基本概念：
質譜流式細胞技術（Mass Cytometry）是利用質譜原理對單細胞進行多參數檢測的流式技術。它繼承了傳統流式細胞儀的高速分析的特點，又具有質譜檢測的高分辨能力，是流式細胞技術一個新的發展方向。
基本原理：
傳統流式細胞技術和質譜流式細胞技術相比，主要有兩點不同：第一、標籤系統的不同，前者主要使用各種螢光基團作為抗體的標籤，後者則使用各種金屬元素作為標籤；第二、檢測系統的不同，前者使用雷射器和光電倍增管作為檢測手段，而後者使用ICP質譜技術作為檢測手段。
如圖中所示，用金屬標籤抗體標記的細胞進入質譜流式細胞儀後，逐個通過ICP質譜檢測裝置，然後對每個細胞中各種金屬標籤進行定量檢測，進而得知每個細胞中各目標蛋白的含量 。
技術優勢：
螢光基團發射光譜一般比較寬，其間往往會發生重疊，會帶來一些問題：一方面限制了檢測通道的數量（<20個）；另一方面，它會帶來嚴重的串色問題，很多通道的信號需要複雜的補償計算。由於利用ICP質譜作為檢測手段，與傳統流式細胞技術相比，質譜流式細胞技術具有以下優勢 ：
第一、通道數量增加到上百個
質譜流式細胞儀中的ICP質譜裝置具有非常寬的原子量檢測範圍（88～210Da），因此可以同時檢測上百個不同的參數。
第二、通道間無干擾，無需計算補償
ICP質譜具有超高的分辨能力，可以完全區分開用來標記的各種元素（如右圖所示）。實驗數據表明，其相鄰通道間的干擾<0.3%，基本可以忽略不計，無需計算補償。這樣不僅使實驗流程得到簡化，也節約了標本和試劑。
第三、金屬標籤數量多，並具有極低的背景
用來作為標籤的金屬元素在細胞中的含量極低，而金屬標籤與細胞組分的非特異性結合能力極低，所以信號的背景極低。目前用來標記抗體的金屬標籤有30多種，隨著技術進步，更多元素可以用來作為標籤，其種類會進一步增加。
第四、多樣化的數據處理方式，實現對樣品的深入分析 。
質譜流式細胞儀通道數量的激增帶來信息量的成倍增長。傳統的流式分析方法已經不能完全滿足需要，所以需要對數據進行各種降維處理，提取出其中包含的有用的生物學信息。常用的分析方法有：SPADE、PCA、viSNE以及Gemstone等。
套用領域：
質譜流式細胞技術可以實現對細胞群體進行精準的免疫分型，對細胞內信號傳導網路進行全面的分析，分析細胞亞群之間的功能聯繫，以及對於大量樣品的高通量多參數檢測。在造血、免疫、幹細胞、癌症以及藥物篩選等多個領域的研究有著廣泛的套用前景 。
發展現狀：
目前，質譜流式技術還處於起步階段，美國DVS Sciences公司研發的質譜流式細胞儀已經發展到第二代，即CyTOF2 質譜流式細胞儀（CyTOF2 Mass Cytometer）。在國內，這一技術尚屬空白，東勝創新正在進行相關的技術推廣 。
