基本情況
陳思學姓名：陳思學 性別：男 國籍：中國 出生年月：1968年9月
最後學歷：博士後 學位：博士
現任職單位：黑龍江大學 生命科學學院
美國佛羅里達大學 生物技術研究中心蛋白質組學中心實驗室
現任專業技術職務：副教授，碩士和博士研究生導師
從事專業：植物生物化學，蛋白質組學
主要學術兼職：美國自然科學基金委員會項目審稿專家和專家組成員
Israel 自然科學基金委員會項目審稿專家
Frontiers in Biology 雜誌編委會成員（ISSN 1673-3509; eISSN1673-3622）
專業學會會員：
美國植物生物學學會，蛋白質組學學會，質譜學會，中西部質譜學會，生物信息資源學會，國際科學諮詢專家委員會。
個人簡歷
1987-1991 哈爾濱師範大學生物系，學士
1991-1993 華東師範大學生物系，碩士
1993-1996 上海植物生理研究所和華東師範大學，博士
1996-1998 德國弗賴堡大學生物研究所，洪堡研究員
1998-2001 丹麥皇家農牧大學植物生物化學實驗室和丹麥分子植物生理學中心，助理研究教授
2001-2003 美國賓夕法尼亞大學，高級研究員，蛋白質實驗室負責人
2003-2005 美國丹弗斯植物科學研究中心，蛋白質組學與質譜分析實驗室主任
2005-至今 美國弗羅里達大學植物系，遺傳研究所和細胞學學科，副教授
2006-至今 黑龍江大學生命科學學院，“龍江學者”
主要學術貢獻
1998-2001 獲得丹麥自然科學基金委員會的項目資助，從事芥子油苷生物合成，轉運和降解代謝的前沿研究。確定了合成的關鍵酶基因CYP79F1 和 CYP79F2 的功能；確定了質膜運輸體蛋白的生物化學特性和長距離運輸的機制；克隆並功能性表達了芥子油苷降解酶；建立了芥子油苷大規模放射性標記，合成和純化技術。為芥子油苷的基礎生物學研究和套用於抗病蟲害，防治癌症等做出了重要貢獻。
2001-2005確定了酵母和植物擬南芥菜液泡器蛋白質組分和含量，並發現蛋白質液泡運輸系統的特異底物蛋白，其中包括細胞膜運轉體。成果發表於《proteomics》、《Journal of Biological Chemistry》等權威刊物上。同時，發現的特異膜運載體可以用於利用植物化學工廠大量合成和積累有用的代謝產物，如葉酸等。除了蛋白質組學的研究， 還為國際生物膜蛋白質生物晶片的研究做出了重要貢獻。
2005-2006 建立了一種快速的蛋白質鑑定和分析技術。 該技術極大地提高了蛋白質組學的研究效率。 率先將蛋白質組學技術套用於多種植物和作物 （例如木薯和玉米）的生物學研究，解決生物學領域的重要緊迫問題。研究成果發表於多篇國際上有影響的SCI 刊物上。發現的許多與作物抗逆和品質相關的目的蛋白。套用生物技術對這些蛋白質的人工表達調控可能會解決當前農業生產上的一些實際問題，包括防禦病蟲害，提高品質和營養價值等。
2006-2007 建立了獨立的植物蛋白質組學和生物化學專項實驗室，首次將蛋白質組學技術套用於植物芥子油苷次生代謝網路研究。代謝網路和系統生物學的研究是當今生物學的前沿。 這方面的研究成果為最佳化植物生物技術策略，提高轉基因作物的效果有重要的套用前景。
2007-2009套用先進的蛋白質組學和轉錄組學技術首次研究油菜保衛細胞蛋白質的組成和功能，本研究以封面形式發表在世界權威的蛋白質組學雜誌《Molecular and Cellular Proteomics》上。首次發現許多保衛細胞特異蛋白，編碼這些蛋白的基因在用於基因工程改良作物，提高產量、抗逆性和生物能源利用方面有重要的套用價值。成功的把蛋白質組學和代謝組學套用在植物激素和芥子油苷次生代謝網路研究方面，最近的研究結果發表在植物學科有影響的國際刊物《The Plant Journal》上，這些結果首次證明了蛋氨酸側鏈延長關鍵酶在脂肪類芥子油苷合成過程中的功能和芥子油苷合成的氧化還原調節，提出了氧化還原調節在植物次生代謝網路中的關鍵作用，為揭示植物信號和分子網路提供了新的研究方向，這方面的研究對提高蔬菜品質、營養價值和防癌抗癌活性物質的含量的人工調控打下了堅實的基礎。
2009-至今，利用先進的定量蛋白質組學和代謝組學的技術，在芥子油苷的代謝網路的相關研究中取得突破，許多新的代謝組分和分子間的相互作用被發現，這些研究發現有助於對芥子油苷相關代謝途徑的認識。同時，首次利用系統生物學的技術手段將遺傳與環境的因子進行結合，來認識高等生物的複雜的分子代謝網路和途徑。這些發現為下一步改良作物的品質、產量、以及提高抗逆性奠定了堅實基礎，這些研究於 2009年獲得美國自然科學基金五年傑出青年獎研金。
參與國家和國際科研項目（近五年）：
1、甜菜M14品系特異表達基因cystatin的功能研究 國家自然科學基金 29萬 2011-2013 2
2、甜菜M14品系花器官特異表達蛋白質的研究 國家自然科學基金 26萬 2009-2011 2
3、芥子油苷次生代謝環境調控的蛋白質組學研究 國家自然科學基金委海外合作項目 40萬年 2008-2010 1
4、甜菜M14品系花器官特異表達蛋白質的篩選鑑定 國家自然科學基金國際合作項目 1.8萬元 2010 2
5、甜菜M14品系花器官特異表達蛋白質資料庫的建立及分析 國家自然科學基金國際合作項目 1.2萬元 2011 2
6、在美國弗羅里達大學建立高精度的UPLC-QSTAR蛋白質組平台 美國國家衛生研究所 43萬美元 2009-2010 1
7、關於保衛細胞信號轉導的氧化還原和代謝組學調節機制研究 美國自然科學基金 55萬美元 2008-2011 1
8、芥子油苷植物代謝分子網路的研究 美國自然科學基金 68萬美元 2008-2011 1
9、芥子油苷次生代謝的蛋白質組學研究 美國弗羅里達大學植物系及遺傳研究所啟動基金 67萬美元 2006-2009 1
