概念
一種以輸入化學分子結構圖形為特徵的化學信息搜尋方式，區別於CAS號，化學名稱等的數字或文字搜尋方法，是目前化學家在科研或訂購化學試劑時最常用的搜尋方式。
意義
在科研中，結構式圖形是化學家的工作語言。
子結構搜尋能幫助合成化學家找到不同的起始原料，
藥物化學家設計分子時，結構式搜尋能夠拓展思路。如通過相似結構搜尋能激發藥物化學家的設計靈感，幫助他們設計出更可行更多變的類似化合物。
天然產物化學家在尋找類似物時，只要輸入母核，一次點擊即可馬上找到感興趣的結構。
分析化學家在尋找標準品時，常常根據具體結構需要而定。
1.結構式圖形是化學家的工作語言
2.合成化學家
3.藥物化學家
4.天然產物化學家
5.分析化學家
所以，CAS號搜尋或化學名稱搜尋只能給出單一的搜尋結果，而結構式搜尋既能給出精確搜尋結果（精確結構式搜尋），也能給出更多的相關搜尋（子結構搜尋和相似結構搜尋）信息，是化學家的必備科研手段之一。
結構式搜尋技術
目前中國開發基於網頁的結構式搜尋方法有兩種：基於smiles的結構式搜尋和基於A試劑的結構式搜尋。
基於SMILES的結構式搜尋
目前中國掌握的結構式搜尋方式多基於SMILES結構分析，試圖通過SMILES文字比對的搜尋方式，實現結構式搜尋。不可否認，這種搜尋方式的有一定的用處。比較適合非專業的化工貿易人員。但在不規整或複雜的SMILES匹配過程中，很多化學試劑搜尋不到。由於smiles字元串的原因，一些含炔類的化合物均搜尋不到結果。
基於Integle的結構式搜尋
Integle技術套用分子指紋圖譜特徵開發的百萬級線上結構數據結構式搜尋引擎， 其搜尋結果準確，比較適合化學家等終端用戶。對炔類結構的搜尋效果比smiles的方法有很大的改進。
基於smiles的結構式搜尋和基於A試劑的結構式搜尋適合的用戶對像不同，搜尋結果的準確程度有所不同。一般來說，基於A試劑的結構式搜尋適用範圍更廣，結果更準確，適合化學家等專業需求較高的使用者。
基於Structure API的結構式搜尋
Structure API提供了以分子指紋為基礎的結構搜尋，並提供了更多關於結構搜尋的輔助功能，例如：標準產品名轉換結構信息，產品結構圖自動生成等，其中標準產品名轉換結構信息方便了無結構信息的用戶提交產品。
除了子結構搜尋，相似性搜尋，使用Structure API的結構搜尋功能可以讓用戶在不使用畫圖工具的情況下同樣可以進行結構搜尋，例如：tert-Butyldimethylsilyl chloride這個產品，同時有同義名如以下：
chloro(1,1-dimethylethyl)dimethyl-silan
chloro-tert-butyldimethyl-silan
Chloro-tert-butyldimethylsilane
Dimethyl-tert-butylchlorosilane
1.chloro(1,1-dimethylethyl)dimethyl-silan
2.chloro-tert-butyldimethyl-silan
3.Chloro-tert-butyldimethylsilane
4.Dimethyl-tert-butylchlorosilane
如果用戶搜尋以上同義名時，而網站中又未記錄下這些同義名，Structure API的結構搜尋會將這些同義名以結構方式進行匹配，從而搜尋到tert-Butyldimethylsilyl chloride，大大提高了客戶在您網站中的搜尋命中率，從而避免丟失更多的商機。
