苯教，亦稱“苯波教”，俗稱“黑教”，是根植於西藏原始公社時期的一種宗教。據說它最早出現在象雄（今阿里地區），後來才傳入雅礱地區。“苯”是西藏文的譯音。為“誦讀”、“念誦”之意，古代苯教徒中盛行念之風，企圖以咒經消除自己和他人的疾病等災禍，用咒念之功降服一切邪惡勢力，故得此名，也可譯為“西藏巫教”。苯教不但有教義、經典、教規，而且在佛教傳入西藏之前十分興盛，從西藏本地到青海、四川、甘肅的藏區文為信奉，苯教寺廟遍布各地。佛教的傳入，使苯教元氣大傷，但至今仍有數量可觀的教徒和一定規模的寺院，而雍仲林寺便是名揚區內外的苯教主寺。
有關雍仲林寺的形成，傳說眾多。早在三千年前，仁增·陳巴朗卡（苯教中稱他是蓮花季的父親）曾預言說：在藏區鄔郁下端將有苯波 大寺院誕生，來自朗瓦（今四川阿壩一帶）征服者陀美（即後來的江袞·達哇堅贊）將到此地建寺。藏王墀松德贊（755～797年在位）邀請蓮花生來藏傳教時，曾實施“滅苯”以利傳佛。在苯教基本泯滅扣，蓮花生預言道：“非‘熱拉’（雍仲林寺所在地名）是‘熱朗’（復活之意），苯教將由此地死灰復燃也。”在距雍仲林寺修建四百年前。曼日寺創建人念美·繞堅贊也曾預言道：將來在“熱拉”會出現一座苯教大寺院。不知是不是遵循了前人的這些預言，江袞·達哇堅贊果真在南木林縣熱拉村維拉傑桑山麓延抻出來的一片鵝卵石堆積的高台上主持修建了這座苯教規模最大的寺院——雍仲秋林寺。
雍仲林寺建築群依山勢而建。寺廟南面的深溝就是滾滾東流的雅魯藏布江，與中尼公路一江之隔，離寺廟不遠處在為著名的達竹卡渡口，通向藏北、青海的公路由此延伸；北面緊靠維拉傑桑山，“維拉傑桑”是十三護法神之一，山腰間有瑪尼堆和修行洞。距寺廟不遠的山壁上有一巨岩，信徒對此岩倍加推崇，聲稱是維拉傑桑護法神之居地，每年都要虔心祭祀。
雍仲林寺在苯教中的地位非常顯著。西藏及區外藏區各苯教寺廟的住該寺委派。在該寺舉行一年一度的大型講經修法活動進，藏區各地數以千計的信徒雲集此寺。該寺有嚴格的戒規戒律及修法制度，江袞·達哇堅贊開創了該寺的每年藏曆正月至12月各項固定的宗教活動：祭祀上師、祈禱法會、修行法會、誦經大會等宗教活動以及講學辯經、答辯考取格西學位等，使該寺香火旺盛，聲名遠播。西藏民主改革時，該寺被定為“愛國進步寺”。歷史上該寺常住僧人300～500人，現存60人。黨的十一屆三中全會以來，被“文革”破壞的寺院建築逐步得到修復，各項宗教活動也逐漸得到恢復，各種法會、祭神送鬼、跳神、辯經、長淨、靜修等日常宗教活動現在都能正常開展。
雍仲林寺坐南朝北，以杜康大殿為中心，由7個康村（寺廟的基層組織）組成，最高權力機殿占地面積800餘平方米，有柱64根，四周設有佛殿、經堂、藏經殿、法器庫等，上下兩層，規模宏大。寺院中珍藏有兩部苯教大藏經《甘珠爾》和《丹珠爾》。大殿東西兩側藏經殿為“甘珠爾殿”和“丹珠爾殿”。大殿的正廳裡面是佛殿，面積80多平方米，有柱29根，殿內主要供奉有兩層樓高（約8米）的銅質鎏金度母強瑪（卓瑪）像、金剛杵普巴佛、苯教祖師頓巴辛饒；還有三層樓高（約12米）的銅質鎏金勝利佛和曼日寺創建人念美·喜饒堅贊、江袞·達哇堅贊的鎏金銅像。佛殿內原供有用金、銀、銅製成的五座靈塔，塔內安放有該寺歷代法師的法體；還有一對各為2公斤重地純金供燈。
從杜康大殿拾級而上為環形垂廊。其東、南、西、北分別是僧人的“修行室”；保存珍貴法器的“內庫”；供奉佛像的“佛堂”；收藏歷史經版的“印經版藏室”。
雍仲林寺的重要殿堂通追拉康，位於寺院東北側。通，意為“見”；追，意為“解脫”。顧名思想朝聖者來到這時，僧人們就會主動給你敬聖水。拉康面積約80平方米，殿內供奉的5座靈塔，“文革”時全部被毀，現已將其中最大的江袞·達哇堅贊塔修復，高達5米，鑲嵌黃金2公斤。殿內一對銀燈和一個曼荼羅，各用70個銀元製成。殿內繪有壁畫：中央壁上繪有江袞·達哇堅贊畫像；四壁繪有苯教祖師頓巴辛饒的千佛像。
通追拉康東側原有4個靈塔殿，殿內均供有一座靈塔，“文革”時被毀。現已修復了江袞·達哇堅贊的靈塔殿及殿內的靈塔，面積40多平方米。四川阿壩州為該殿送來了千尊頓巴辛繞鍍金泥塑佛像。據說新修復的通追拉刃和靈塔殿的靈塔內都保存有達哇堅贊的舍利，甚為珍貴。
雍仲林寺北側為拉讓（活佛宮室），面積約90平方米。宮內原有頓巴辛饒和本尊（密宗的佛母依怙主尊佛像）及菩薩的唐卡。宮內還設有該寺住持的法座。
寺院西北側為竹康（修行殿），面積40多平方米。主要供奉護法神和一座達哇堅贊贊銅鍍金小靈塔，塔內珍藏著達哇堅贊的手、足及其使用過的法器。
雍仲林寺內從左到右的萬字紋，是苯教特徵的標誌，稱之為：“雍仲”。圖案與格魯派的金剛杵意義相同，象徵“堅固不變”。所以，雍仲林寺的建築、法器及苯教祖師像前等處，都有字可見。
