主要職責
（一）領導區直機關黨的工作，保證黨的路線、方針政策和區委、區政府的重要決定在區直機關的貫徹落實。
（二）負責制定區直機關黨的建設的規劃，領導機關黨組織搞好思想、組織、作風和制度建設，做好機關黨員的教育管理工作。
（三）負責審查區直部門基層黨組織撤建資格的考察、報批工作；負責區直機關黨總支、黨支部的撤建、隸屬關係的調整，負責區直機關黨總支、黨支部和區級部門、局級事業單位黨委下屬的黨委、黨總支、黨支部組成人員的審批工作。
（三）指導區直機關黨組織落實黨風廉政建設責任制，按規定許可權立案查處機關黨員違紀案件。
（四）指導區直機關黨組織管理本部門民主生活會，推行黨務分開，開展黨內監督。
（五）指導區直機關黨組織管理本部門中心組學習，協助審查區直機關文明單位的創建、複查工作。
（六）指導區直機關黨組織開展黨員和黨務幹部培訓，負責入黨積極分子培訓和發展黨員的審批工作。
（七）指導區直機關黨組織對機關工青婦組織實施統一領導，組織區直機關開展民眾性教育活動。
（八）負責區直機關黨的工作的年度目標考核。
（九）完成區委交辦的其它任務。
內設機構
根據上述職責，中共重慶市南川區直屬機關工作委員會設3個職能科（室）：
（一）辦公室
負責機關公文的收發、起草、審核、編印、傳遞、歸檔等工作；負責機關值班、接待、會務、信訪、保密、財務、資產管理以及協調機關內務等工作；牽頭組織機關黨的工作綜合目標考核和承辦領導交辦的其它工作任務。
（二）組織紀檢科
負責機關黨組織、群團組織設定和組成人員的考察報批工作；負責黨籍管理、黨內統計、發展黨員審核工作；負責黨費收繳、管理、監督工作；負責指導領導班子民主生活會，指導機關黨組織建立完善黨員教育管理長效機制；負責機關黨員、黨務幹部和入黨積極分子培訓工作；指導機關部門落實黨風廉政建設責任制，協助承辦機關黨員違反黨紀的案件，承辦領導交辦的其它工作任務。
（三）宣傳教育科
負責指導機關部門中心組學習；指導機關部門開展精神文明建設，協助審查機關文明單位的創建、複查工作；負責區直機關黨報黨刊的征訂發行工作；指導機關群團組織按照各自章程開展工作；負責《機關黨的工作》簡報和《機關黨建網》建設，承辦機關各類宣傳教育活動和領導交辦的其它工作任務。
紀工委
負責紀律檢查及黨風廉政建設；受理黨員和民眾的控告和申訴，按管理許可權查處或協助查處黨員及幹部職工違犯黨紀、政紀的案件；開展黨紀政紀宣傳教育。
人員編制
中共重慶市南川區直屬機關工作委員會機關行政編制為6名。其中，書記1名，副書記2名；紀工委書記按有關規定配備；科室領導職數3名。
