馬耀南先生熱愛書法,青年時以柳體入手,練有一定基礎。近三十多年來臨讀過多家名帖,勤學苦練,筆耕不輟。同時對當代一些書法大家,如張大千、啟功的書法風格,形體結構也多有領悟和吸收。馬耀南先生的書法既遵循傳統書法道路,又形成自己的風格,他的書法功底深厚,剛勁有力,結構嚴謹,娟美秀麗,給人們以美感。由於馬耀南先生的奉獻和社會影響,他被編入《當代中國少數民族名人錄》、《甘肅省統一戰線人名錄》和《甘肅回族人物》等書刊。
馬耀南先生的書法,曾多次參加全國和省上書展,多次獲獎。甘肅的不少廟、觀、寺院都有他題寫的匾額。他的書法被民革中央委員會、寧夏自治區政府、甘肅省文史館等單位及台港人士、約旦、日本等國華人藏。