院區概況
由於歷經百年，故校舍建築經多次改建與變遷。目前院區內，存有三個不同時期的建築物，分別為日據時代的二號館，藥學館及藥理館；二次大戰後的藥理實驗室、聯合教學館、圓形教室以及男二與女六宿舍；最後為整建後的建築物基礎醫學大樓及診斷治療大樓等。不同時期的建築各展現其不同的特色及風貌。
歷史發展
1971 年始奉教育部命令，將醫科更名為醫學系。 2000 年 12 月正式成立醫學系辦公室，負責醫學系的系務、招生、學生事務及教學協調，強化對學生的照顧，並協助醫學教育改革的持續推展。
歷任院長
杜聰明
第一任暨第三任院長杜聰明（ 1945.12-1947.3 ； 1948.7-1953.7 ）
杜聰明1922年京都帝國大學授與醫學博士，是日本帝大首次得到醫學博士的外籍人士，亦首開台灣第一位醫學博士，時人以“北有杜聰明”來稱頌這位青年俊彥。於1922年10月，自京都返台任醫事教授，是台灣蛇毒、鴉片癮者的統計及中藥研究的權威。
台灣光復後，杜博士兩度受聘為台大醫學院院長，在台灣大學增設藥學系及牙醫學系，以培養醫藥人才貢獻卓著。秉著其一貫精神，以“藥學至上，研究第一”的態度專心致力醫學教育工作，擬定台灣醫學教育制度，並認為學人應抱有樂學至上，研究第一的求知精神。對學生除採取嚴格管理外，更極力愛護，儘量與學生接觸，聽取意見，給予幫助。
嚴智鍾在師資延聘方面，儘量留用優秀的教授，並創設慰靈公祭表示對遺體捐贈者的追悼及感謝。杜博士對醫界有深厚的期望，希望醫界同仁以醫學的學習為快樂，認識史懷哲 先生主張的“生命之畏敬，生命之尊嚴”，對任何生命都要敬重，不管貧富、地位高低及送禮之有無，以同樣的仁心，盡其所能來治療其病苦，對醫學的研究以真摯的治學態度，發揮專長來促進醫學之進步及增進人類之健康。
嚴智鍾
第二任院長嚴智鍾（ 1947.4-1948.6 ）
魏火曜1915年日本東京帝大醫學士畢業，曾任北京傳染病院院長，軍政部軍醫校校長，於1947年起任台大醫學院細菌學科教授，同年接任醫學院院長，其任內醫科定為六年制，並增設生理學科研究所及病理研究所。
魏火曜
第四任院長魏火曜（ 1953.8-1972.7 ）
1942年榮獲東京帝大醫學博士學位，1953年繼杜聰明接掌台大醫學院。在職19年間，台灣醫學教育由全然襲自日制開始脫胎換骨，大力培植人才，以美援聘外籍顧問協助革新，並選送教授赴美進修，積極改善教學設備，提升教學質量。
李鎮源為因應醫療人才人力的貧乏，陸續增設護理、醫事技術、復健醫學等科系，並著手進行各科系研究室興建，設立八個研究所、三個博士班。為了提高臨床醫師的水平，及爭取國內醫界在國際舞台上的學術地位，首創小兒科醫學會，並於醫學會任內以理事長身份，力薦當局引進小兒麻痹沙賓疫苗。由於從臨床到學術成績卓然，於1968年獲選為中央研究院院士。1972年卸下院長職務後，轉任台灣大學教務長7年余，致力校務現代化，直至1979年退休。由於其任內的努力，使國內醫學教育從萌芽到茁壯，由殖民過渡到本土化，奠定了基礎醫學的根基，確立了臨床制度的完整，並一手推動醫療相關公益事業。
李鎮源
第五任院長李鎮源（ 1972.8-1978.7 ）
1945年榮獲台北帝大醫學博士學位。其致力藥理學研究三十年，因台灣實際需要，對於蛇毒神經毒素之藥理研究，成就特巨，所領導之台灣大學藥理學研究所已列為國際蛇毒研究主要中心之一，故於1970年當選為中央研究院生物組院士。
1972年接任醫學院院長，上任後為了改革兼差、開業、收受紅包等積弊，除了全力推動“專勤制度”外，還聘請資深教授組成“醫學院改革委員會”，希望能對台大醫學院各種積弊大刀闊斧改革。除此之外，在每年新生訓練時，一定告訴醫學院學生“醫生的天賦是為了幫助病人，不是為了賺錢，如果有人為了賺錢，應該轉到其它學系”，令醫學院學生印象深刻。
彭明聰1976年榮獲國際毒素學會 Redi 獎。 1986年自台大醫學院退休，任台大醫學院名譽教授。李鎮源在求學時代酷愛閱讀課外讀物，在一本中學時代讀過的日本小說中，有一段話令其永志難忘：“人既然來到這個世界，就應該把理想實現出來，在地球上留下足跡”，這句話後來成為他的座右銘。
彭明聰
第六任院長彭明聰（ 1978.8-1983.7 ）
1945年獲台北帝國大學醫學士，於1951年起任台大醫學院藥理學教授。
