藤原系近藤氏
近藤氏源於藤原氏，是日本平安時代的名將藤原秀鄉的後裔，也有說源於同時代的另一名將藤原利仁之家系。目前流傳著這樣兩張家系圖：
秀郷流說藤原秀郷━千常━文脩━文行━脩行(近藤)━行景━景親━景頼━能成(近藤太）
利仁流說
藤原利仁━敘用━吉信━伊博━公則━則経━則明━惟峯━惟重━貞成(近藤武者)━能成(近藤太)
可以看出，近藤這個姓氏最早發端於藤原秀鄉的玄孫藤原修行一代，但根據持藤原利仁家系說觀點的第二張圖來看，近藤姓氏的發源是從藤原利仁的八世孫藤原貞成開始的。但毫無疑問，近藤姓氏真正成為日本顯赫的望族，是從藤原能成（近藤能成）這一代開始的。豐後國大名大友能直是近藤能成之子，因為其父當過古莊鄉司（官職名），故一度以“古莊”作為自己的苗字（姓氏），後來恢復了本姓近藤。由於這位近藤能直的母親是丹波國大名波多野經家之女，他繼承了外祖父波多野經家的領地--相模國大友鄉，從此以地名為姓，改姓大友。說來也比較富有戲劇性，大友能直終其一生，改姓幾乎成了家常便飯，後來他被鎌倉時期執權之一中原親能收為養子，又改名為中原能直。一生之中四度改姓，也算是空前絕後了。不得不說的是，這位四易其姓的大友能直，後來在建久七年（宋慶元三年，1196）被鎌倉幕府封為豐前、豐後兩國守護，從此將豐後國作為自己世世代代賴以生存的大本營，他就是豐後大友氏的初代家督，也就是後來的戰國名將大友宗麟的遠祖。
除了近藤能直（大友能直）這一脈後來發展成極富實力的大名直到戰國時代之外，作為四國藤原氏當中大家的近藤氏，後來在近藤京帝的主持下，於阿波國西部築白地城，並改姓大西氏，以三好郡為中心，其勢力不斷膨脹，直到戰國時代，才在長宗我部元親的不斷攻擊下日漸衰落下去。但近藤氏的後人反而在幕末時代的土佐藩大放異彩，相信很多人都聽過近藤長次郎這個名字，他便是這其中最知名的人物之一。到了當代，著名的歌手兼聲優水樹奈奈（本姓近藤）和她的妹妹Daisy×Daisy主唱近藤美香，也是四國近藤氏後人當中較為知名者。
遠江系近藤氏
遠江近藤家本據在遠江國引佐郡，是戰國時代駿河大名今川氏麾下的國人眾之一。永祿11年（明嘉靖四十七年，1568）德川家康進攻遠江時投向德川方，其家督近藤秀用因立功頗多，受到家康的賞識，因此把他派到“德川四天王”之一的井伊直政手下擔任副將。近藤秀用晚年受封為大名，成為遠江國井伊谷藩藩主，但是，為了將其位於濱名湖北岸的土地分配給其子孫，宗家僅僅保留了1萬石領地，因此實際上近藤家已經被降為德川家的旗本身份。近藤秀用不僅是井伊谷藩的初代藩主，也是唯一的一代藩主。
劍術流派
劍術流派--天然理心流
近藤這個姓氏是幕末時代天然理心流的通用苗字。天然理心流創始人為遠州（遠江）人近藤內藏助裕長。據說近藤內藏助本是古流武術--天真正傳香取神道流的傳人，後來將此流派武術加以自己的理解，於寬政元年（清乾隆五十四年，1789）創立了天然理心流。所以也有說法把天真正傳香取神道流當作是天然理心流的遠祖。
近藤勇毫無疑問是天然理心流當中最具有影響力的人物。如果把新選組稱為“壬生之狼”，那么，天然理心流劍術無疑就是銳利的狼牙了。他和沖田總司,土方歲三這三位新選組核心人物皆為天然理心流門人。歷史上的近藤氏出過很多名人，但是無論是誰，其影響力都不能和近藤勇相提並論。
