特點
個體的主動性
個體是“活”的，這是社會經濟系統的複雜性的最根本的由來，也是它與非生物系統的最基本的區別。人們常常犯的一個錯誤是把人比做“齒輪和螺絲釘”。在工業時代，大工業企業中的生產線上，工人確實只起到齒輪和螺絲釘的作用，在這個生產線上，事實上是為了效率而犧牲個性。早在卓別林的無聲電影中，我們就看到了這種做法的弊端，看到了對於這種扼殺個性的做法的抗議。在管理科學中，人們把這種管理體制稱為‘血汗工資制度”，列寧曾對它進行了猛烈的抨擊。從系統科學的方法論觀點來看，就是把“活”的個體等同於“死”的元素，無根據地把觀察物理世界的思想方法用於社會經濟系統，從而引出了一系列錯誤的觀念與做法。
只要承認個體是“活”的，那么它的目標或目的就是一個基本的討論前提。在近代科學的思維框架中，目的的概念曾被看作是神學或迷信的概念，考慮目的似乎就是違反了科學，回到了神學。這種偏見在相當的程度上阻礙了人們對於社會經濟系統的認識。20世紀中期以來，這種情況開始發生變化。赫伯特。西蒙提出了“人為事物的科學”的概念，提出了它與天然事物之不同，從而引起了“設計科學”這一新領域的誕生。整個科學正在轉向越來越多地承認個體的主動性，並把它作為觀察與研究社會經濟系統的基本出發點。
整體的不確定性
與目的相聯繫，對於不確定性的觀念也在變化之中，這也是我們對於社會經濟系統認識的一個重要方面。近代科學在大大擴展人們對自然界的認識的時候，在一定程度上忽略了規律與不確定性之間的辯證關係，人們在強調宇宙發展的規律性的時候，有意無意地把規律性和確定性等同起來，似乎我們談論的科學規律必須是確定性的規律，如果我們在某種場合、某種意義上承認不確定性的存在，似乎就是否定了客觀規律的存在。這實在是一種誤解。20世紀以來大量的科學發現已經一再表明，不確定性和確定性一樣，都是客觀存在。即使在自然系統中人們也已經觀察到:在一定的條件下，確定型的系統也會表現不確定的行為，即隨機的、原則上無法預測的行為。這就是所謂混沌。
如果，對於自然系統來說，這一進步是對系統行為的豐富性深化，那么，對於社會經濟系統來說，這應當說是進行有效研究的前提。試想，如果真的把不確定性完全排除掉，人的行為還有什麼意義和作用呢?絕對的決定論必然走向宿命論。按照這樣的觀點去看待社會經濟系統，是不可能對於個體的主動性給予任何認真研究的。事實上，正是因為承認多種可能性，存在著不確定的前景，人的主動性才有意義，才能承認“人有人的用處，，才談得上積極的社會科學或社會系統工程。所以，對於社會經濟系統的理解和認識(以至檢討)來說，承認並認真深入研究不確定性，實在是一個基本的必要前提。個體的主動性與整體的不確定性是同一件事的兩個側面。
信息和信息系統的重要作用
回顧人類歷史，信息處理手段與信息處理系統的發展起著非常重要的作用，從語言文字的產生到通信技術的發展，從烽火台到衛星通信，使社會經濟系統發生巨大變革。同時越來越多的事實清楚地表明，信息和信息系統的突出作用是社會經濟系統的基本特徵之一。
整體的信息積累與利用機制
信息，反饋，控制，這些現象在非生命系統中，僅僅表現為:有一個控制中心在控制，而系統中其他的部件(或子系統，或元素)都是死的、被動的。在生物及生態系統中，雖然每個個體是有主動性的，整個系統仍然是處於無意識、盲目的狀態之中。社會經濟系統則不同，人類社會作為一個整體，逐步形成了整體的(Global)信息積累和利用機制，前有文字，後有Internet。這是生物系統，即使是所謂“社會性生物”(如蜜蜂、螞蟻)也沒有的現象。人類通過各種層次上越來越精細的分工合作而成為一個整體，通過文化、科學、藝術等渠道一代又一代地積累起豐富的經驗和知識，使得人類作為一個整體遠遠勝過其他任何生物群體，這就是我們的社會經濟系統—空前複雜精緻的大系統。
所以，研究社會經濟系統必須認真地研究這種整體的信息積累與利用機制，並由此描述、解釋種種複雜的社會經濟現象，從中找出正確、有效的控制與管理方式。
複雜性
對經濟系統可以定義為:由相互作用、相互聯繫的經濟要素所組成的具有一定經濟結構和功能的有機整體。社會經濟系統規模龐大，從個人到國家政府和國際組織，構成了系統的組元，而且因為系統內部耦合度高，各組元之間無窮無盡的相互作用使得社會經濟系統成為一個有機的整體，具有較強的層次結構和功能結構，按照橫向和縱向可以劃分成許多相對獨立的子系統。社會經濟系統複雜性歸根結底是具有高度智慧型的人在經濟活動中起決定性的作用。在社會經濟活動中，無論是消費者、投資者、生產者、中介者，還是政府，都有自己主觀的決策。這些為數眾多的決策者，所獲得的信息具有不對稱性，對事物的認知度也有偏差，使得整個系統的運動變得十分複雜。
