概述
葉綠體的蛋白質定向轉運葉綠體大約含2000-2500種蛋白，葉綠體基因組編碼的不足100種，因此大量的蛋白質也是由核基因編碼，在細胞質中合成，然後定向轉運到葉綠體。
葉綠體蛋白的轉運機理與線粒體的相似。如：通常前體蛋白N端具有信號序列，完成轉運後被信號肽酶切除，和線粒體一樣發生後轉譯；每一種膜上有特定的轉位因子；內外膜具有接觸點（contactsite）；需要能量，同樣利用ATP和質子動力勢。但是兩者的蛋白質轉運體系中除了某些hsp分子相同外，轉位因子複合體是不同的。葉綠體外膜的轉位因子被稱為TOC複合體，內膜的轉位因子被稱為TIC複合體。
轉運過程
葉綠體有6個區隔：①外膜、②膜間隙、③內膜、④基質、⑤類囊體膜、⑥類囊體腔。因此葉綠體的蛋白轉運途徑更複雜一些。
葉綠體前體蛋白的N端信號序列長度為20－150個胺基酸殘基，同一植物不同前體蛋白的N端序列不具有同源性，分為3個部分：N端缺乏帶正電荷的胺基酸，以及甘氨酸和脯氨酸；C端形成兩性β摺疊；中間富含羥基化的胺基酸，如絲氨酸和蘇氨酸。
轉運到葉基質的前體蛋白具有典型的N端序列。轉運到葉綠體內膜和類囊體的前體蛋白含有兩個N端信號序列，第一個被切除後，暴露出第二個信號序列，將蛋白導向內膜或類囊體膜（圖7-30）。轉運到葉綠體外膜上的蛋白分兩類：一類含內部信號序列；另一類蛋白的N端序列被切除後，其後的停止轉移序列使蛋白質定位在外膜。
