歷史沿革
學術論壇1950年，唐山交通大學（現西南交通大學）化工系成立。
1952年，全國高校院系調整，化工系主體調整至天津大學，保留部分組建化學教研室，承擔全校工科化學基礎課教學。
2000年，西南交通大學隸屬關係由原鐵道部劃歸教育部直屬以後，學校拓寬學科專業面，並以國家西部大開發戰略和生物醫藥產業迅速發展為契機，依託西部生物資源和中藥產業優勢，在原化學教研室基礎上設立了西南交通大學生物工程系。
2002年，學校在峨嵋校區設立了西南交通大學藥學院（籌）。
2005年，西南交通大學生物工程系更名為西南交通大學生物工程學院。
2008年7月，根據學校學科最佳化與調整方案，生物工程學院與藥學院（籌）合併組建西南交通大學生命科學與工程學院。
辦學條件
院系專業
據2018年2月學院官網顯示，學院開設3個系、開辦2個本科專業（包含5個專業方向）。
| 院系名稱 | 本科專業 |
| 化學化工系 | -------- |
| 生物工程系 | 生物工程類（生物工程製藥、生物學、生物信息技術） |
| 藥學系 | 製藥工程類（中藥製藥、化學製藥） |
學科建設
畢業截至2016年7月，學院擁有3個學術學位一級學科碩士點、3個學術學位二級學科碩士點、2個專業碩士學位領域。
據2018年2月學院官網顯示，學院依託材料科學與工程博士點（創新藥物與載體材料方向）招收博士生。
學院生物學科專業教師的研究領域與研究方向覆蓋“生物信息學”、“生物化學與分子生物學”、“植物學”、“微生物學”、“遺傳學”、“發育生物學”、“細胞生物學”、“生態學”等二級學科，並與醫學、農學、工學等大類學科交叉、融合。
學術學位一級學科碩士點：藥學、中藥學、化學工程與技術
學術學位二級學科碩士點：生物化學與分子生物學、微生物與生化藥學、生物化工
專業碩士學位領域：生物工程、製藥工程
師資力量
據2018年2月學院官網顯示，學院共有教職工近100人，其中專任教師70餘人，其中中國科學院院士（雙聘）1名，長江學者、國家傑出青年基金獲得者1名，教授13人，副教授36人，60%以上的教師具有博士學位，50%以上的教師具有國外學習或工作的經歷。
中國科學院院士（雙聘）：隋森芳
長江學者特聘教授：李衛東
國家傑出青年基金獲得者：李衛東
教學建設
據2018年2月學院官網顯示，學院擁有1個四川省特色專業，生物工程專業與美國喬治亞州立大學設立（3+1）有本科教育培養項目，與美國喬治亞州立大學設立（1+2）研究生聯合培養項目。
四川省特色專業：生物工程
學術研究
科研平台
國家交流據2018年2月學院官網顯示，學院實驗室總面積約6000平方米，各種科研儀器設備3500餘台套，儀器設備總資產合計約3500萬元。
截至2016年7月，學院擁有1個國家中醫藥管理局二級實驗室，開設4個研究所、5個研究團隊。
國家中醫藥管理局二級實驗室：國家中醫藥管理局中藥化學二級實驗室
學院研究所：中藥學研究所、套用化學研究所、生物工程研究所、生物化學與分子生物學研究所
學院研究團隊：小分子創新藥物研究團隊、重大疾病新藥創製團隊、生物信息與功能基因組學研究團隊、生物技術製藥及載藥納米材料團隊、抗感染防治新策略團隊
科研成果
據2018年2月學院官網顯示，學院在天然藥物研究方面，系統研究了厚朴、蜘蛛香、峨參、蓽撥、山胡椒屬植物等一批天然藥用植物的化學成分、作用機理等，獲得了十餘項發明專利，並得到了國家科技部“重大新藥創製”等項目的資助；在生物製藥方面，獲得具有強抗癌作用的小分子多肽（自主智慧財產權）研究成果；與企業合作，聯合開發具有多種功效的民間中藥產品，相關產品已獲得地方消字號批文，並進入了實際生產和銷售，衍生產品即將獲得醫院製劑批文；研究了多種微生物及其代謝產物的治療及保健作用，獲得國家自然科學基金的資助；開展了蛋白類藥物結腸釋放劑型的研究，成功合成了這類劑型所需的包裹材料；主持或承擔包括國家自然科學基金、國家863、973、國家科技基礎條件平台、四川省科技廳、省中醫藥管理局等國家和省部級項目以及橫向各類項目。
2017年，獲國家自然科學基金立項資助8項，其中面上項目3項，青年基金5項，資助經費307.5萬元。
文化傳統
形象標識
院徽院徽由一個實驗瓶里長著一顆小樹的圖案構成，寓意對生命科學的研究。1896是交大的創建時間。
精神文化
交大精神：竢實揚華，自強不息
學校傳統：嚴謹治學、嚴格要求
體育活動現任領導
| 職務 | 姓名 |
| 院長 | 李衛東 |
| 黨委書記 | 任平弟 |
| 黨委副書記、紀委書記、工會主席 | 羅妍妍 |
| 副院長 | 李遂焰 |
| 閆智勇 | |
| 封順 | |
| 高峰 |
