車站結構
站廳位於地面，設有四個出入口。負一層是換乘夾層。要注意的是，此站雖是平行換乘，但並不是一個跨站台換乘站。換乘時，需通過負一層再下樓到另一條線的站台。3號線與9號線站台均為一般島式站台，位於負二層。3號線站台位於東側，9號線站台位於西側，兩者平行。
站廳換乘
與嘉禾望崗站一樣，本站站廳層設於地面。為方便行人進出，站廳的中央處偏西側被劃分為付費區。站廳非收費區則設有4個出入口供不同方向的乘客進出車站。
本站設有售票機、自動售卡/充值機、客務中心，以及麵包糕餅店等設施。另外，公共洗手間設於站廳D出入口旁外面，母嬰室則設於B出入口旁，均位處站廳層非付費區。
由於本站並不是一個跨月台轉車站。換乘時，需先上樓前往緩衝平台，再下樓到另一條線的月台。另外乘客從本站入閘進站時，同樣需要下樓至緩衝平台，再下樓到其中一條線的月台，亦可以通過連通三層的專用電梯（升降機）從站廳直接前往其中一條線的月台。
車站月台
本站共有兩個島式月台並排布置，位於機場高速東側高增村種植場地下。9號線使用西側島式月台，3號線使用東側島式月台。
軌道布置
本站3號線月台北端設有一條存車線。當3號線機場段出現故障，往機場北列車將以本站為終點站並通過此存車線折返。屆時前往機場的乘客需要轉乘其它交通工具前往。而9號線月台兩端均設有交叉渡線，可用於9號線列車折返。同時亦會設定與3號線的聯絡線。
此站3號線部分共預留了3處與9號線的聯絡軌道。其中南側上行線（南行）一處預留了道岔和隧道接口，北側上下行線各預留了隧道接口但並未安裝道岔，未來需要貫通運營時再作改造。
出入口
高增站設有4個出入口供乘客進出車站。
| 出口編號 | 出口指示 | 建議前往的目的地 |
| 出口A | 方華公路 | 捷運高增站公交總站 |
| 出口B | 方華公路 | |
| 出口C | 方華公路 | |
| 出口D | 方華公路 |
鄰近車站
高增站是3號線的中途站以及9號線的總站，乘客可以在此站進行換乘，往返新白雲國際機場、廣州市區、廣州火車北站和花都城區。
| 前一站 | 廣州捷運 | 後一站 |
| 人和 體育西路方向 | 高增 3號線 | 機場南（1號航站樓） 機場北方向 |
| 起迄站 | 高增 9號線 | 清塘 飛鵝嶺方向 |
利用狀況
由於現時高增站附近仍未開始發展，道路等配套設施也未完善。且高增站目前是9號線唯一的換乘車站，9號線乘客若需往返廣州市區，均需要在本站換乘。因此本站啟用後，客流絕大多數都以換乘為主。而在本站進出的客流較少，大多數是接駁巴士的乘客。
接駁交通
由於本站周邊皆為農田，因此在本站未啟用之前，附近沒有巴士等接駁交通工具。但隨著本站正式啟用，2017年12月27日開始，843路調整至 捷運高增站巴士站作為總站，以方便市民通過公交與捷運接駁換乘。
運營信息
3號線
機場北方向 下一站：機場南（1號航站樓）
首班車06:12
末班車23:33
體育西路方向 下一站：人和
首班車06:04
末班車23:19
9號線
飛鵝嶺方向 下一站：清塘
首班車06:06
末班車23:15
歷史
本站在工程規劃期間以 矮崗站稱呼本站。
本站3號線月台和隧道的土建工程已經在3號線北延段建設之時完成，2010年10月30日3號線北延段開通時，月台已裝好禁止門，亦裝有必要的車站設備，但當時由於本站周邊皆為農田，沒有進出車站的客流需求，同時預計本站開通後客流絕大多數都以換乘為主。因此本站計畫與9號線同步建設地面站廳，並留待9號線開通時同步對公眾開放使用。因此在3號線北延段開通後長達七年多的時間內，3號線列車減速運行並不停站通過。而在此站在未對公眾開放使用的這段時間，亦會配有值班職員。
2017年12月28日接近中午時分，本站隨9號線首期通車而啟用，同時3號線列車開始停靠本站。本站也成為廣州捷運車站中，第四個啟用後即為換乘站的車站。
