第一集
已昏迷一年之久的韓振宇一直在醫院接受治療，姜京熙不時前來探望。最近一起殘障人士被拐賣入黑工廠的案件讓京熙倍感壓力，她還被疑犯打傷頭部。此時醫院傳來振宇復甦的訊息，振宇假裝失憶令京熙甚是著急。經查打傷京熙的並不是兇手，而是被拐賣少女鄭美的父親。患有淚血症的鄭美成為案件的突破點，振宇通過過敏條件鎖定了兇手的窩點。經過一番緊急營救，京熙從兇手手中救下鄭美。原來兇手朱福也是殘疾人，多年來飽受歧視令他心理扭曲，竟讓他將罪惡之手伸向了同類。
第二集
警署刑偵股長姜秀河在家附近遇害，罪案現場留下的體液信息卻牽扯出幾年前的一樁強姦殺人案。振宇和京熙介入調查竟然發現當年被害人朴河瑩竟和兇手兒子高慶銀生活在一起，河瑩和慶銀一致認為兇手另有其人，正當秀河準備重新調查此案之時卻遭殺害。振宇得知自己昏迷時京熙都在旁悉心照顧，他表達歉意並和京熙擁吻一起。河瑩描述兇手使用香水這一細節讓京熙將目標鎖定秀河的兒子——勇俊，原來勇俊吸毒犯下罪行，母親秀河偽造證據替兒子逃罪，一同行兇的金永碩怕秀河翻案便將她殺害。
第三集
法醫官事務所人員緊缺，韓施雨作為新晉員工加入進來，他對振宇教授倍加崇敬。患有亨亭頓舞蹈症的徐研珠自殺在藤蔓之間，死者注射的處方藥和遺書卻頗存疑點。死者的兩個女兒熙研和皓研對母親的死反應異常冷靜，熙研透漏出母親和劇院老闆姜民哲的不正當關係，振宇則發現她另有所隱瞞。經調查是熙研偷為母親服用違禁藥品，然而妹妹皓研才是幕後真兇，這一切源於女兒對母親的仇恨，皓研幻想殺死繼父和母親後會讓熙研幸福，結果此時的熙研更加痛苦。
第四集
從事過非法行醫的洪錫太死在地下室里，他被人注射肌肉鬆弛針劑並挑斷腳筋，安裝在門口靠下的密碼鎖引起京熙的注意。振宇在錫太住所發現一名受傷害的畸形兒童照片，他們找到此時已經長大的朴秀榮以及一直撫養他的吳景淑。稍經審問景淑和秀榮便爭著認罪，幾次親子鑑定更讓人捉摸不透，原來錫太當年用自己畸形孩子秀榮換來景淑孩子基俊。長期受虐的基俊得知此事後起了報復之心，他殺死錫太並讓秀榮在場觀看，誰知秀榮一心維護基俊而選擇自殺。
第五集
郊區廢品資源回收筒突然出現一個裝有少女屍體的冰櫃，令人奇怪的是死者的小腸被切，上次類似案件的死者被切的是肝臟。京熙調查廢物回收公司的雇員張萬亨，結果新的案件竟在隔壁街發生。此次的死者全身無傷，腹部的傷痕讓振宇若有所思。京熙從電話得到靈感並查到兇手徐久日的身份，振宇也確定日久下一個目標是兒童的心臟。幸虧京熙及時趕到，日久的計畫落空，他聲稱自己罪行是為拯救自己的身體，但在振宇看來他該拯救的是自己的靈魂。
第六集
公司職員李煥成突然死於水中毒，死者公司的敷衍了事令煥成的母親傷心不已。振宇決定以小職員的身份前去調查取證，京熙和施雨卻在分別暗地調查一宗水污染的案件。振宇開始了每天擠公交看老闆臉色的職員生活，公司的氣氛十分壓抑，環境惡劣加之各種規定對員工的身心存在很大威脅。幾天的工作讓振宇感覺到身心疲憊，煥成的死檢也證實了振宇的猜測。原來黑心的老闆剋扣員工應有福利，各種強制規定致使員工誘發病症死亡。
第七集
京熙在停車場遭遇刺殺，振宇挺身握住歹徒伸向京熙的匕首。高中生李宗赫的屍體被發現在石膏像中，他的美術老師姜道振面對警方的質疑心神不寧。宗赫昔日的好友東俊被查出曾指使他人毆打宗赫，而同為美術部的恩實也進入警方的視線。南警官突擊審查道振竟發現他的染色體是女人，道振慌忙認罪讓振宇懷疑。恩實迫於壓力坦白罪行，原來她喜歡的宗赫竟是是同性戀者，宗赫和道振的關係令恩實吃醋，氣急之下的恩實將宗赫殺死。
第八集
神的測驗第四季檢查官李在忠在自己的車中遇害，京熙悲傷至極，她無法接手此案還被列為頭號嫌疑犯。一線消防員李佑哲在連續工作後突然死亡，屍檢結果顯示也無法確定死亡原因。振宇在佑哲的追悼會見到前來鬧事的佑珉，佑珉更是拿火燒自己胳膊用來恐嚇振宇。振宇藉機接近佑珉，根據佑哲生前留的影片，振宇認定佑哲和弟弟都患有脊髓半切綜合症，佑哲早先知道真相便奮力工作想要為弟弟治病，佑珉得知哥哥一生都是在為自己付出，他失聲痛哭起來。
第九集
新生代鋼琴家崔書研死在家中的鋼琴上，解剖後的死因仍顯示為突發心梗。振宇和京熙去現場查找證據，鄰居志勛提供的一份視頻使得案情更為複雜。南警官也開始調查起那宗水污染案件，嫌疑犯李石南露面並邀請京熙單獨見面。振宇排除掉跟隨書研的八卦記者的嫌疑，他查出書研罕見的靜電特徵，志勛隨即交代了事件始末。原來書研為了能讓心愛的人撫摸自己的頭髮不惜選擇自殺，志勛不得已答應幫書研實現願望。
第十集
第十一集母親因殺人罪坐牢兩年，兒子卻提出自己才是真正的殺人犯，殺人背後有什麼隱情？振宇陪多美見她的媽媽，卻發現多美的媽媽竟是自己的母親。姜刑警和時宇都在調查關於廢物致人死亡的案件，姜刑警找到了唯一的倖存者李石南，李石南當年目擊了事件的經過，告訴姜刑警很多殘疾人因為處理廢物中毒而死。獄警拜託所長調查高桂女殺人的案件，經過檢驗發現很多疑點，但是高桂女堅持自己殺了逼自己兒子頂罪的黑社會老大，韓博士認定高桂女得了常染色體遺傳性小腦共濟失調，根本殺不了黑社會老大，調查發現兒子的朋友炳春嫌疑重大，原來炳春因為對老大的仇恨殺了老大，為了自己不被制裁，嫁禍給高桂女的兒子，高桂女為了兒子而頂罪，壞人受到懲罰，兒子準備接母親出獄，而母親卻在出獄當天病發身亡。因為是媽媽，才願意為孩子付出一切。神不能照顧到自己所有的孩子，代替自己的就是媽媽，媽媽付出所有善意回到神的身邊，在哪裡都很有底氣的說，作為神的代理，我付出全部。
