發病情況與臨床症狀
大批雞拉稀，有的雞泄瀉不成形、不成堆的糞便，比正常雞的糞便所占面積大，糞便顏色為淺黃，內有大量未消化的飼料顆粒，同時雞群的採食量迅速下降。早期患病雞有的出現精神異常興奮、頭頸震顫、亂跑亂撞、尖叫等症狀，興奮不安後往往因癱軟、衰竭而死亡，且黎明前猝死現象明顯增多。
剖檢早期病例可見，患雞十二指腸、空腸腸壁腫脹，腸黏膜增厚，顏色變淺，呈灰白色，像一層厚厚的麩皮，極易剝離，小腸的漿膜表面有針尖至綠豆粒大小的紅色出血點；剖檢死亡雞隻可發現腸壁變薄，黏膜脫落，腸內容物有的呈膿樣、有的呈魚腸子樣，有的呈西紅柿樣，個別雞症狀表現特別嚴重，腸黏膜幾乎完全脫落、崩解。綜合臨床症狀與病理變化，可初步診斷為肉雞腸毒綜合徵，確診需進行實驗室診斷。
發病原因與發病機理
球蟲的嚴重感染由於小腸球蟲在腸黏膜下的大量生長繁殖，可導致腸黏膜增厚、腸壁有出血點、腸黏膜脫落等病變，使腸道內飼料中的營養幾乎不能被吸收，同時對水分的吸收也明顯下降，所以患雞儘管大量飲水，但機體還是會出現脫水現象，這也是引起糞便稀、糞中含有未消化飼料的重要原因之一。
腸道內環境的改變因小腸球蟲在腸黏膜細胞內快速繁殖，需要消耗宿主細胞內的氧氣，導致小腸黏膜組織產生大量乳酸，使得腸道內環境的pH值嚴重降低。由於腸道pH值的改變，使腸道菌群發生了變化，有益菌數量減少，有害菌大量繁殖，使各種消化酶的消化能力下降，腸蠕動加快，消化液排出增多，飼料在消化道的停留時間縮短，消化時間減少，導致飼料消化不完全。未消化的飼料及脫落的腸黏膜一起排出，形成臨床上多見的魚腸子樣、西紅柿樣糞便，以及糞中帶有黃色未消化的飼料顆粒。
飼料中維生素、能量和蛋白質的影響
在調查中發現，飼餵肉雞的飼料營養成分越優良，其發病率就越高，症狀就越嚴重，飼料品質差的雞群發病率反而比較低，這是由於在球蟲和細菌的混合感染中，大量的能量、蛋白質、維生素是球蟲繁殖的主要營養，故可促進二者的繁殖，加重病情。
在該病發生過程中，球蟲和細菌的大量繁殖，導致消化不良，使腸道產生吸收障礙，電解質吸收減少，同時由於大量細胞被破壞崩解，造成大量電解質的流失，特別是鉀離子大量流失，從而導致心臟興奮過度，肉雞突然猝死。
自體中毒在發病過程中，大量的腸上皮細胞破裂，發生腐敗分解，再加上死亡的蟲體、菌體崩解產生的大量有毒物質，被機體吸收後發生自體中毒，從而在臨床上出現先興奮不安，後癱軟、昏迷、衰竭死亡的情況。
流行特點
1.肉雞腸毒素綜合徵以30～40日齡的商品肉雞群發病為主，該病一年四季都可發生，球蟲病預防不到位是該病發生的主要原因。此外，衛生條件差、密度大、濕度高、通風不良的情況下多發，且症狀嚴重。因此，根據該病的流行特點，平時要加強飼養管理，搞好預防工作。
2.球蟲在機體內外環境中能夠多次完成生活史，在墊料和糞便中存在大量蟲卵，導致球蟲反覆感染。因此，必須定期對雞舍、雞籠等設備及地面進行徹底消毒，及時清除糞便及潮濕的墊料，並將其堆積在固定地點集中進行無害化處理，防止污染飼料和飲水，以切斷傳播途徑， 降低球蟲的發病率，從一定程度上減少了該病的誘因，可降低該病的發生。
治療措施
對全場實施緊急預防，並以抗菌消炎、清熱解毒、抗球蟲、增強機體體質為治療原則，按照下列防治方案進行治療，經過7天后全群基本恢復正常。
1. 對尚未發病的雞群用磺胺喹惡啉鈉可溶性粉混飲，100克兌水150千克，全天量一次集中飲用，連用3天。同時在飼料中加進球清混飼，每100克拌料100千克，混勻全天投飼，連用3天。
2. 症狀輕微者用硫酸粘桿菌素可溶性粉，100克兌水400千克，分上、下午集中飲用，連用4天。
3. 對症狀較重者用阿莫西林可溶性粉，100克兌水150千克，進行灌服，連用5天,同時用白頭翁散拌料，500克拌料300千克，混勻全天投飼，連用5天。自體中毒嚴重的雞群另加葡萄糖、維生素C進行排毒、解毒。
