阜寧縣合利中心國小始建於一九三二年春，由當時蛤蜊港地方名士聯合創辦，名為“唐氏私人學堂”。學校的成長經歷了抗日戰爭、解放戰爭的磨礪，建國後，經地方政府批准更名蛤蜊港國小，從一九五四年到一九七八年，先後經歷了完全國小到初級中學的變遷。
一九九一年秋，經上級政府批准，合利國小升格為合利鄉中心國小，二〇〇二年，合利鄉中心國小又改名為合利鎮中心國小，而現更名為阜寧縣合利中心國小，學校與時俱進，辦學規模不斷擴大，逐步成長為一所現代化的中心國小，現學校教學環境宜人，校舍建設完備，教學設施齊全，教學質量迅猛發展。
阜寧縣合利中心國小長期堅持“重素質發展、重質量提升、重特色引領”的辦學思路，特別是近年來，學校堅持“學校第一、教師第一、學生第一、發展第一”的辦學理念，學校邁上了跨越發展之路，先後獲得縣規範學校、縣素質教育示範校、縣花園式學校、縣文明單位、縣安全文明單位、縣安全文明學校、縣教學質量先進獎、鹽城市藝術特色學校等稱號。
