早期經歷
穆賈迪迪1929年出生於一個聲望極高的阿富汗家庭，信奉伊斯蘭教，全家都是遜尼派的普什圖人。有人說，穆賈迪迪家族身世顯貴，曾經是印度的貴族，20世紀初整個家族才遷至阿富汗，因此家族還有部分昂格魯-薩克遜血統。但是，這一點從未得到穆賈迪迪家族的承認。在穆賈迪迪二三十歲的時候，經常參加一些反蘇組織，並和族人策劃一些行動。1959年至1964年，他被當時的親蘇政府關入大牢，罪名是密謀刺殺當時的蘇聯部長會議主席尼基塔·赫魯雪夫（NikitaKhrushchev）。
出獄後不久，穆賈迪迪又多次參與反蘇示威遊行。20世紀70年代，他再次遭到政府通緝，被迫逃到丹麥，擔任哥本哈根大清真寺的主持。1978年，阿富汗民族解放陣線成立，穆賈迪迪出任該黨的主要領導人。
1979年蘇聯軍隊大舉進攻阿富汗，穆賈迪迪家族成為他們的一個主要打擊對象。短短几年時間，穆賈迪迪家共有180人被蘇軍殺害，穆賈迪迪發誓要報不共戴天之仇，堅持抗蘇到底。從此，他憑藉著自己家族的財產和聲望在普什圖族人中招兵買馬，成立了一支反蘇游擊隊。
出任總統
他的反蘇游擊戰一直堅持到蘇軍1989年徹底撤出阿富汗，而他的事跡也在阿富汗廣為流傳。1992年，蘇聯支持的阿富汗傀儡政權垮台後，穆賈迪迪出任阿富汗總統。他為人溫和，被稱為“和平總統”，但是他就任總統的時間只有2個月。很快，1992年12月30日，布爾漢努丁·拉巴尼在大選中獲勝，接替他擔任總統直至1994年底。重新出山
穆賈迪迪喜歡纏著白色頭巾，戴著白邊眼鏡，留著白色的長鬍子。他雖然只當過2個月的總統，但德高望重，在阿富汗人氣很旺。相比他的競爭者拉巴尼，穆賈迪迪優勢明顯。他是在阿富汗占人口多數的普什圖族人，僅憑此就能幫他拉到不少選票。而拉巴尼不僅不屬於普什圖族人，還認為婦女應當保守，戴上面紗。如今，穆賈迪迪住在距中國使館不遠的地方，保衛嚴密。現任臨時政府總理卡爾扎伊、外交部長阿卜杜拉、國防部長法西姆和各省省長，都經常登門與穆賈迪迪商討國家大事。卡爾扎伊曾在穆賈迪迪身邊工作過十多年，現在每當遇到重大國際、國內問題的時候，都來到這裡，同他一起討論。穆賈迪迪現在雖然不擔當任何職務，但是日常工作繁忙，主要是接受記者採訪、接待一些國家的使節。負責他每天活動安排的人名叫阿赫邁德·波帕爾，是卡爾扎伊的表弟。
但對於眾多記者關於“是否希望再當總統”的提問，穆賈迪迪卻很謹慎，他只是回答：“誰當總統取決於人民，由人民來選擇。如果人民選舉我，我會接受選舉結果的。”[1]
當選議會主席
新華網喀布爾2005年12月20日電阿富汗前總統西卜加圖拉·穆賈迪迪20日在阿富汗新議會上院選舉中贏得上院議長一職，議會下院議長的選舉因議員們無法就選舉程式達成一致而擱置。30多年來首次通過選舉產生的阿富汗新議會20日正式召開第一次會議。102名議會上院議員就上院議長人選進行了投票。第一輪投票中，穆賈迪迪以50票領先，另外2名候選人得票數分別為27票和25票。位列第3名的候選人隨即宣布支持穆賈迪迪，穆賈迪迪順利當選。
70歲的穆賈迪迪曾創立阿富汗民族解放陣線。1992年，納吉布拉政權垮台後，他曾擔任過為期2個月的臨時總統。2001年阿富汗戰爭後，他出任阿富汗大國民會議（大支爾格會議）主席。
