色相
由於透明油墨的透明度很高，印刷後一般都複合鍍鋁膜，使鋁膜的光澤與油墨的光澤相互結合，反射出較為鮮艷的色彩。而且，採用透明油墨印刷的產品，從不同的角度觀看，色相會有較明顯的變化，在不同的光源下觀察差別會更大一些。所以，在調配這類油墨時，一定要了解客戶複合什麼材料，以便按相同的工藝調配油墨，並在相似的環境下觀察油墨的色相。比如有些油墨複合前的色相很接近標準樣，但複合後色相可能會相差很遠；反之，也有一些油墨印刷後的色相雖然與標準樣有一定的差距，但複合後其色相更接近標準樣。透明油墨的色相調配是非常費力的，所以，清楚客戶的工藝非常重要。
透明度
透明油墨的透明度由染料(顏料)和連結料(包含助劑)兩部分決定，而且前者起主要作用，後者的影響很小。就聚氨酯、聚醯胺、氯化聚丙烯這幾類常見的樹脂製成的油墨而言，聚氨酯油墨的透明度較高。一般來說，以染料為著色劑的油墨，其透明度比以顏料為著色劑的油墨的透明度要高。有時由於其他方面的需要，也會在染料中混合使用部分顏料，此時油墨的透明度會有所降低。
殘留異味
細心的操作者會發現，透明油墨的乾燥速度明顯較慢，這是因為透明油墨的固含量低(由於染料比顏料的色濃度高，所以用量無須太多)，溶劑含量高，所以需要對其乾燥狀況加以控制，否則很容易造成殘留溶劑超標，並產生異味。嚴重時，複合後溶劑還會慢慢向四周滲透、擴散，使其他顏色發生變色。所以，在使用此類透明油墨時一定要注意溶劑配比和印刷速度的控制，印刷後再放入40℃左右的熟化室中熟化10多個小時。
溶解
透明油墨中所用的染料是完全溶於有機溶劑的，所以當印刷品與複合用膠黏劑發生接觸時，膠黏劑中的溶劑就會將印刷品上的透明油墨或多或少地溶解掉。提高複合速度或者提高膠黏劑的黏度，可以在一定程度上緩解此問題，但也只是治標不治本。另外，如果透明度允許適當降低，可以在染料中添加部分顏料來製造透明油墨，這對透明油墨的溶解問題也有一定的改善。此外，針對上述難題，有些油墨廠已經開發出了完全不溶於醇溶性膠黏劑的透明油墨，並在某些印刷材料上得到了很好的套用，相信今後也會開發出不溶於酯溶性膠黏劑的透明油墨。
剝離強度
透明油墨印刷後的產品在複合鍍鋁膜時經常發生剝離強度差的問題。為什麼會這樣？其實，並不僅僅是透明油墨存在這個問題，當採用其他油墨進行印刷時，如果不印刷白墨襯底，在複合鍍鋁膜(特別是VMCPP)後也會出現剝離強度差的現象，只不過平時用其他油墨印刷時很少採用這種工藝，所以極少發現剝離強度差的現象。當然，並不是說所有的複合油墨都存在這個問題。
