2002年取得上海交通大學醫學院博士學位，並於同年赴美國著名的梅奧醫學中心（Mayo Clinic）胃腸科從事博士後研究工作，2007年評為助理教授，後在該校擔任副主任（Associate Consultant）等職，2009年專利和專利申請為美國領先的分子診斷公司Exact Sciences Corporation (納斯達克上市公司)收購，並被聘為該公司研發部主任（Director of R&D），重新組建了該公司的研發部，負責大腸腫瘤無創篩查產品的研發，研究成果多次為紐約時報和微軟美國全國廣播公司等著名媒體報導。有豐富的腫瘤分子診斷技術研究和產品開發經驗，擅長腫瘤篩查、腫瘤靶向治療靶點檢測、和其他疾病診斷方法的開發，對於腫瘤的遺傳學基礎亦有較深的研究。為QuARTS、Digital Melt Curve Assay（DMC）、Real-Time Alu PCR等多種分子檢測技術的發明人，所發現的腫瘤特異的甲基化標誌物BMP3基因被選為新一代糞便核酸測試的標誌物。在《Gastroenterology》《clinical Cancer Research》《Clinical Chemistry》等國內外領先期刊上發表論文29篇（總SCI影響因子約110分、總SCI引用次數約為500次，其中16篇影響因子超過3分、3篇超過10分，多數為第一作者或通信作者），在國際會議上發表20多篇論文摘要，共申請國際和美國專利11項；擔任《oncogene》《The Journal of pathology》《Clinical Chemistry》等六份國際領先科學期刊的審稿人；為美國癌症研究會（AACR）、美國胃腸病學會（AGA）、美國臨床化學會（AACC）會員。
註：梅奧醫學中心（Mayo Clinic）是世界上最負盛名的醫學中心之一，其胃腸科一直在美國排名第一。
主要成果：
1、在醫學研究方面的主要成果包括：
· 發明和改進了新一代糞便核酸測試作為大腸癌和癌前腺瘤的無創篩查方法，該方法可檢測到85%的大腸癌和65%的癌前腺瘤，現在在進行大型多中心臨床試驗（12000例），準備申報美國藥品食品管理局（FDA）批准臨床套用，該研究成果為紐約時報等眾多大眾媒體廣為報導。我在該領域的研究居於國際領先地位。大腸癌已成為我國發病率第三位的惡性腫瘤，在我國引進和推廣這一技術有望大大降低大腸癌的發病率和死亡率。
· 國際上首次發現食道癌、胃癌、膽道癌、胰腺癌組織中的基因突變標誌物可以在患者糞便中檢測到，為使用糞便核酸檢測篩查和診斷上消化道腫瘤提供了生物學上的可行性。該研究成果2009年六月在權威消化病國際會議Digestive Disease Week上報告後，為醫學媒體ModernMedicine等報導。
· 比較深入地研究了消化道腫瘤的遺傳學基礎，尤其是表觀基因組學。在國際上首次發現了畸變甲基化是BMP3、EYA2、EYA4等基因在腫瘤中功能喪失的原因，闡明了畸變甲基化是SFRP基因家族在Barrett’s食道癌中失活的機制。
· 首次在大腸癌患者血清中檢測出DNA甲基化標誌物（國內研究所取得的成果），發現p16基因甲基化僅出現在癌症患者血清中，而不出現於正常對照者血清中。文章發表於國際知名學術刊物《Clinical Cancer Research》，時任美國癌症研究會（AACR）主席的Peter A. Jones教授在同期雜誌中發表了專文對該文給予了好評。
· 首次在中國外科學界引入meta分析方法對臨床實驗數據進行匯總分析，發現聯合套用干擾素alpha不僅不能提高5-Fu對晚期大腸癌的療效，反而增加毒性，糾正了很多醫療同行治療中的失誤，著名醫學專家詹文華教授在文末發表專文給予了高度評價，認為證據充分，結論可信，值得臨床醫生重視。另外，還首次用meta分析的方法證明硝酸甘油軟膏對肛裂的治療有良好效果。
2、在分子診斷技術領域的主要成果包括：
· 發明了Quantitative Allele-specific Real-time Target and Signal Amplification (QuARTS)、Digital Melt Curve Assay（DMC）、Real-time Alu PCR等多項高敏感核酸擴增和檢測技術，可用於高度異源性樣品中疾病相關基因突變和核酸甲基化或非凋亡DNA的檢測。
· 發現了腫瘤特異性甲基化標誌物BMP3基因，通過數千例不同臨床標本的反覆測試，因其對大腸癌檢測的高度特異性和敏感性而被選入新一代糞便核酸檢測，可望用於大腸癌和癌前腺瘤的篩查和早期診斷。
· 發明了MBD Column用於在複雜樣品中富集和純化甲基化組DNA,可以將所有的發生了甲基化的CpG島同時進行富集和純化。
· 發明了Direct Sequence-Specific Capture用於直接從糞水中富集和純化任何目標基因，在此過程中克服了眾多技術難題，該法可將目標基因從糞便等高度異源性樣品中富集超過100倍，並完全去除各種核酸擴增的抑制物，具有快速可靠的特點。
· 對採用糞便核酸檢測作為大腸腫瘤的無創篩查手段的分子基礎、技術路線、產品開發、臨床驗證的各個方面都做出了傑出的貢獻。在此過程中，測試了上百個DNA甲基化、基因突變和蛋白質腫瘤分子標誌物，從中得到了一組對大腸腫瘤檢測高度敏感的分子標誌物；對糞便標本的採集、糞便中人類DNA的保存、抽提、純化、富集等樣品處理的關鍵技術都進行了深入的研究，並取得了突破性的成果；還對以上的各項技術進行了整合、最佳化和臨床驗證。
· 開發了KRAS、BRAF、EGFR等多項腫瘤靶向治療靶點檢測產品，可用於引導抗EGFR分子或抗體對大腸癌和肺癌等惡性腫瘤的治療。
3、在管理方面的主要成果包括：
組建培訓了我現所在的美國分子診斷公司Exact Sciences Corporation的研發團隊，並領導該團隊在相當短的時間內完成了糞便核酸檢測的多項關鍵技術的攻關，順利地進行了產品的前期測試和驗證。
專利和專利申請
1. Detecting methylated mammalian nucleic acid in stool. David A. Ahlquist and Hongzhi Zou. US Patent No. 7,785,772
2. Collecting and processing complex macromolecular mixtures. David A. Ahlquist, Jonathan J. Harrington, Hongzhi Zou, Patrick S. Quint, William R. Taylor. US patent application number: 20100121046