10、在弗羅里達大學建立LC-MS 平台進行蛋白質組和代謝組學的科研和教學 美國套用生物系統公司 16萬美元 2009-2011 1
11、The agricultural genomics,Education, and Metabolomics 美國農業科學基金 25萬美元 2007-2010 1
發表的學術論文（近五年）
1、Chen Y, Yan X, Chen S. Bioinformatic analysis of molecular network of glucosinolate biosynthesis. Computational Biology and Chemistry, 2011, 35(1): 10-18.
2、Han B, Chen S, Dai S, Yang N, Wang T. Isobaric tags for relative and absolute quantification- based comparative proteomics reveals the features of plasma membrane-associated proteomes of pollen grains and pollen tubes from Lilium davidii. Journal of Integrative Plant Biology, 2010, 52 (12): 1043–1058
3、Wang X, Chen S, Zhang H, Shi L, Cao F, Guo L, Xie Y, Wang T, Yan X, Dai S. Desiccation tolerance mechanism in resurrection fern-ally Selaginella tamariscina revealed by physiological and proteomic analysis. J Proteome Res, 2010, 9(12):6561-77.
4、He Y, Chen L, Zhou Y, Mawhinney TP, Chen B, Kang BH, Hauser BA, Chen S. Functional characterization of Arabidopsis thaliana isopropylmalate dehydrogenases reveals their important roles in gametophyte development. New Phytol, 2011, 189 (1):160-175.
5、He Y, Chen B, Pang Q, Strul JM, Chen S. Functional specification of Arabidopsis isopropylmalate isomerases in glucosinolate and leucine biosynthesis. Plant Cell Physiol. 2010, 51(9):1480-7.
6、Pang Q, Chen S, Dai S, Chen Y, Wang Y, Yan X. Comparative proteomics of salt tolerance in Arabidopsis thaliana and Thellungiella halophila. J Proteome Res. 2010, 7;9(5):2584-99.
7、Humbard MA, Miranda HV, Lim JM, Krause DJ, Pritz JR, Zhou G, Chen S, Wells L, Maupin-Furlow JA. Ubiquitin-like small archaeal modifier proteins (SAMPs) in Haloferax volcanii. Nature, 2010, 463(7277):54-60.
8、Zhu M, Simons B, Zhu N, Oppenheimer DG, Chen S. Analysis of abscisic acid responsive proteins in Brassica napus guard cells by multiplexed isobaric tagging. Proteomics, 2010, 73(4):790-805.
9、Li H, Cao H, Wang Y, Pang Q, Ma C, Chen S. Proteomic analysis of sugar beet apomictic monosomic addition line M14. Proteomics, 2009, 73(2):297-308.
10、Zhang X, Chen S, Mou Z. Nuclear localization of NPR1 is required for regulation of salicylate tolerance, isochorismate synthase 1 expression and salicylate accumulation in Arabidopsis. J Plant Physiol, 2010, 167(2):144-8.
11、Paul AL, Liu L, McClung S, Laughner B, Chen S, Ferl RJ. Comparative interactomics: analysis of Arabidopsis 14-3-3 complexes reveals highly conserved 14-3-3 interactions between humans and plants. J Proteome Res, 2009, 8(4):1913-24.
