溫州醫科大學藥學院設立藥學系、中藥學系、製藥工程系、分析測試中心、藥學實驗中心和執業藥師培訓與繼續教育中心。現招收藥學專業、中藥學專業、製藥工程專業本科生，藥理學和中藥學兩個專業碩士生和藥學專升本、藥學自考生。
學院現有教師86人，其中高級職稱31位；博士22位，碩士47位；博士生導師3人，碩士生導師30人。擁有“長江學者”特聘教授1人、教育部新世紀優秀人才1人、“新世紀百千萬人才工程”國家級人選1人、國家“千人計畫”入選1人、“錢江學者”1人、浙江省特聘教授1人、浙江省海外特聘專家1人、國家教學指導委員會藥學專業分委員會委員1人、浙江省教學指導委員會委員2人、浙江省“千人計畫”2人、浙江省“151”、溫州市“551”各層次人選、省優秀博士後、中青年學科帶頭人、浙江省衛生高層次創新人才等20人。近幾年我們大力引進高素質師資，重視青年教師培養，常年聘請國內外藥學知名專家組成專家諮詢委員會，精心培養在職教學和科研骨幹教師，已初步形成一支結構合理、水平較高的人才隊伍。
學院始終立足“以教學為本”,取得豐碩成果：2010年藥學專業被評為國家特色專業；1門課程被評為國家精品課程，4門課程被列為浙江省精品課程；浙江省教學成果一等獎1項、浙江省教學團隊1個；浙江省教學名師2名、浙江省教壇新秀2名；浙江省教學示範中心2個；浙江省高校重點建設教材3部。指導學生先後獲得大學生“挑戰杯”比賽國家二等獎、浙江省特等獎、一等獎等各項榮譽。
學院擁有核磁共振（600MHz）、液-質聯用、氣-質聯用、高壓液相色譜儀、氣相色譜儀、中壓製備色譜儀、紫外可見分光光度計、HPLC電化學檢測器等20多種大型的科研教學設備和各種科研教學儀器，總值1500多萬。
學院目前已與美國路易斯威爾大學、美國哈佛大學、加拿大薩斯卡切溫大學、美國杜克大學醫學中心、英國諾華醫藥集團、中科院成都生物所和有機所、同濟醫科大學等建立了教學、科研合作關係。近年來，承擔了包括國家新藥創製重大科技專項、 863計畫項目、973計畫項目、國家自然科學基金項目、國家“十一五”科技支撐計畫、浙江省自然科學基金傑青團隊項目等國家、省部級各類課題達72項；獲得國家技術發明二等獎、國家科技進步二等獎、中華醫學科技一等獎等，在國內外專業刊物發表論文約350篇，其中，被SCI收錄100餘篇；授權發明專利10餘項，出版教材、專著20餘部；學院在天然藥物研究、創傷修復、臨床藥理、神經藥理研究、農藥解毒研究方面形成了穩定的研究方向。
學院實習基地建設日趨完善，目前已在江蘇恆瑞醫藥股份有限公司、揚子江藥業集團公司、浙江醫藥股份有限公司新昌製藥廠等國內知名企業及溫州市藥品檢驗所等40餘個機構成立了實習基地，在天然藥物資源豐富的泰順烏岩嶺國家自然保護區、溫州龍灣潭國家森林公園等6個區域成立了野外見習基地。
隨著國家醫藥分開，臨床藥物行業執業藥師準入制等有關政策、法規的實施，為藥學院提供了廣闊的發展空間，藥學及其相關人才的緊缺為畢業生提供了良好的就業前景。
通訊地址：浙江溫州茶山高教園區 溫州醫學院藥學院
