主要機構
辦公室
主要負責省總工會部署工作的協調、督查和綜合服務；負責綜合反映全省工會工作情況和全省職工隊伍的重要情況；負責省總工會重要會議和重大活動的協調和組織工作；負責社會治安綜合治理、文秘、信息、檔案、保密、接待工作和機關後勤保障工作；負責在業務上指導省總工會機關職工之家的工作。
組織部
1、研究制定全省工會組織建設的制度和措施；
2、指導全省工會組建工作和會員會籍管理工作；
3、研究制定全省工會幹部管理制度、辦法，並負責州市和省級產業廳局（公司）工會領導幹部的協管工作；
4、指導全省工會組織開展建設“職工之家”活動；
5、組織、指導全省工會幹部教育培訓及綜合管理；
6、對工會章程和工會各項制度的執行情況進行監督和檢查；
7、研究和指導全省各級工會自身的改革建設工作；
8、指導和推動工會組織職工參與企事業單位民主選舉、民主決策、民主管理和民主監督工作；
9、指導全省各級工會堅持和發展職工代表大會制度、廠務公開制度、職工董事和職工監事制度；
10、指導職工持股會工作；
11、指導省工青婦幹校教學業務工作；
12、負責全省工會工作目標責任制的考核和評比。
宣傳教育網路部
負責組織廣大職工開展理想信念教育、社會主義核心價值觀教育等，廣泛開展對職工的政治引領和思想引導。組織開展網上工會工作，負責建設符合廣大職工需求的網上職工之家。組織開展全市性職工文化體育活動。
研究室
一、負責組織、協調、參與調查研究與職工利益密切相關的重要政治經濟社會政策問題，特別是職工狀況和勞動關係問題，並提出對策建議；
二、按照全總研究室的調研任務，研究制定全省工人運動和工會工作理論政策調研工作，並組織實施；
三、負責《工運研究與探索的》徵稿、選稿、送審、編印、出版和分發工作；
四、參與省委、省政府國有企業改革的重大政策、法規的研究和制定，通過調研，提出完善國企改革方案的意見和建議；
五、負責起草重要檔案；
六、負責全省工會的統計工作，按時上報全總，為全總和省總提供準確及時的數據；
七、負責組織工運史、工會志資料的收集、整理、送審、編印和出版；
八、負責《工運情況》的選稿、送審、編印和分發；
九、負責省工運研究會秘書處的日常工作；
十、完成省總領導交辦的其他任務。
法律和維權工作部
負責參與有關職工勞動就業、收入分配和社會保險的政策和法律、法規草案的研究和擬定；參與涉及職工切身利益的社會救濟、物價、住房等政策的制定；指導和組織實施送溫暖工程，維護特困職工的困難職工群體的合法權益；參與退休職工有關政策的研究和擬定；負責職工療（休）養事業的規劃、管理和指導。
勞動和經濟工作部
1、參與國家有關經濟建設與改革、經濟技術和勞動保護方面法律、法規、政策制定的有關工作；監督職業安全與衛生法律、法規的實施；
2、按照省總的統一部署，參與組織實施民眾性“經濟技術創新工程”，開展社會主義勞動競賽與合理化建議活動，調動勞動者積極性，以上活動均需結合不同時期經濟工作特點、重點和難點開展；
3、做好省級以上勞模的推薦、評選和表彰工作，搞好勞模日常管理工作，做到建檔立卡，督促有關方面落實勞模的各項待遇；
4、指導、協調班組建設工作，促進基層搞好班組管理；
5、做好工會勞動保護工作，依法維護勞動者在生產過程中的安全與健康，促進生產力健康發展；
6、了解、收集並處理全省經濟工作和職業安全衛生方面的信息，適時提出分析意見和建議；
7、完成領導交辦的臨時性任務。
歷任領導
由省人大常委會副主任江巴吉才同志任省主席，王惠萍任黨組書記、常務副主席。
2012年8月20日，雲南省總工會第十屆委員會第十次全體（擴大）會議在昆明召開。會議通過《關於江巴吉才同志不再擔任雲南省總工會主席職務的決議》等，選舉張百如為省總工會第十屆委員會主席、尚建明為省總工會第十屆委員會副主席。
領導班子
張百如：省人大常委會常務副主任、省總工會主席
饒南湖：省總工會黨組書記、常務副主席
孔貴華：省總工會黨組書記；省總工會常務副主席
王惠萍：省政協常委，原省總工會黨組書記、常務副主席
彭增梅：省總工會黨組成員、副主席
潘紅偉：省總工會黨組成員、副主席
黃增強：省紀委派駐省總工會紀檢組組長、黨組成員
楊衛中：省總工會黨組成員、副主席
尚建明：省總工會黨組成員、副主席
耿家盛：省總工會兼職副主席、全國勞模、車工
