公司具有依法制定的嚴格章程，有健全、完善的管理機構，實行董事會領導下的總經理負責制。下設工程部、生產部、質檢部、供應部、銷售部、企劃部、項目開發部、財務部、行政人事部、GMP小組等九個二級機構，管理結構合理精幹，工作效率高。公司領導班子政策和專業水平較高，有著“高瞻遠矚、高屋建瓴”的領導能力，有較強開拓創新精神，有超前意識，決策有深度和遠見，在同行業中有較強競爭力。
公司自1995年成立以來，始終堅持“興民族醫藥，創萬勝未來”的企業理念，立足本地區得天獨厚的中藥材資源，不斷挖掘和開發具有數千年歷史的苗族醫藥產品，並以現代科技創新苗藥、打造品牌苗藥為企業使命，將苗藥獨特配方與傳統工藝結合現代先進的生產技術，研製出苗藥複方胃痛膠囊、九味痔瘡膠囊、傷痛克酊、化風丹、首烏延壽片、婦科止帶片、生精片、四方胃痛膠囊、止咳寧嗽膠囊等國藥準字產品9個和美麗九九膠囊、蜂皇仙草膠囊等食準字產品8個。其中，複方胃痛膠囊、九味痔瘡膠囊、化風丹等產品擁有自主智慧財產權，為全國獨家品種。化風丹還被列入國家級非物質文化遺產名錄，具有較強的市場競爭力。2006年“九味痔瘡膠囊”被國家科技部等四部委評定為“國家級重點新產品”，2008年“化風丹”又被評定為“國家級重點新產品”，化風丹、九味痔瘡膠囊、傷痛克酊被授予“中華名藥”稱號。
此外，萬勝藥業在2004年和2006年相繼註冊了遵義天裕生物科技有限責任公司和遵義咖美酒業商貿有限公司，為了拓展企業經營範圍及公司可持續發展，公司不斷創新，研製出多個保健食品和系列新型營養健康酒。
貴州萬勝藥業遵循現代企業的發展思路。大力強強渠道建設和市場終端的服務，完善市場保護體系；加強企業自身文化建設和員工隊伍建設，公司極為關注和參與各種社會活動，提升企業形象的同時不斷為廣大消費者提供優質高效的產品，以良好的品質回報社會。此外，萬勝藥業多方吸納人才，完善用人機制，把公司建設成為全國最大的苗藥生產品牌企業。
