歷史沿革:成立於1960年,系農業部所屬全國性柑桔科學研究專業機構。2001年9月起由中國農業科學院與西南農業大學共建。2005年7月由中國農業科學院與西南大學(由原西南師範大學與西南農業大學合併組建)共建該所,在保留原中國農業科學院柑桔研究所名稱同時,成立西南大學柑桔研究所。
科研平台:農業部柑桔及苗木質量監督檢驗測試中心,國家柑桔工程技術研究中心,國家柑桔品種改良中心,國家柑桔苗木脫毒中心,國家果樹種質重慶柑桔圃,國家柑桔加工技術研發分中心,國家柑桔野外觀測台站,柑桔教育部工程研究中心,柑桔學重慶市市級重點實驗室,重慶市植物病害生物學重點實驗室,重慶市柑桔危險性有害生物檢測鑑定中心,重慶市柑桔工程技術研究中心,農業部柑桔病蟲害防控功能研究室,農業部柑桔栽培與耕作功能研究室,中國農業科學院柑桔學重點開放實驗室。
農業部柑桔及苗木質量監督檢驗測試中心於1991年由農業部(1991)農(質)字第60號文批准組建。中心1995年7月首次通過國家計量認證和農業部機構審查認可,批准對外開展柑桔苗木、柑桔鮮果及加工產品質量監督檢驗測試工作。2003年4月經農業部批准成為無公害農產品定點檢驗機構。2008年12月經農業部批准成為農產品質量安全檢測機構。2008年12月由農業部農產品質量安全中心批准成為全國農產品地理標誌產品品質鑑定檢測機構。2001年6月、2006年11月和2010年1月先後3次通過國家計量認證(資質認定)和農業部機構審查認可及農產品機構考核複查評審。中心主要開展柑桔全程質量安全控制技術研發;柑桔質量安全檢測技術研究;柑桔質量安全標準制訂;柑桔溯源檢測技術研究;新型分離介質研發及其在農藥檢測中的套用。中心擁有柑桔農產品質量安全檢測用儀器設備100多台套,總值2000萬元,其中價值10萬元以精密儀器設備31台套,30萬元以上儀器設備有19台(套),擁有氣相色譜儀(HPLC)、液相色譜儀(GC)、氣-質聯用儀、液相色譜-質譜-質譜聯用儀、氣相色譜-質譜-質譜聯用儀、等離子發射光譜-質譜儀、離子色譜儀、胺基酸分析儀、毛細管電泳儀、全自動微生物檢定儀、原子吸收光譜儀、原子螢光儀、近紅外分析光譜儀等19台套檢驗測試儀器設備;擁有超臨界CO2萃取儀、高速大容量冷凍離心機、旋轉蒸發濃縮儀、超音波清洗器、均質器、全自動固相萃取儀、水浴氮吹儀、切割式研磨機、臼式研磨機、大容量搖瓶機等30多台套樣品製備和前處理儀器設備。
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