間腦
被大腦半球所覆蓋,其上有松果體,為內分泌體,哺乳類之松果體趨於縮小。在間腦腹面發出的視神經,形成交叉稱視神經交叉,其後以一柄與腦下垂體相聯。間腦腔又稱為第三腦室,十分發達。間腦壁內的神經結構主要有背方的丘腦又稱為視丘與腹面的丘腦下部。丘腦是低級中樞與大腦皮層分析器之間的中間站,來自全身的感覺衝動均集中於此處,經間腦灰質換一神經原再入大腦皮層。腹面的丘腦下部是植物神經活動中樞
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中腦
哺乳動物的中腦不發達,體積甚小,中腦腔狹窄呈一管,稱中腦導水管,與第三、第四腦室交通。中腦背方具有四疊體,前面一對為視覺反射中樞,後面一對為聽覺反射中樞。中腦底部由下行的運動神經纖維束構成較顯著的腦足。
小腦
哺乳動物後腦的背部為極為發達的小腦,其主要機能是協調軀體肌肉運動和維持軀體正常姿勢的平衡中樞。哺乳類的小腦在結構上所具有的特有的特徵是具有小腦皮質,其灰質覆蓋在表面,形成小腦皮層,白質呈樹枝狀深入灰質。此外,在兩小腦半球之間以橫行的神經纖維束構成哺乳類特有的腦橋,腦橋是小腦與大腦之間聯絡通路的中間站。
延腦
與脊髓相連線,兩者結構相似。延腦除了構成脊髓與高級中樞聯絡的通路外,在白質內有上行的和下行的傳導徑路。灰質分散為一些神經核,神經核的神經纖維與相應的感覺和運動器官相聯繫。延腦還是重要的內臟活動中樞,可調節呼吸、消化、循環、汗腺分泌以及各種防禦反射。延腦的背面有第四腦室。
哺乳動物腦的各部共發出12對腦神經,分別司感覺和運動的功能或兼而有之。這12對腦神經的名稱、發出部位、分布及主要功能,以後均有論述。哺乳動物的植物神經系統十分發達,其主要功能是調節內臟活動和新陳代謝過程,保持體內環境的平衡。植物神經系統可分為交感神經系統和副交感神經系統。交感神經系統包括起源於脊髓胸腰段並通過交感神經鏈而分布到內臟器官的神經纖維。副交感神經系統由部分腦神經動眼神經、面神經、舌咽神經、迷走神經)與起源於脊髓薦部的神經所組成。交感神經與副交感神經對內臟器官的作用是拮抗的,也就是說絕大多數內臟器官受到交感神經和副交感神經的雙重支配,例如刺激心交感神經使心搏加速,刺激迷走神經(副交感)使心搏減慢。,與內臟活動的協調有密切關係,並為體溫調節中樞。