楊思標長期研究生殖生童；對於新生鼠之下視丘 , 腦下生殖器機能方面，研究其分化及老化之因，貢獻甚多；所發表之研究成果，陸續受英美學者證實，故於1978年當選中央研究院院士。1978年接任醫學院院長，任內增設臨床醫學研究所； 取消臨床醫學課整合教學制度，恢復各科獨立教學；成立學士後醫學系。
楊思標
第七任院長楊思標（ 1983.8-1985.7 ）
1953年榮膺日本新瀉大學醫學博士，為國內胸腔內科知名權威學者，尤專長肺部 X 光片判讀，對肺結核及肺癌研究、診斷與治療，有獨特的技巧與貢獻。
楊照雄於1983年接掌醫院院長，在附設醫院實施專勤制度（1984年8月），完成編輯《楓城四十年》，於1989年榮退，但服務杏林之精神仍不滅當年，貢獻其所學及數十年之醫務行政經驗，遠赴花蓮接掌佛教慈濟護專，主持校務，培植護理新軍。
楊照雄
第八任院長楊照雄（ 1985.8-1987.7 ）
1960年榮膺日本松元醫科大學醫學博士。 1982年因“裸鼠繼代之鼻咽癌細胞內的 EB 病毒基因之表現”的研究，獲行政院傑出科技榮譽獎。
楊教授每天帶兩個飯盒，研究至夜晚，是杜聰明老院長的“研究第一，樂學至上”的奉行者。
黃伯超其座右銘為：人生以服務為目的，儘量奉獻而不求回報。任台大醫學院院長以後，特別重視基礎醫學的研究，並想盡辦法為其籌款，自許為醫學院發展鋪路。
黃伯超
第九任院長黃伯超（ 1987.8-1991.7 ）
陳維昭於1958年榮獲日本東京慈惠會醫科大學博士， 1968年起任台大醫學院生化學系教授。1979年因有關國人蛋白質需要量、一般營養狀態及中國特有食品營養價值之研究，獲頒教育部學術獎金。於1987年接任醫學院院長，為期全面提升該院專任教師教學、研究、服務之水平，建立教師再評估及續聘制度，特設“教師評估委員會”，凡教授、副教授、講師自任現職之日起滿四年，應即進行評估，其後每二年再評估一次。
各項綜合表現不佳者，促其限於二年內改進，期滿仍未見改進者，經委員二分之一以上同意，可建請校方不予續聘。另外任內促成與美國哈佛大學醫學系學生之交流，擴大學生的國際視野。
陳維昭
第十任院長陳維昭（ 1991.8-1993.6 ）
謝貴雄1973年獲日本國立東北大學醫學博士，1989年獲美國約翰霍普金斯大學公共衛生學碩士， 1983年起任台大醫學院教授。1979年因坐骨連體男嬰分割手術之成功，廣受國內外矚目。
1991年接任醫學院院長，為健全該院體整發展，促進院務改善，協助院長推動院務，特設立“院務諮詢委員會”。另為整合併改進各科系所學生及附設醫院醫事人員之教學，特組成各科系所教育小組，並遴聘造詣高深之學者專家擔任“講座”。 1993年6月榮升台灣大學校長。
謝貴雄
第十一任院長謝貴雄（ 1993.11-1994.7 ）
1965年台大醫學系畢業， 1968年至1971年擔任美國海軍第二醫學研究所研究員， 1982年起任台大醫學院小兒科教授。為國內小兒過敏氣喘研究的先驅，曾獲國科會傑出研究獎，並多次擔任國際學會主席，亦曾經擔任多個學術團體的理事長。1991年任國科會生物處處長，負責推動全國生命科學研究，在各大醫院大力整合中西醫研究合作。
謝博生1993年經院長推選委員會遴選為第十一任醫學院院長，任內為保障教師權益，增進和諧，擬設定教師申訴評議委員會，辦理醫學院教師申訴案件之評議。於1996年轉任長庚兒童醫院及長庚中醫院籌備主任，致力於中西醫學整合和中醫藥教育。
謝博生
第十二任院長謝博生 （ 1995.8-2001.7 ）
1967年台大醫學系畢業，1974年獲日本東京醫科大學醫學博士，1983年起任台大醫學院內科教授，1992年任該院教務分處主任暨附設醫院教學副院長，負責規劃並推動該院教育改革，
於 1993年八月至十月及1994年八月至1995年七月擔任該院代理院長，於1995年八月經院長推選委員會遴選為第十二任院長，
陳定信謝院長上任後致力於改善教學制度，美化校園，整合學術研究，提升教育質量，提振人文精神，保存修復二號館，規劃籌建“會議中心暨醫學研究中心”大樓及“藥學暨護理大樓”等，促該院朝更具醫學科學與人文結合之教育搖籃發展。
陳定信
第十三任院長陳定信 （2001.8 -2007.7）
