滯留票產生的原因
一是部分納稅人受利益驅動為隱匿進銷痕跡，採取購進商品貨物和銷售商品貨物都不入帳的手段偷逃稅款。因此，取得的進項專用發票不進行認證抵扣，形成滯留票。
二是部分企業採購人員取得的進項專用發票不慎丟矢，未向財務等有關部門報告，致使進項發票超期不認證，形成滯留票。
三是有些納稅人由於支付不起貨款，銷貨方商品貨物已發出因此開具專用發票，但購貨方不能及時付款，銷貨方就始終壓著發票不給，因超期不認證形成滯留票。
四是有些納稅人開具的專用發票，由於開具錯誤，購貨方因此退票。銷貨方首先開具一張與原發票內容一致的紅字專用發票沖銷，然後再開具一張正確的專用發票給購貨方。最初開具的錯誤發票雖然被紅字發票沖銷，然而這張專用發票超過3個月不能認證，形成滯留票
如何避免出現滯留票
1、一般納稅人只要取得增值稅專用發票，在180天內都必須認證抵扣，經核實不屬於進項抵扣範圍的，一律做進項轉出處理。從而，確保增值稅專用發票存根聯與抵扣聯數據信息比對一致，消除滯留票。
2、一般納稅人之間的經濟往來購銷業務都應當開具增值稅專用發票，不應當開具普通發票，因為，在普通發票未納入防偽稅控系統之前不能比對出滯留票數據信息。目前，由於購銷往來業務開具普通發票而造成的滯留票問題一定存在，這方面的信息資料無法查找，勢必給不法納稅人造成可乘之機。
3、已被紅字沖銷的專用發票，在提取滯留票信息資料時，應修改程式將這部分滯留票信息篩選出去。
如何處理滯留票
一是稅務機關對銷貨方協查取證缺乏統一的要求和規範。很多企業特別是商業企業沒有很好地執行現金管理制度，存在大量的現金交易，且大部分銷售方沒有保存購貨方簽章的交易憑證，一旦發生購貨方有賬外經營行為且拒不承認的情形，銷貨方很難為稅務機關提供非常直接的交易證明，給稅務機關的查證工作帶來很大困難。因此稅務機關的協查工作只停留在證明被調查的一般納稅人開具的專用發票已做收入並完成納稅申報的層面上，很難再作進一步的調查取證。這種協查不僅沒有實際意義且增加了工作量。所以應儘快統一規範協查取證的具體要求，集中精力核查確有疑問的滯留票，提高協查工作效率。
二是納稅人存在認識上的偏差。在核查中我們發現，部分滯留髮票屬於納稅人購進固定資產、外購貨物用於在建工程和集體福利等不得抵扣的非應稅項目取得的增值稅專用發票，企業財務人員誤認為不能抵扣的專用發票不用認證，直接記賬處理，導致大量存根聯滯留。因此，我們在今後的工作中應進一步加大稅法宣傳和納稅輔導力度，並嚴格按照《征管法》和《增值稅專用發票管理辦法的規定》，對違規企業進行處罰。
三是銷售方虛開專用發票，購買方接受虛開的專用發票和購、銷不入賬，進行賬外經營。應從購、銷關係人手判斷滯留票是否為虛開。受託方稅務機關在對銷售方進行協查取證時，要注重對應付賬款、預收賬款及收取款項原始憑證的檢查，從中獲取銷售方的客戶資料，向會計、業務員了解專用發票傳遞給購貨方的具體途徑以及貨物的運輸方式，將這些情況與購貨方信息進行比對，從而確定滯留票的開具方與取得方是否存在真實的購銷關係，判斷銷售方是否虛開滯留票。由於證明購銷雙方不存在真實購銷關係的直接證據較少，而銷售方一旦意識到被懷疑為別人虛開專用發票，就會偽造與對方有購銷關係的賬、證等證據，因此受託方稅務機關對有疑問的滯留票迅速取得賬、證等直接證據及詢問筆錄等間接證據非常關鍵，同時還要統一規範協查取證要求。
四是工業企業和商業企業的專用發票滯留原因各有特點，銷售方與購買方存在的問題也各不相同。工業企業取得的專用發票滯留原因大部分為產品的重量、質量、價格等出現變化，銷售方收回開具的專用發票抵扣聯和發票聯後，開具負數銷項發票沖減銷售收入後按核實後的金額重新開具專用發票，這樣就造成了原開具的專用發票因未認證而滯留。而商業企業大部分滯留票因購貨方未認證而造成，存在購貨方購、銷均不入賬且隱瞞銷售收入問題。因此在實際工作中，將協查取證資料與納稅人實際經營情況相核對，以確定滯留的專用發票是否已入賬。某些滯留票的銷售方出於保住銷售渠道等原因在協助稅務機關取證的同時將稅務機關協查情況通知購貨方，因此委託方稅務機關要及時將收到的滯留票取證資料與購貨方經營的商品進行核對，將滯留票銷售金額與當期購貨方申報的銷售收入核對。對於滯留票銷售金額大於當期申報的銷售收入且沒有庫存或庫存金額較小的，可初步判定該滯留票所列商品沒有入賬。承德市國稅局制定了相應的加強企業發票管理的制度和措施，以減少滯留髮票問題的發生。例如對於爭議較突出的成品油及菸草批發環節購銷雙方是否有實際交易問題，因下遊行業的“體外循環”現象難以查證，該局規定將購貨方提供的購貨證明作為銷貨方開具增值稅專用發票的附列資料之一，購貨證明由購貨單位開具，內容包括購貨人名稱、購貨數量、購貨金額等並加蓋購貨單位印章，由銷貨方留存備查，同時作為對購貨方開展以進控銷納稅評估的重要信息來源之一。
五是一些商業企業為躲避稅務稅務機關的嚴厲查處。改變賬外經營方式，即購進貨物時不再取得專用發票而只取得普通發票或根本不要發票，需要時再換取專用發票進行抵扣。因此稅務機關要從源頭抓起，嚴格落實納稅評估和稅收管理員制度。稅收管理員要經常下戶走訪，嚴格對商業企業一般納稅人的資格審批，多方位掌握納稅人生產經營動態，深入開展納稅評估。同時加強稅務人員業務培訓。進一步明確崗責體系，落實責任追究制度，不斷提高稅務人員的責任心和業務素質。
