訪美期間參與美國國家科學基金NSF項目1項，美國德州交通運輸部項目2項，美國陸軍工程師集團項目1項；目前主持/參與國家自然科學基金面上項目2項、青年基金1項；國家“十二五”科技支撐計畫課題1項；江蘇省基礎研究計畫（自然科學基金）重點項目1項；江蘇省交通科學研究計畫項目課題多項。
近五年在本專業領域的權威雜誌/核心刊物發表論文49篇， SCI收錄16篇、EI收錄31篇、ISTP收錄2篇。其中第1作者SCI收錄論文14篇。第1發明人獲得授權國家發明專利4項，授權實用新型專利6項，另已公開發明專利18項。計算機軟體著作權授權7項。
現任美國交通研究委員會（TRB）岩土測試專業委員會（AFS20）委員、國際土力學與岩土工程協會會員、中國土木工程學會會員、國際工程地質和環境協會IAEG國際會員。任國際權威學術刊物《ASCE：Journal of Geotechnical and Geoenvironmental Engineering》、《ASCE：Journal of Materials in Civil Engineering》、《Engineering Geology》、《TRB: Journal of the Transportation Research Board》，國核心心學術刊物《岩土工程學報》等特約審稿人。
榮獲2012年度全國百篇優秀博士論文獎，2011年江蘇省優秀博士論文。獲2010年教育部科技進步一等獎，獲2010年中國公路學會科技進步三等獎，2010年南京市科技進步二等獎。獲2008-2010年度中國建築學會優秀學術論文一等獎。
蔡國軍博士積極參與國際交流，受邀赴中國台北、美國、義大利、巴西等參加國際學術會議十餘次，代表課題組劉松玉教授做大會特邀報告或主題報告，受到國際與會專家的一致好評。
