數學與計算機科學學院創建於1958年，學院建校時命名為數理科。1985年改名為數學系，開始招收數學專業本科生。1992年再增設計算機教育、財務會計（該專業1999年轉入當時新設立的工商管理系）等專業。1995年增設計算機本科專業，從此更名為數學與計算機系。2000年後，相繼增設信息與計算科學、網路工程和軟體工程等本科專業；2006年命名為數學與計算機科學學院。
學院現有在校研究生和本科學生1571人；設有數學一級學科、數學課程與教學論、教育碩士（數學）三個碩士點，數學與套用數學、信息與計算科學、計算機科學與技術、網路工程、軟體工程等五個全日制本科專業。其中數學與套用數學、計算機科學與技術為江西省品牌專業。數學與套用數學為江西省特色專業，擁有江西省計算機專業“服務外包人才”培養模式創新實驗區。
學院設有數學與套用數學、信息與計算科學、計算機科學與技術、網路工程、軟體工程、高等數學與數學教育、信息技術教育等七個教研室。全院現有教職員工82人，教授12人，副教授24人，博士33人，碩士學位以上教職工達到94%。
學院擁有江西省計算機實驗教學示範中心，下設計算機軟體、計算機硬體、計算機多媒體、計算機網路、數學建模等實驗室，面積達7000多平方米，資產達1000餘萬元。
學院資料室擁有專業藏書50000餘冊，每年訂有雜誌100餘種。專業教學資料充裕，面向全院師生開放。
學院擁有江西省數值模擬與仿真技術重點實驗室。其中基礎數學為江西省“十五”、“十一五”重點學科；計算機軟體與理論為校級重點建設學科。
“全國高校大學生數學建模競賽贛南師範學院領導小組辦公室”、“全國計算機等級考試贛南師範學院考點辦公室”、“江西省初等數學研究會”、“贛州市數學學會”等組織機構掛靠在學院。
