1944年，耿樹堂目睹日本帝國主義到處燒殺搶掠，殘害中國老百姓的罪行，在共產黨員胡通祿啟發影響下，參加抗日鬥爭。他經常冒著生命危險給八路軍送情報，參加破壞日偽軍鐵路和割斷日偽軍的電話線等活動。
1945年9月，抗日戰爭結束後，耿樹堂加入共產黨組織，不久，又擔任了神山村公安員。耿樹堂任村公安員期間，隨時注意國民黨反動派和地主惡霸的活動情況，發現問題及時向上級報告。1946年春，六區區長馬國良到神山村開展工作。國民黨政府保長鬍XX等人偽裝熱情，請馬區長吃飯，暗地裡卻在飯中投入毒藥。耿樹堂及時發現和揭穿了國民黨政府保長的陰謀，保護了馬區長，又把國民黨保長抓到區公所鎮壓。
1946年4月，耿樹堂調任懷柔縣六區區公安員。他經常深入農村參加土改工作，組織批鬥會，對欺壓人民民眾和破壞土改工作的地、富及其他壞分子進行堅決鬥爭。1947年9月，耿樹堂奉區領導指示，巧妙地指揮冀熱察邊區懷柔縣北台上貨站的工作人員，深入國民黨統治區，以物易物，換回大批槍枝子彈，武裝了六區民兵游擊隊。1948年5月24日，懷柔縣大隊決定攻打金頂寺國民黨政府軍據點。耿樹堂奉命，在當夜跑到幾個村莊組成了擔架隊，並帶領擔架隊到作戰前線搶救傷員，配合縣大隊全殲金頂寺守軍。
1948年6月，耿樹堂任六區區長。他不失時機地召開區、村幹部會議，部署各村的農業生產任務。在耿樹堂的指揮下，全區生產搞得熱火朝天。耿樹堂除抓緊解放區各村的生產外，還深入到國民黨統治區征糧、征款、搞土改，把自己生命置之度外。1948年10月12日，為配合解放軍打擊敵人，中共懷柔縣委指示六區執行割斷懷柔火車站至密雲縣境內的電話線的任務。耿樹堂立即帶領民兵游擊隊於當天下午4點鐘到預定地點陳各莊村，與游擊隊副隊長崔××一起對割電話線的行動作了詳細部署。之後，二人隱蔽在該村耿樹堂姐姐家。不料，此事被陳各莊村保長馮富才發現，並向隆化駐懷柔縣的反動地方武裝告密。敵人馬上派兵包圍了陳各莊村耿、崔隱蔽處，並從窗台上開槍，當場殺害了耿區長和崔副隊長。狠毒的敵人還把耿樹堂首級鍘下，掛在懷柔縣城東門外"示眾"。