3. Detecting Neoplasm. William R. Taylor, Jonathan J. Harrington, Patrick S. Quint, Hongzhi Zou, Harold R. Bergen, III, David I. Smith, David A. Ahlquist. US patent application number: 20110183328
4. Methods and Materials for Detecting Colorectal Neoplasm. Hongzhi Zou, David Ahlquist, Jonathan J. Harrington. US patent application number: 20110236916
5. Methods and Materials for Detecting Colorectal Cancer and Adenoma. Hongzhi Zou, David Ahlquist. International patent application number: PCT/US2011/029982
6. Real-time cleavage assay. Rebecca Oldham-Haltom, Hongzhi Zou, Graham P. Lidgard, Michael J. Domanico, Hatim Allawi. US patent application number: 20120122105
7. Mutation detection assay. Hongzhi Zou, Graham P. Lidgard, Michael J. Domanico, Hatim Allawi. US patent application number: 20120122106
8. Methylation assay. Hongzhi Zou, Graham P. Lidgard, Michael J. Domanico, Hatim Allawi. US patent application number: 20120122088
9. Digital sequence analysis of DNA methylation. David Ahlquist, William R. Taylor,Hongzhi Zou, Graham P. Lidgard. US patent application number: US 13/364978
10. Isolation of nucleic acid. Janelle J. Bruinsma, Michael J. Domanico, Graham P. Lidgard, Hongzhi Zou, William G. Weisburg, Hemanth D. Shenoi, James P. Light II. US patent application number: 13/470,251
11. Multiplexed Kras Mutation Detection Assay. Hongzhi Zou et al. US patent application number: US 61/548,639
論文發表
1. Hong-Zhi Zou, Bao-Ming Yu, Zhi-Wei Wang, Ji-Yuan Sun, Hui Cang, Fei Gao, Dong Hua Li, Ren Zhao, Guo-Guang Feng, Jing Yi. Detection of Aberrant p16 Methylation in the Serum of Colorectal Cancer Patients. Clin Cancer Res 8:188-191, 2002.
2. Weihua Qiu, Bingsen Zhou,Hongzhi Zou, Xiyong Liu, Peiguo G. Chu, Richard Lopez, Jennifer Shih, Christopher Chung and Yun Yen,Hypermethylation of growth arrest DNA damage-inducible gene 45 beta promoter in human hepatocellular carcinoma. Am J Pathol 165:1689-99, 2004.
3. Hongzhi Zou,Neal K. Osborn, Jonathan J. Harrington, Klatt K. Kristie, Julian R. Molina,Lawrence J. Burgart and David A. Ahlquist. Frequent Methylation of EYA4 gene in Barrett’s Esophagus. Cancer Epidemiol Biomarkers Prev 14(4): 830-4, 2005.
4. Hongzhi Zou,Julian R. Molina,Jonathan J. Harrington, Neal K. Osborn, Kristie K. Klatt, Lawrence J. Burgart,and David A. Ahlquist. Hypermethylation of SFRP Genes in Barrett’s Esophagus. Int J Cancer 116:584-591, 2005.
5. Neal K. Osborn, Hongzhi Zou, Julian R. Molina, Ralf Lesche, Joern Lewin, Kristie K Klatt, Jonathan J Harrington, Lawrence J. Burgart, David A. Ahlquist. Hypermethylation of the EYA4 gene in Chronic Ulcerative Colitis-Associated Dysplasia and Cancer: A Candidate Marker for Surveillence? Clin Gastroenterol Hepatol 4:21-218, 2006.
