集中權力
統一戰爭結束以後，秦王贏政立即著手進行集中權力的活動。他兼收採納傳說中三皇、五帝的尊號，宣布自己為這個封建統一國家的第一個皇帝，稱始皇帝，後世子孫世代相承，相繼而稱二世皇帝、三世皇帝。他規定皇帝自稱“朕”，並制定了一套尊君抑臣的朝儀和文書制度。這些措施，都是為了顯示封建統一國家最高統治者的無上權威，表示秦的統治將萬世一系，長治久安。
周代以來封國建藩的制度，與專制皇權和統一國家是不相容的，所以必須加以改變。始皇二十六年（公元前 2211 年），丞相王綰請求封皇子為燕、齊、楚王，得到群臣的贊同。廷尉李斯力排眾議，主張廢除分封，全面地推行郡縣制度。秦始皇接受了李斯的建議，把全國分成三十六郡，以後又陸續增設至四十餘郡。這些郡完全聽命於中央和皇帝，是中央政府轄下的地方行政單位。中央集權的制度，從此就確立了。
改革官制
中央
秦始皇把戰國時期的官制加以調整和擴充，建成一套適應封建統一國家需要的新的行政機構。在這個機構中，中央設丞相、太尉、御史大夫。丞相有左右二員，掌管政事；太尉掌管軍事，不常置；御史大夫是丞相的副職，掌管圖籍秘書，監察百宮。丞相、太尉、御史大夫以下，是分別掌管具體政務的諸卿，其中有掌管宮殿掖門戶的郎中令，掌管宮門衛屯兵的衛尉，掌管京畿警衛的中尉，掌管刑辟的廷尉，掌管谷貨的治粟內史，掌管山海池澤之稅和官府手工業製造以供應皇室的少府，掌管治宮室的將作少府，掌管國內民族事務和外事的典客，掌管宗廟禮儀的奉常，掌管皇室屬籍的宗正，掌管輿馬的太僕等。丞相、太尉、御史大夫與諸卿議論政務，由皇帝裁決。
地方
地方行政機構分郡、縣兩級。郡設守、尉、監（監御史）。郡監直屬中央的御史大夫。郡守的副職是郡尉而非郡監。縣按大小設令或長，統領有丞、尉及其他屬員。郡、縣主要官吏由中央任免和調動。縣下有鄉，鄉設三老掌管教化，嗇夫掌管賦稅訴訟，游徼掌管治安。鄉下有里，是最基層的行政單位。里有里典，後稱里正、里魁，以鄉人強有力者擔任。此外還有司掌治安、禁盜賊的專門機構，叫做亭，亭有長。兩亭之間相距大約十里。
戶籍相伍
戰國後期，秦國建立了以“告奸”為目的的“戶籍相伍”制度，以圖加強統治。秦始皇十六年（公元前 231 年）“初令男子書年”，三十一年（公元前 216 年）“使黔首自實田”。這樣，農民的戶籍中增加了年紀和土地占有狀況，不但便於封建國家的政治統治，而且也便於徵發祖賦兵徭。戶籍制度從此成為地主階級及其國家把農民牢牢地固著在土地上，進行統治和剝削的依據，成為封建國家“庶事之所自出”的一項重要制度。
法律
在湖北雲夢發現的秦簡，使我們知道了自秦孝公至秦王贏政時期陸續修成的秦律的部分內容。秦始皇統一六國後，以秦律為基礎，參照六國律，制定了通行全境的法律。秦律經過漢朝的損益，成為唐以前歷代法律的藍本。
軍隊
統治一個大國，還需要強大的軍隊。秦軍駐守全國，南北邊塞是屯兵的重點。秦制以銅虎符發兵，這是保證兵權掌握在皇帝手中的重要制度。在秦始皇陵側發現的兵馬俑坑，有武士俑數千件，還有戰車戰騎。兵馬俑所反映的軍陣規模之大，軍容之盛，是秦軍強大的表征。
思想基礎
秦始皇不但建立了這一套專制主義中央集權的統治機構和制度，而且還採用了戰國時期陰陽家的終始五德說，來辯護秦朝的法統。終始五德說認為，各個相互繼承的朝代以土、木、金、火、水這五德的順序進行統治，周而復始。秦得水德，水色黑，所以秦的禮服旌旗等都用黑色；與水德相應的數是六，所以符傳長度、法冠高度各為六寸，車軌寬六尺；水德主刑殺，所以政治統治力求嚴酷，無“仁恩和義”，與水德相應，曆法以亥月即十月為歲首，等等。秦始皇還確定了一套與皇帝地位相適應的複雜的祭典以及封禪大典，不許臣民僭越。秦始皇在鹹陽附近仿照關東諸國宮殿式樣建設了許多宮殿，並修造富麗宏偉的阿房宮。在他看來，這些宮殿建築不但是天下一統的象徵，而且“端門四達，以制紫宮”，儼然是人間上帝的居處。他還在驪山預先建造陵寢，“以水銀為百川、江河、大海，機相灌輸，上具天文，下具地理”。這些措施除為了滿足奢欲以外，還和他採用皇帝的名號一樣，是要表示他在人間的權力無所不包，與上帝在天上的權力相當，從而向臣民灌輸皇權神秘的觀念。神秘的皇權觀念，是專制主義中央集權制度的思想基礎 。
