螺旋—環—螺旋

螺旋—環—螺旋（helix-loop-helix)是一種DNA結合蛋白的共同特性是具有一些與DNA結合的螺旋區，並能形成二聚體。

基序由40～50個胺基酸組成，含有2個兩親的(amphipathic，既有極性基也有非極性基)。螺旋，由2個長度不等的連線區(環)相連。通過兩條螺旋對應位置上的疏水性胺基酸殘基之間的相互作用，可以生成同源二聚體或異源二聚體。每個螺旋區長15～16個胺基酸，其中有幾個胺基酸殘基是保守的。兩個螺旋區之間的環使兩個螺旋區可以彼此獨立地相互作用。大部分HLH蛋白的HLH基序旁邊都有一段高度鹼性的胺基酸序列，這是同DNA結合所需。在15個胺基酸組成的序列中有6個保守的胺基酸殘基，含有這一段胺基酸序列的HLH蛋白質稱為bHLH蛋白質。例如，E12和E47兩種bHLH蛋白質，結合在免疫球蛋白基因的增強子上；轉錄因子MYOD和MYF—5參與肌肉生成。bHLH蛋白質可分為兩類：一類遍布於各種組織，如哺乳動物的E12/E47和果蠅的da；另一類只存在於某種組織，包括哺乳動物的MYOD和果蠅的AC-S。