莫力廟修建之初，廟址選定以後，通過本旗卓哩克圖親王將方案報到盟長土謝圖親王處，再由土謝圖親王呈報到理藩院批准，方才破土動工。前後歷時36年，到嘉慶二十五年（1820年）全部竣工。當時理藩院為該寺頒發了九龍金匾，上面用滿、蒙、藏、漢四種文字書寫“集寧寺”廟名。同時還給該寺劃撥100戶百姓，稱之為該寺的伙夫、香火使。1820年中秋節舉行了開光慶典，在慶典上正式懸掛理藩院所賜金匾，並由該廟葛根魯布僧丹巴拉布傑拉然巴講經，授“長壽佛”灌頂。哲盟十旗王公、官吏、活佛、喇嘛、還有眾多百姓信徒一齊聚集在這裡。寺廟的東西兩側，臨時搭起的氈包帳篷形成了長達數華里的五條街，寺廟的大小胡同排滿了朝拜者的長隊。當時的莫力廟，在東蒙古地區成為可與拉薩、塔爾寺、拉布楞寺和五台山相媲美的佛教聖地。
莫力廟的主體建築群為一幢安放本廟歷世活佛“舍日利”廟（靈堂）和朝克沁大殿。大殿是81間的三層樓房，一層供奉著三世佛，佛像前並列著8尊菩薩，後側有十八羅漢。大殿周圍牆腳設定的佛龕內供奉上千尊菩薩。二層供奉著章必勒、蘇律得、觀音以及經卷。三層供奉著千手千眼佛、白金菩薩、文殊菩薩以及金書《甘珠爾》等珍貴經卷，並置有金制佛燈，銀制香爐等精緻器皿。
莫力廟還有集寧寺、福全寺、隆佑寺等12座副寺，僧房500餘間，還有四大學塾畢業者自願修行之所及東西活佛府兩處。清朝發給莫力廟喇嘛度碟580枚，莫力廟香火旺盛時喇嘛多達三千餘人。廟區東西、南北各有8華里長，繞廟一圈有幾十里長，廟內有大街8條，小巷6條。前4條街是5座大殿、4座小廟、兩座活佛府邸和廟倉、庫房，後4條街為僧侶住宿院落。
山門內東西兩側是鐘樓和鼓樓，樓內懸掛著大鐘和巨鼓，還有巨大的四大天王塑像。山門外有蔭庇和石獅一雙、石旗桿一對。還設有跳查瑪舞的場地。莫力廟有自己的廟產。民國年間，莫力廟有地515頃，有蘇魯克畜群13群，有果園、林場、魚塘，還有商業小市。廟裡專門成立了商務管理會，還辦了一所國小，名叫草力廟自立完全國小。廟裡給學校撥了6頃地，以其收入維持學校的一切費用。廟裡的金條、元寶、錢幣、玉石、珠寶、綢緞多得無法計數。
莫力廟前後共四世葛根坐床，他們都是親赴西藏學習，由達賴或班禪賜給法號的高僧。第一世葛根瓦其爾阿拉木斯，被九世達賴授予“班第達”稱號，賜給他玉佛冠一頂，並為他取法名“魯希僧丹巴拉布傑”。第二世葛根沙金朝克圖，經達賴、班禪認定，後赴西藏由達賴、班禪受戒，取法名魯布僧丹比扎拉僧。第三世葛根生於貴族根棟扎布家中，18歲赴西藏，被達賴賜予“班第達”法名，但這位葛根並沒在莫力廟住持，他在西藏學習期間死於拉薩。第四世葛根那仁滿都拉，14歲赴西藏，達賴喇嘛賜給他阿旺圖布登的法名，阿旺圖布登葛根從西藏返回，途經北京，正值袁世凱執掌民國大權。袁氏在接見他時，將莫力廟葛根原來由清政府賜給的“額爾德尼斯欽堪布葛根”又提升一級，加封為“額爾德尼斯欽諾門汗葛根”。
1932年，在日本軍國主義者的策劃下，由甘珠爾扎布、包善一、韓舍旺等人發起，成立一支以分裂祖國為目的的“內蒙自治軍”。這年冬天，“內蒙自治軍”進駐莫力廟。這個訊息傳到南京國民政府，南京政府立即電令熱河軍隊十七旅司令崔興武部李守信、胡寶山團，共一萬多步騎部隊，將莫力廟團團圍住。“內蒙自治軍”很快便被打敗，司令甘珠爾扎布率殘部逃走。十七旅占領莫力廟後，大肆搶掠，將該廟幾百年來積攢的金錢寶物洗劫一空。十七旅在莫力廟住了一個多月，然後帶著掠奪的財物返回熱河。
莫力廟遭此洗劫之後，又遇天災，當年發生鼠疫，800多名喇嘛有300多名染病死亡。從此，該廟一撅不振，再也興旺不起來了。後來，日本人為了在精神上征服中國老百姓，在東蒙地區各廟都派駐了披著喇嘛外衣的特務，名義上是來研究蒙古喇嘛教，實則幹著刺探情報的勾當。莫力廟的日本喇嘛是太田覺眠。“八一五”光復後，這些日本喇嘛倉惶逃走。
中華人民共和國成立後，一部分喇嘛還俗成家立業，一部分喇嘛在廟北辦起農牧場（俗稱喇嘛窩鋪），開荒種地，放牧牲畜，自食其力。在“文化大革命”中，這座聞名遐爾的廟宇被夷為平地。