12、He Y, Mawhinney TP, Preuss ML, Schroeder AC, Chen B, Abraham L, Jez JM, Chen S. A redox-active isopropylmalate dehydrogenase functions in the biosynthesis of glucosinolates and leucine in Arabidopsis. Plant J, 2009, 60(4):679-90.
13、Alvarez S, Zhu M, Chen S. Proteomics of Arabidopsis redox proteins in response to methyl jasmonate. J Proteomics, 2009, 73(1):30-40.
14、Low JM, Chauhan AK, Gibson DS, Zhu M, Chen S, Rooney ME, Ombrello MJ, Moore TL. Proteomic analysis of circulating immune complexes in juvenile idiopathic arthritis reveals disease-associated proteins. Proteomics Clin Appl, 2009, 3(7):829-40.
15、Pang Q, Chen S, Li L, Yan X. Characterization of glucosinolate--myrosinase system in developing salt cress Thellungiella halophila. Physiol Plant, 2009, 136(1):1-9.
16、Paul AL, Liu L, Laughner B, McClung S, Chen S, Ferl R. Comparative Interactomics: Analysis of Arabidopsis 14-3-3 complexes reveals highly conserved 14-3-3 interactions between humans and plants. J. Proteome Res, 2009, 8 (4):1913–1924
17、Raichaudhuri A, Peng M, Naponelli V, Chen S, Sánchez-Fernández R, Gu H, Gregory JF 3rd, Hanson AD, Rea PA. Plant Vacuolar ATP-binding Cassette Transporters That Translocate Folates and Antifolates in Vitro and Contribute to Antifolate Tolerance in Vivo. J Biol Chem, 2009, 284(13):8449-60.
18、Zhu M, Dai S, McClung S, Yan X, Chen S. Functional differentiation of Brassica napus guard cells and mesophyll cells revealed by comparative proteomics. Mol Cell Proteomics, 2009, 8(4):752-66.
19、Alvarez S, Wilson GH, Chen S. Determination of in vivo disulfide-bonded proteins in Arabidopsis. Chromatogr B Analyt Technol Biomed Life Sci, 2009, 877(1-2):101-4.
20、Alvarez S, He Y, Chen S. Comparative investigations of the glucosinolate-myrosinase system in Arabidopsis suspension cells and hypocotyls. Plant Cell Physiol, 2008, 49(3):324-33.
21、Dai S, Wang T, Yan X, Chen S. Proteomics of pollen development and germination. Proteome Res, 2007, 6(12):4556-63
22、Zhu J, Alvarez S, Marsh EL, Lenoble ME, Cho IJ, Sivaguru M, Chen S, Nguyen HT, Wu Y, Schachtman DP, Sharp RE. Cell wall proteome in the maize primary root elongation zone. II. Region-specific changes in water soluble and lightly ionically bound proteins under water deficit. Plant Physiol, 2007, 145(4):1533-48.
23、Yan X, Chen S. Regulation of plant glucosinolate metabolism. Planta, 2007, 226(6):1343-52.
24、Sarry JE, Chen S, Collum RP, Liang S, Peng M, Lang A, Naumann B, Dzierszinski F, Yuan CX, Hippler M, Rea PA. Analysis of the vacuolar luminal proteome of Saccharomyces cerevisiae. FEBS J, 2007, 274(16):4287-305.
25、Chen S, Sánchez-Fernández R, Lyver ER, Dancis A, Rea PA. Functional characterization of AtATM1, AtATM2, and AtATM3, a subfamily of Arabidopsis half-molecule ATP-binding cassette transporters implicated in iron homeostasis. J Biol Chem, 2007, 282(29):21561-71.
26、Chen S, Harmon AC. Advances in plant proteomics. Proteomics, 2006, 6(20):5504-16.
27、Herman EM, Rotter K, Premakumar R, Elwinger G, Bae H, Ehler-King L, Chen S, Livingston DP 3rd. Additional freeze hardiness in wheat acquired by exposure to -3 degreesC is associated with extensive physiological, morphological, and molecular changes. Exp Bot, 2006, 57(14):3601-18.
28、Alvarez S, Goodger JQ, Marsh EL, Chen S, Asirvatham VS, Schachtman DP. Characterization of the maize xylem sap proteome. J Proteome Res, 2006, 5(4):963-72.
29、Sheffield J, Taylor N, Fauquet C, Chen S. The cassava (Manihot esculenta Crantz) root proteome: protein identification and differential expression. Proteomics, 2006, 6(5):1588-98.
30、Zhu J, Chen S, Alvarez S, Asirvatham VS, Schachtman DP, Wu Y, Sharp RE. Cell wall proteome in the maize primary root elongation zone. I. Extraction and identification of water-soluble and lightly ionically bound proteins. Plant Physiol, 2006, 140(1):311-25.
31、Chen S. Rapid protein identification using direct infusion nanoelectrospray ionization mass spectrometry. Proteomics, 2006, 6(1):16-25.
