公司前身是黑龍江省牡丹江市蜜蜂原種場，始建於1977年，當時為事業單位企業化管理，保存和繁育從前蘇聯引進的高加索蜂和烏克蘭蜂原種。為我國的養蜂育種、科學研究和養蜂生產作出了積極的貢獻。歷年來累計為全國各地培育推廣種蜂王三萬餘只。1999年，根據牡體改<1999>5號檔案，整體改制職工買斷的方式改為股份制企業，就是現在的牡丹江市小蜜蜂生物工程有限責任公司。
公司位於牡丹江市愛民區西山，301國道南側，201國道和301國道在附近交匯，平常乘車8分鐘就能到市中心廣場及火車站貨物處，交通十分方便。公司下設三個分公司：蜂業公司、飲品公司和長春公司。占地面積4萬平方米，建築面積3300平方米，現有資產1000餘萬元。現有五個生產車間，兩個實驗室，兩個化驗室。有專業技術人員20名，技工30餘名，技術力量雄厚。公司顧問高級農藝師宮之瑞同志，是牡丹江市蜂業學科帶頭人。
牡丹江地區森林覆蓋達68%，椴樹蜜源十分豐富。公司位置又處於牡丹江的礦泉水帶上，因而天然蜂產品、天然礦泉水兩大資源優勢得天獨厚。如今，公司已開發生產了牡峰和升華牌系列蜂產品、小蜜蜂系列碳酸飲料和礦泉水共40餘種。多年來，被評為先進企業、市文明單位標兵、食品衛生最佳單位等多項榮譽。小蜜蜂礦泉水被黑龍江省衛生廳授予食品衛生監督量化分級管理A級榮譽。2003年，市政府授予小蜜蜂公司為牡丹江市綠色食品龍頭企業稱號。
公司非常重視養蜂生產基地建設。多年來，每年都舉辦全市養蜂技術培訓班，並派技術人員到現場指導。在龍頭企業小蜜蜂公司的牽動下，全市蜂業健康穩步發展，現已形成蜂群6.8萬群的綠色蜂產品生產基地。公司充分利用森林蜜源無污染、無公害的生態環境優勢，逐步建立有機蜂產品基地，使小蜜蜂為人類健康做出更大的貢獻。
多年來，公司不斷改進和提高蜂產品的質量，產品嚴格執行國家標準。現已開發出蜂蜜、蜂王漿、蜂膠、蜂花粉、種蜂王五大系列30餘種產品，深受用戶青睞。小蜜蜂公司蜂產品於1995年第二屆農業博覽會（北京）獲金獎，於1999年中國國際農業博覽會上獲名牌產品榮譽。2004年哈洽會上，小蜜蜂公司的展銷產品獲暢銷產品榮譽。小蜜蜂公司是中國養蜂學會和中國蜂產品協會的成員。小蜜蜂以其卓越的產品和誠信的經營，所屬商店2002年被中國蜂產品協會首批頒發全國蜂產品行業誠信商店榮譽。
