1996年回國後，萬峰教授積極開展以冠狀動脈搭橋術為主的綜合性冠心病外科治療，共完成手術近10000例，其中在國內率先大規模開展微創非體外循環多支冠狀動脈搭橋術近8000例，國內例數最多，成功率達到99%，達到國際先進水平。
完成了欽雷射心肌血管重建術，冠狀動脈搭橋術加心肌血管重建術，人工心臟輔助裝置和局麻清醒狀態下的冠狀動脈褡橋術等9項中國第一例，獲得國家教育部科技進步一等獎等多項嘉獎，他的事跡先後在世界著名《華爾街日報》、《遠東經濟評論》、新華通訊社、中央電視台CCTV-東方之子、CCTV-人物專訪、北京電視台、《人民日報》、《健康報》、《人民郵電報》、香港《大公報》。《紫光閣》雜誌等被多次宣傳報導。目前全國各地越來越多的患者前來求診，許多在各大醫院被認為不適合手術的病人經過由萬峰主任的手術治療康復出院。