6. Hongzhi Zou, Jonathan J. Harrington, Kristie K Klatt, and David A. Ahlquist. A sensitive method to quantify human long DNA in stool: relevance to colorectal cancer screening.Cancer Epidemiol Biomarkers Prev 15: 1115-1119, 2006.
7. Hongzhi Zou, Jonathan J. Harrington, Aravind Sugumar, Kristie K. Klatt, David A. Ahlquist. Detection of Colorectal Neoplasia by Stool Defensin Assay: An Exploratory Study. Clin Gastroenterol Hepatol 2007;5(7):865-8.
8. Hongzhi Zou, Jonathan Harrington, Rafaela L. Rego, and David A. Ahlquist. A novel method to capture methylated human DNA in stool: implications for colorectal cancer screening. Clin Chem. 2007;53(9):1646-51.
9. Hongzhi Zou, Jonathan Harrington, Abdirashid M. Shire, Rafaela L. Rego, Megan E. Campbell, Kristie K. Klatt, Ann L. Oberg, and David A. Ahlquist. Highly methylated genes in colorectal neoplasia: implications for screening. Cancer Epidemiol Biomarkers Prev. 2007; 16(12): 2686-96
10. Michelle L. Gumz, Hongzhi Zou, Pamela A. Kreinest, Shauna N. LeGrand, Leandra S. Belmonte, Kevin Wu, , Bruce Luxon, Mala Sinha, Alexander S. Parker , L. Z. Sun, David A. Ahlquist , Christopher G. Wood, and John A. Copland. Loss of Secreted Frizzled- Related Protein 1 (sFRP1) Contributes to the Tumor Phenotype of Clear Cell Renal Cell Carcinoma. Clin Cancer Res. 2007;13(16):4740-9
11. Jin-Ping Lai, Dalbir S. Sandhu, Chunrong Yu, Tao Han, Catherine D. Moser, Kenard K. Jackson, Ruben Bonilla Guerrero, Ileana Aderca, Hajime Isomoto, Megan M. Garrity-Park, Hongzhi Zou, Abdirashid M. Shire, David M. Nagorney, Schuyler O. Sanderson, Alex A. Adjei, Ju-Seog Lee, Snorri S. Thorgeirsson, Lewis R. Roberts. Sulfatase 2 up-regulates glypican 3, promotes fibroblast growth factor signaling, and decreases survival in hepatocellular carcinoma. Hepatology 2008;47:1211-22.
12. Hongzhi Zou*, William R. Taylor, Jonathan J. Harrington,Fareeda Taher Nazer Hussain, Xiaoming Cao, Charles L. Loprinzi,Theodore R. Levine,Douglas K. Rex, Dennis Ahnen,Kandice L. Knigge,Peter Lance, Xuan Jiang,David I. Smith,David A. Ahlquist*. High Detection Rates of Colorectal Neoplasia by Stool DNA Testing with a Novel Digital Melt Curve Assay. Gastroenterology 2009;136:459-70. *Corresponding authors
13. Simon J. Cooper, Hongzhi, Zou, Shauna N. Legrand, Laura A. Marlow, Christina Von Roemeling, Kevin J. Wu, Tapati Maity, Vitaly Margulis; Nadine Hempel; Han W. Tun, Gerard C. Blobe; Christopher G. Wood, John A. Copland. Loss of type III transforming growth factor beta receptor expression is due to methylation silencing of the transcription factor GATA3 in renal cell carcinoma. Oncogene 2010;29:2905-15.
14. David A. Ahlquist, Hongzhi Zou, Michael Domanico, Douglas W. Mahoney, Tracy C. Yab, William R. Taylor, Malinda L. Butz, Stephen N. Thibodeau, Linda Rabeneck, Kenneth W. Kinzler,Bert Vogelstein, Niels Chr. Bjerregaard, Søren Laurberg, Henrik Toft Sørensen, Barry M. Berger, Graham P. Lidgard. Next-Generation Stool DNA Test Accurately Detects Colorectal Cancer or Large Adenomas. Gastroenterology. 2012; 142(2):248-56
15. Hongzhi Zou*, Hatim Allawi, Xiaoming Cao, Mike Domanico, Jonathan Harrington, William Taylor, Tracy Yab, David A. Ahlquist, Graham Lidgard. Quantification of Methylated Markers with a Multiplex Methylation Specific Technology. Clinical Chemistry 2012; 58(2):375-83. *Corresponding author
16. David A. Ahlquist, Karen A. Heichman, William R. Taylor, Douglas W. Mahoney, Hongzhi Zou, Michael Domanico, Steven N. Thibodeau, Lisa A. Boardman, Barry M. Berger, Graham P. Lidgard.The Stool DNA Test Is More Accurate Than the Plasma Septin 9 Test in Detecting Colorectal Neoplasia. Clin Gastroenterol Hepatol. 2012;10(3):272-277
17. Zhiwei Wang, Jing Yi, Hui Cang, Fei Gao, Hongzhi Zou, Baoming Yu, Xueming Tang. P16 methylation of Colorectal Cancer and Association with Dukes Stages. Chin. J Cancer Res., 13: 288-290, 2001.
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