為一，利用伊甸創造工具箱復興了阿羅由村。在輻射一代中，十三號避難所是主角的家，遊戲從此開始。主角為了得到令避難所人民繼續生存的物品“淨水晶片”而冒險。但在遊戲最後，主角被同胞放逐，並在荒野中建立了自己的村莊。
幕後花絮
•在《輻射2》中有可能遇見一個隨機事件：獲選者在旅途中發現《星際迷航：原初系列》中出現的“永恆守護者”拱門（Guardian of Forever），穿過它之後，就會來到2161年淨水晶片尚未故障時的13號避難所。而隨後獲選者便會不小心把晶片弄壞。
•13號避難所的主題音樂是《The Vault of the Future》（未來避難所）。
•13號避難所的主題音樂在《輻射：新維加斯》中被用作22號避難所的主題音樂。
•在城鎮地圖中，13號避難所共有四層，但是實際上能夠到達的只有三層。第四層可能是開場動畫中出現的水處理室。