陳院長定信系1968年台灣大學醫學院醫科畢業，1975年於日本國立癌症中心研究所從事肝癌及肝炎研究，1979年至1980年於美國國立衛生研究院（NIH）肝炎病毒組擔任客座研究員（ Visiting Scientist ），1983年起任台灣大學醫學院內科教授，1987年至2001年任該院附設醫院肝炎研究中心主任，1996年起兼任附設醫院胃腸肝膽科主任，對於肝炎及肝癌研究蜚聲國際， 1992 年當選中研院院士，2004年任世界肝臟醫學會理事長（ International Association for the Study of the Liver, IASL ），2005年膺選美國國家科學院（ US National Academy of Sciences ）海外院士。
楊泮池2001年8月經院長遴選委員會遴選為該院第十三任院長，就任後致力繼續提升醫學教育質量，培育優質醫療人員，期能服務社會，並盼畢業生能領導醫界，造福人類。同時也努力提升該院之醫學研究水平，為使同仁能順利從事與基因體相關之研究，於2003年成立台大基因體醫學研究中心，用心良苦。
楊泮池
現任院長簡介
楊泮池教授1979年台大醫學系畢業，1990年獲得台大臨床醫學研究所博士學位。楊泮池教授致力於國人肺癌之致病機制及轉移機轉研究，曾獲十大傑出青年獎、東元科技獎、台大特聘教授與講座教授等殊榮，2006年更獲選為中央研究院院士。自1998年起歷任台大醫院內科部主任、台大醫學院教務分處主任、台大醫院副院長等職務。
2006年經醫學院院長推選委員會遴選為第十四任醫學院院長，就任後致力於提升該院教學、研究及服務品質，加強研究團隊之整合，強化教師、學生素質，期望將台大醫學院朝向華人頂尖、世界一流學府的目標邁進。
發展前景
該院至今已走過百年歷史，在島內醫學教育上扮演了重要角色。醫學教育為百年大計，時值醫學知識之急速爆漲與累積，該院師生除傳承優良傳統外，更以“人文關懷為基礎”、“病患為中心”進行疾病的診療，養成團隊合作習慣、具備研究創新能力，以符合新世紀與新環境的需求。
未來該院將續推動全人教育，提振醫學人文精神，期醫者在醫學教育革新與人文精神推展下一代比一代優秀。
學術研究
台灣大學醫學院在學術研究方面，該院學術研究憑藉前輩的努力與耕耘，至今累積了豐碩的成果，並在台灣學術研究領域中占有一席之地，且於醫學研究領域獨占鰲頭。
而為了更上層樓，及提升整個醫學研究水平，該院於1996年配合校研發會正式成立研究發展室，整合併有效運用醫學院、附設醫院及公衛學院之研究環境；利用有限經費集中購置精密儀器、改進學術研究相關制度、依重點發展需要，成立跨領域、整合性之群體研究計畫，並統籌辦理醫學校區學術研究相關之行政事務。
此外，在研究計畫方面，該院學術研究計畫經費主要來源為國科會、衛生署、政府相關機構及財團法人委託計畫等。該院及附設醫院則依循“儀器共享、資源共享、基礎臨床整合、協助新進同仁、詳實追蹤、獎勵發表”之原則，編列相關研究經費，推動學術研究發展，成效卓著。
教學發展
1. 培養醫師人才，授予現代之醫學知識與觀念，以改進人類健康。
2. 培養醫學專才及科學家，使之成為醫學及衛生科學師資及研究者。
3. 推動生物醫學及衛生科學之研究，以解決本國之衛生問題及增進生物醫學的基本知識。
學生活動
重視社團活動是台大的一項優良傳統，該院秉持這樣的傳統，自日治時代起師生即積極參與社團活動，光復後，各項社團活動亦非常踴躍，提供學生一個舒展身心、運動交流、提升人才素養及一探藝術殿堂奧妙的捷徑。
除了以各系所為主的各系學會、研究生互助會外，該院學生社會服務性社團（學生社會服務團、漁服醫療服務隊等），亦為一個常態性社團，每年寒暑假的醫療服務成為該團的活動之一。傳統醫學研究社則以建立完整的針灸治療評估，並能服務礦區山地的鄉民，成績卓著。
在藝文社團方面，主要包音樂演出活動為主的杏林弦樂團、合唱團；醫學院自然保育社、繪畫與美學的綠野社、杏林浪漫搖滾社、強調人文精神的文學創作社，以及以攝影為主的醫影社。
此外，在宗教勵志社團方面包括晨曦佛學社（醫法分部）及醫心社。體育社團方面包括足球隊、桌球隊、網球社、田徑隊、合氣道社、籃球社、棒球社、羽毛球社、橄欖球隊等等。
該院學生在上述多彩多姿的社團生活中，為平日沉重的課業增添不少色彩，透過這些社團活動，不僅找到自我，同時也觸及另一種醫學教育面，身心所感受，皆是醫學教育本質對生命的一種理想與期許。
該院與學生相關事務，諸如課外活動，各項獎學金申請案及學生生活輔導等皆由學生事務分處負責執行與協調。