影響經濟系統複雜性的動力因素來源三個方面:系統內力、政策力和隨機力。系統內力是由經濟活動規律和經濟系統結構決定;政策力是由人為施加並控制，巨觀經濟系統包括政府的財政、金融等政策調控及行政法規的制定;隨機力是指外在的不可控制力，尤其指環境對經濟系統的影響。經濟系統本質上是非線性的，經濟系統的行為大多是動態的、不穩定的穩定、平衡只是暫時的現象。目前在西方經濟學中主流仍是一般均衡理論，其本質建立在一種靜態線性的方法之上。這一理論框架較好地解決了系統在均衡附近的演化行為問題，並形成了公理化、形式化的嚴格邏輯體系。但是它無法描述和解釋系統達到均衡以及遠離均衡的複雜非平衡動態過程，如1997年的亞洲金融危機。近半個世紀以來世界經濟發生了巨大變化，在市場化全球化和信息化h}速發展的社會中，經濟環境變化的廣泛性、快速性、不確定性等日益明顯。依賴於傳統科學範式基礎上的預測思想和假定已經越來越不能圓滿地解釋或解決當今管理者們所遇到的許多複雜的經濟現象或問題。大量的現實都迫切要求新的理論來解釋和說明這種非均衡演化的經濟現象。
影響因素
人的因素
社會經濟系統與物理系統的根本區別是社會經濟系統中存在決策環節，人的主觀意識對該系統具有極大的影響。
社會因素指標
人口的數量和質量、人口的各種構成、出生率、死亡率、就業人數、文化普及率、文盲率、醫療設備情況、臨床總數、離婚率、犯罪率等。
經濟因素指標
社會總產值、工農業總產值、國民收入、各部門的產值、產品、財政收入與支出、利稅總額、工資總額、投資情況、固定資產、流動資金、外匯收支、價格體系及其增長指數、工資增長指數等。
自然環境因素指標
氣溫、水、土、油氣資源、地貌、地質情況、河流、山路、高原、平原分布及其特點、空氣污染、水質污染、噪聲污染、森林植被面積、公共綠化用地面積等。
科學技術因素指標
科研機構及高等院校、中等專業學校情況、智力投資、科研經費、科技人員總數及其構成、科技成果數、技術改造項目數、技術引進項目數、技術革新項目數等。
存在的問題
首先，社會經濟系統是一個高維系統。具有諸多變數和參數，對其進行實際計算和分析，是難以做到的。因此需要一個好的理論或模型將實際的經濟系統投影到恰當的低維子空間上去，能夠準確反映所討論問題的本質特徵。能否在動態演化的經濟系統中找到正確的運行規律，這巨大的挑戰。
其次，經濟系統具有複雜的層次結構和不同的利益主體。各層次之間的經濟利益通常並不一致，經濟系統複雜性研究應將層次間的利益協調列為研究對象，因市場中的不同主體的利益協調遠非一般均衡理論所能為。目前僅依靠幾個非線形方程來解釋複雜經濟現象是不夠的，需要考慮動態過程，還需要套用其他科學的理論與方法綜合分析與研究。正如錢學森教授針對‘開放的複雜巨系統，研究提出的“從定性到定量的綜合集成研討廳體系”的構想。
另外，經濟系統中信息是不完備與不確定的。經濟系統由其複雜性及外界環境之影響，時刻存在各種隨機的和不確定的因素。完全掌握系統的全部信息是不可能，但動態分析是要求有大量準確的經濟數據加以支持，這均增加了研究難度。而且就目前我國情況來說，不管是巨觀的國民經濟數據還是微觀的企業經濟數據，都缺乏長期的、連續的、保持一致的統計。
解決複雜性研究所面臨的諸多問題需要不同領域的科學家共同參與，從各自的領域出發，探討複雜性，相互啟發和補充，然後進行綜合和提升，尋找複雜性的共同特徵，不斷地在具體套用中得到驗證和完善，這樣才能達到有所創新和發展。
研究思路與方法
引入現代系統科學的新思路
許多自然科學家已經在反思以前經典方法的局限性和不足，努力用系統科學的新思路重新審視有關的理論與方法。在這種情況下，把自然科學中已經陳舊的方法簡單地搬到社會科學來，實在是不可取的。前面列出的四個基本區別是值得試圖用系統方法研究社會經濟系統的人士注意的。
全面吸取各學科的最新成果
“它山之石，可以攻玉”。在現代科學的發展中，各學科都在迅速發展，互相啟發、互相推動的事例不勝枚舉。這些事例都對近代科學過分強調分科、“只見樹木，不見樹林”的傾向給予了否定。20世紀下半葉，隨著人們眼界的不斷擴大，許多學科的基本理論和觀念都發生著深刻的變革。先是相對論和量子力學動搖了物理學的基石，隨後是天文學(宇宙學)和生物學理論的變化。有的人把這些變化看作是個別學科的專門議題，似乎不值得大家關注。事實上，人類文化是一個整體，人類對於客觀世界各方面的認識是相通的、互相影響的，而對於各種各樣的複雜系統的理解與認識，則是其中的一個重要方面，在這個意義上，方法論上的交流與借鑑是非常有益的。
充分利用計算機模擬的手段
由於社會經濟系統的複雜程度高，以前總認為對於這樣的系統無法做實驗，無法在實驗室條件下進行研究。現代電子計算機的出現和普及改變了這種狀況。今天，用計算機建模研究社會經濟系統的工作已經普遍展開，不但有了比較系統的方法，而且有了一些方便使用的、專門用於研究社會經濟系統的軟體平台，供研究者使用。這些平台把上述各種理念用軟體加以實現，並且設定了相對來說比較容易使用的用戶接口，比較方便非計算機專業的其他領域研究者使用。如swarm,，tng lab， repast,，ascape等。
