下設5個實戰單位。
1．指揮室：負責掌握、分析、研究全市經濟犯罪情況；負責經濟情報信息的收集、建檔和案卷、贓款、贓物的保管；負責檔案審核、業務培訓、行政事務和政治工作。
2．一大隊（涉稅犯罪偵查大隊）：負責組織指導、協調辦理危害稅收征管等犯罪案件的偵查工作。
3．二大隊（金融犯罪偵查大隊）：負責組織指導、協調辦理破壞金融管理秩序和金融詐欺等犯罪案件的偵查工作。
4．三大隊（公司犯罪偵查大隊）：負責組織指導、協調辦理妨害公司、企業管理秩序及侵占、挪用資金和挪用特定款物等犯罪案件的偵查工作。
5．四大隊（破壞市場經濟秩序偵查大隊）：負責指導、協調辦理擾亂市場秩序和侵犯智慧財產權等犯罪的偵查工作。
