科研工作
已主持和參加各級科研課題13項，作為主要參加和完成人獲得省、廳級科研獎勵 4項，科研成果6項。在國內外期刊上已發表科研論文35篇。已參編著作4部，其中副主編2部。
研究方向
1.環境生理學：研究環境應激對動物生理生化、生產性能、神經內分泌及免疫功能變化的影響及其機制，以及如何預防應激。
2.神經生殖免疫：生殖免疫是生殖生物學研究的熱點，這方面研究結果對人類生殖健康及相關疾病的預防有重要意義。主要研究神經對生殖免疫的影響及其機制，通過組織化學、細胞和分子生物學技術研究神經對在生殖周期和妊娠早期動物生殖器官內免疫細胞和相關細胞因子表達變化的影響，進而研究其與胚胎髮育及著床、妊娠的關係。
科研項目
羊垂體GnRH受體的表達及其調節. 校博士後資金
葡聚糖對貴妃雛雞抗應激和免疫功能及HSP70表達的影響. 省優秀中青年科學家科研獎勵基金項目（2008BS07013）
動物垂體發育和促性腺激素分泌的細胞和分子機理（30630011）. 國家自然基金（重點）
山羊分娩期子宮頸成纖維細胞分化為脂肪細胞及其PGE2與其受體研究. 省自然基金項目
植物性神經對子宮肥大細胞功能的調節及其機制研究. 省自然基金項目(ZR2010CM052)
科研成果和獎勵：
1.寒冷地區動物神經內分泌的研究， 黑龍江省教委科技進步三等獎（第三完成人）
2.幼畜、雛雞抗寒促生長劑的研究， 黑龍江省教育委員會科技進步二等獎、黑龍江科技廳科技進步三等獎（第三完成人）
3.動物在冷應激和冷適應下，血液生化指標的動態變化研究， 國際先進，獲黑龍江高校科技進步獎（第二完成人）
4.禽腦幹神經核團細胞構築及5-羥色胺分布的免疫組化研究， 國內領先（第二完成人）
5.冷應激作用強度和時間對珍禽免疫力的影響，國內先進（第二完成人）
6.黑龍江農區奶牛飼養環境與生理機能及生產性能關係的研究，國內領先（第三完成人）
發表文章
袁學軍， 黃麗波. 冷應激對貴妃雛雞外周血白細胞分類及T淋巴細胞變化的影響. 黑龍江畜牧獸醫，2008，7：65-66
黃麗波, 袁學軍, 李冬野, 劉濟五. 家禽動眼神經核簇的細胞構築及其5-HT神經元的分布. 中國獸醫學報, 2006, 26(6):660-661
袁學軍，丁航，吳海燕，張愛忠， 靳銳. 糖萜素對貴妃母雞消化器官中肥大細胞數的影響. 糧食與飼料工業， 2003，5：29-30
袁學軍，王成，李林，丁航，吳海燕，張愛忠，靳銳. 糖萜素對貴妃雞部分免疫器官中肥大細胞數目變化的影響. 黑龍江八一農墾大學學報，2002，14(4)：38-40
袁學軍，牛靜華，吳海燕，徐洪鑫，李義春，孫秀軍. 冷應激對伊褐紅公雛雞外周血淋巴細胞數目變化的影響. 黑龍江八一農墾大學學報，2002， 14(1)：61-63
李士澤，袁學軍，楊玉英，李狀元，楊煥民，苗樹君. 不同環境溫度對泌乳奶牛乳清中某些生化成分的影響. 中國草食動物，2002， 22(2): 2-5
李士澤，袁學軍，楊玉英，楊煥民，靳銳. 冷暴露對健康雛雞某些血液生化指標及胃腸道黏膜充血的影響. 中國套用生理學雜誌， 2002，18(2):148
黃麗波， 袁學軍， 劉濟五. 北京鴨中腦網狀結構內神經核團的形態學與細胞構築研究（一）. 神經解剖學雜誌， 2002，18（3）：259-261
黃麗波， 袁學軍， 劉濟五. 北京鴨中腦網狀結構內神經核團的形態學與細胞構築研究（二）. 神經解剖學雜誌， 2002，18（3）：262-264
黃麗波. 袁學軍. 雌性生殖道內神經支配及相關功能探討. 黑龍江畜牧獸醫，2001，230（3）：15-16
李士澤，袁學軍，楊玉英，史光華，楊煥民，靳銳. 浸水冷應激對雛雞某些酶活性及消化道黏膜充血的影響. 套用與環境生物學報，2001,7(3):267-270
袁學軍，李士澤，靳銳，郎宜林，劉淑君，姜莉莉，李榮霞，張宏. 冷應激對雛雞沙門氏桿菌感染的影響初報. 黑龍江畜牧獸醫，2001，3：29
袁學軍，喬惠理. 支配子宮的植物性神經對子宮免疫的影響 Ⅰ.切斷支配子宮植物性神經對SD大鼠子宮肥大細胞的影響. 中國獸醫學報，2000，20（3）：290-292
袁學軍，喬惠理. 支配子宮的植物性神經和肥大細胞與子宮免疫的關係. 動物醫學進展，2000，3：25-271
袁學軍，喬惠理. 支配子宮的植物性神經對子宮免疫的影響 Ⅱ. 支配子宮的植物性神經對Wistar大鼠著床及子宮肥大細胞的影響. 中國獸醫學報，2000，20（5）：477～478
| 主要著作:: 主編 動物生物化學（普通高等教育十二五規劃教材），清華大學出版社，2013 主編 動物生物化學實驗（普通高等教育十二五規劃教材），清華大學出版社，2013 副主編 免疫學基礎（普通高等教育"十二五"規劃教材），科學出版社，2012 參編 動物生物化學習題集（十一五國家級規劃教材配套習題集），中國農業大學出版社，2008 |
