雜交育種法不同種群、不同基因型個體間進行雜交，並在其雜種後代中通過選擇而育成純合品種的方法。
作用功效
雜交可以使雙親的基因重新組合，形成各種不同的類型，為選擇提供豐富的材料；基因重組可以將雙親控制不同性狀的優良基因結合於一體，或將雙親中控制同一性狀的不同微效基因積累起來，產生在各該性狀上超過親本的類型。正確選擇親本並予以合理組配是雜交育種成敗的關鍵。
雜交育種是培育家畜新品種的主要途徑。通過選用具有優良性狀的品種、品系以至個體進行雜交，繁殖出符合育種要求的雜種群。在擴大雜種數量的同時要適當進行近交，加強選擇，分化和培育出高產而遺傳性穩定，並符合選育要求的各小群，綜合為新品種。
條件
根據育種目標要求，一般應按照下列原則進行：①親本應有較多優點和較少缺點，親本間優缺點力求達到互補。②親本中至少有一個是適應當地條件的優良品種，在條件嚴酷的地區，雙親最好都是適應的品種。③親本之一的目標性狀應有足夠的遺傳強度，並無難以克服的不良性狀。④生態類型、親緣關係上存在一定差異，或在地理上相距較遠。⑤親本的一般配合力較好，主要表現在加性效應的配合力高。
方法
所謂雜交育種，一般指種內不同品種間的雜交育種。雜交技術因不同作物特點而異，其共同要點為：調節開花期，通過分期播種、調節溫度、光照及施肥管理等措施，使父母本花期相遇；控制授粉，在母本雌蕊成熟前進行人工去雄，並套袋隔離，避免自交和天然異交，然後適期授以純淨新鮮花粉，作好標誌並套袋隔離和保護。用於雜交的父本和母本分別用P1和P2表示，其代表符號分別為♂和♀；×表示雜交。雜交所得種子種植而成的個體群稱雜種一代（子一代），用F1表示。F1群體內個體間交配或自交所得的子代為F2、F3、F4等表示隨後各世代。安排親本或雜種成對使之交配的雜交方式有：成對雜交（單交）即兩個不同品種或系統間的雜交，兩親可互為父母本（正反交）；複合雜交，即幾個品種分別先後進行多次雜交。回交是以雜種後代與親本之一再交配的雜交方
雜交育種法雜交創造的變異材料要進一步加以培育選擇，才能選育出符合育種目標的新品種。培育選擇的方法主要有系譜法和混合法 。 系譜法是自雜種分離世代開始連續進行個體選擇，並予以編號記載直至選獲性狀表現一致且符合要求的單株後裔（系統），按系統混合收穫，進而育成品種。這種方法要求對歷代材料所屬雜交組合、單株、系統、系統群等均有按親緣關係的編號和性狀記錄，使各代育種材料都有家譜可查，故稱系譜法。典型的混合法是從雜種分離世代F2開始各代都按組合取樣混合種植，不予選擇，直至一定世代才進行一次個體選擇，進而選拔優良系統以育成品種。在典型的系譜法和混合法之間又有各種變通方法，主要有：改良系譜法、混合-系譜法、改良混合法、衍生系統法、一粒傳法。不同性狀的遺傳力高低不同。在雜種早期世代往往又針對遺傳力高的性狀進行選擇，而對遺傳力中等或較低的性狀則留待較晚世代進行 。選擇的可靠性以個體選擇最低，系統選擇略高，F3或F4衍生系統以及系統群選擇為最高。選擇的注意力也最高。因此隨雜種世代的進展，選擇的注意力也從單株進而擴大到系統以至系統群和衍生系統的評定。試驗條件一致性對提高選擇效果十分重要。為此須設對照區，並採取科學和客觀的方法進行鑑定，包括直接鑑定、間接鑑定、自然鑑定或田間鑑定、誘發鑑定或異地鑑定。雜種早代材料多，一般採取感官鑑定。晚代材料少，再作精確的全面鑑定。
作物育種程式在中國一般包括以下環節：原始材料觀察、親本圃、選種圃、產量比較試驗。雜交育種一般需7～9年時間才可能育成優良品種 ，現代育種都採取加速世代的做法，結合多點試驗、稀播繁殖等措施，儘可能縮短育種年限。
