一、單一離子交換
工藝流程：原水→原水加壓泵→多介質過濾器→活性炭過濾器→軟水器→精密過濾器→一級反滲透設備→中間水箱→中間水泵→離子交換器→純化水箱→純水泵→紫外線殺菌器→微孔過濾器→用水點這一工藝雖然初期投入成本少，設備占地小，但是在後期運行中需要頻繁進行離子再生;除了需要大量投入酸鹼成本，並且對環境也對產生危害。
二、反滲透與離子交換組合
工藝流程：原水→原水加壓泵→多介質過濾器→活性炭過濾器→軟水器→精密過濾器→第一級反滲透→PH調節→中間水箱→第二級反滲透(反滲透膜表面帶正電荷)→純化水箱→純水泵→紫外線殺菌器→微孔過濾器→用水點這一工藝採用反滲透與離子交換組合套用的模式，雖然比單一的離子交換設備投入要高，但是相對離子再生的周期較長;因此，酸鹼消耗的成本也較單純離子交換工藝要少;但是依然存在對環境產生污染的缺點。
三、反滲透與EDI系統組合
工藝流程：原水→原水加壓泵→多介質過濾器→活性炭過濾器→軟水器→精密過濾器→一級反滲透機→中間水箱→中間水泵→EDI系統→純化水箱→純水泵→紫外線殺菌器→微孔過濾器→用水點這一工藝套用反滲透與EDI系統作為超純水設備的核心，這是目前最為先進的超純水製備工藝，不但環保節能，而且性能穩定，水質優良。但是，這一裝置的投資費用相對較高。
以上三種工藝，各有利弊;相信在各家醫院選擇設備的時候都會根據實際情況選擇最適合醫院發展的醫療器械清洗用設備。
