其一，體細胞胚是離體培養的產物，只限於在離體培養範圍使用，以區別於無融合生殖胚；
其二，體細胞胚起源於非合子細胞，以區別於合子胚；
其三，體細胞經過了胚胎髮育過程，以區別與離體培養中器官發生形成個體的途徑。
1、體細胞胚從外植體上直接發生在以葉片為外植體的培養中，體細胞胚的直接形成可分為兩個階段：
第一個階段為誘導期。在此階段中，葉片表皮細胞或亞表皮細胞感受培養刺激，進入分裂狀態。
第二個階段是胚胎髮育期。在這一階段，形成的瘤狀物繼續發育，經過球形胚、心形胚等發育過程，最後形成體細胞胚。
2、經過愈傷組織的體細胞胚發生
經過愈傷組織的胚胎髮生需要三個培養階段：
第一階段是誘導外植體形成愈傷組織；
第二階段是誘導愈傷組織胚性化；
第三階段是體細胞胚形成。
在以幼胚、胚以及子葉為外植體時，通常可以直接誘導胚性愈傷組織產生，進而發生體細胞胚。因此，經過愈傷組織的體細胞胚胎髮生，胚性愈傷組織的形成是培養的關鍵。
體細胞胚的結構與發育特點：
1、與器官發生形成個體的途徑相比：
體細胞胚發育再生植株有兩個明顯的特點。一是體細胞胚具有雙極性（double polarity），二是體細胞胚形成後與母體的維管束系統連繫較少，即出現所謂的生理隔離（physiological isolation）現象。
由於大多數體細胞胚起源於單細胞，因此對於單個植株來講，通過體細胞胚形成的再生植株，其遺傳特性相對穩定。
2、與合子胚相比：
合子胚在發育初期具有明顯的胚柄，而體細胞胚一般沒有真正的胚柄只有類似胚柄的結構。特別是那些發育初期類似於動物胚胎髮育途徑的體細胞胚，這一點更為明顯。
合子胚的子葉是相當規範的，可以作為分類的依據，而體細胞胚的子葉常不規範，有時具有兩片以上的子葉。
與相同植物比較，體細胞胚的體積明顯小於合子胚。
體細胞胚沒有休眠而體細胞胚則直接形成植株。合子胚在胚胎髮育完全進入子葉期以後，經過一系列的物質積累和脫水就進入休眠。
